Wissenschaftliche:r Mitarbeiter:in (m/w/d) im Bereich Molekulare Diagnostik

Wissenschaftliche:r Mitarbeiter:in (m/w/d) im Bereich Molekulare Diagnostik, Schwerpunkt translationale Proteomik (LC/MS)

Reference number:2024-0221**

• Frankfurt
• Full-time
• DKTK Partnerstandort Frankfurt/Mainz – Molekulare Diagnostik, Schwerpunkt translationale Proteomik (LC/MS)

"Research for a life without cancer" is our mission at the German Cancer Research Center. We investigate how cancer develops, identify cancer risk factors and look for new cancer prevention strategies. We develop new methods with which tumors can be diagnosed more precisely and cancer patients can be treated more successfully. Every contribution counts – whether in research, administration or infrastructure. This is what makes our daily work so meaningful and exciting.

Gemeinsam mit universitären Partnern an sieben renommierten Partnerstandorten haben wir das Deutsche Konsortium für Translationale Krebsforschung (DKFZ) gegründet.
Am DKTK Partnerstandort Frankfurt / Mainz (Arbeitsort Universitätsklinikum Frankfurt) bieten wir ab sofort eine Stelle als

Your Tasks

Die Tätigkeit umfasst die wissenschaftliche Planung und Durchführung von komplexen Forschungsprojekten der translationalen Proteomik am DKTK Standort Frankfurt / Mainz. Der Fokus liegt auf der Analyse von Blutplasma- und Gewebeproben umfangreicher Patientenkohorten verschiedener Krebsarten, insbesondere im Kontext Lymphome und Leukämien. Dies beinhaltet Strategien zur Probenvorbereitung auf dem aktuellen Stand der Forschung (z. B. Proteograph XT, Seer) und den Betrieb sowie die Wartung von LC/MS-Anlagen der neuesten Generation (z. B. Vanquish Neo / Orbitrap Astral, Thermo Fisher).

Im Detail umfasst dies folgende Aufgaben:

• Eigenverantwortliche Versuchs- und Projektplanung; projektspezifisch und für Methodenetablierung
• Durchführung und Auswertung von Experimenten unter Anwendung bereits etablierter analytischer Strategien und Etablierung / Implementierung neuer Verfahren nach dem aktuellem Stand der Forschung
• Umsetzung innovativer Strategien für die Identifizierung von Biomarkern, insbesondere aus Primärmaterial wie Blutplasma
• Interpretation der Ergebnisse, Verifizierung der aufgestellten Hypothesen
• Recherche der Fachliteratur
• Dokumentation von Forschungsergebnissen und ggf. Veröffentlichung in Fachzeitschriften
• Präsentation der Ergebnisse bei Vorträgen und Fachkongressen
• Anleitung und Beratung von technischem und wissenschaftlichem Personal

Your Profile

• Erfolgreich abgeschlossenes Studium im Fach Biologie, Chemie, Biochemie, Pharmazie oder vergleichbar, mit Schwerpunkt Bioanalytik
• Promotion auf dem Gebiet der LC/MS-basierten Proteomik
• Befähigung zum selbstständigen wissenschaftlichen Arbeiten
• Mehrjährige Erfahrung und Expertise in LC/MS-basierter Proteomik bzw. Proteinanalytik
• Theoretische und praktische Kenntnisse gängiger Arbeitsabläufe der Proteomik
• Probenvorbereitung (z. B. SP3-basiert und/oder mit Automatisierung)
• Durchführung von LC/MS-Analysen (DDA, DIA)
• Verarbeitung und Interpretation von Rohdaten und Resultaten (z. B. MaxQuant, Proteome Discoverer, DIA-NN, MS Office, R)
• Analyse-Strategien zur Identifizierung / Quantifizierung von Proteinen und zur Charakterisierung von post-translationalen Proteinmodifikationen (z. B. Phosphorylierung, Glykosilierung, Ubiquitinierung)
• Mehrjährige Erfahrung im Umgang mit LC/MS-Systemen, der Methodenetablierung sowie mit grundlegenden Wartungsarbeiten (z. B. Orbitrap-Massenspektrometrie)
• Sehr gute Deutsch- und Englischkenntnisse
• Hervorragende Kommunikationsfähigkeiten
• Sehr gute EDV-Kenntnisse