Systems Engineer / System Administrator (m/f/d)

Das European Galaxy-Team ist eine Kerngruppe innerhalb des weltweiten Galaxy-Projekts. Wir sind eine offene, leidenschaftliche und unterstützende Forschungsgruppe an der Universität Freiburg, die stark in viele Softwareprojekte der globalen Galaxy-Community involviert ist, einschließlich der Leitung der Bioconda- und BioContainers-Projekte sowie der Entwicklung modernster computergestützter Workflows für Genomik, Metagenomik, Transkriptomik und Pharmakogenomik-Daten. Die Abteilung für Informatik eröffnet eine Stelle für einen Systems Engineer / System Administrator (m/w/d), der Entwicklungs- und Betriebsfunktionen innerhalb einer der beliebtesten und etabliertesten Datenanalyseplattformen für die Lebenswissenschaften verbindet.

Sie sind verantwortlich für die Implementierung, Unterstützung und Dokumentation mehrerer großangelegter Anwendungssysteme. Diese Rolle umfasst unter anderem die Installation, Modifikation, Tests und Upgrades von Anwendungen, Betriebssystemen, Dateisystemen, Hardware und Cloud-Umgebungen. Die Arbeit wird zusammen mit anderen Administratoren und dem Rechenzentrum der Universität Freiburg durchgeführt.

Ihre Möglichkeiten:

• Entwicklung und Wartung des Galaxy-Servers und der zugehörigen Infrastruktur (z.B. PostgreSQL, RabbitMQ, Celery, TIG-Stack, CVMFS, Jenkins, HTCondor, OpenStack usw.), einschließlich TIaaS (Training Infrastructure as a Service), Pulsar-Netzwerke und dem Beacon-Service.
• Sicherstellung der nahtlosen Integration neuer Funktionen und Updates in das bestehende System und die Infrastruktur.
• Zusammenarbeit mit dem Team von Administratoren zur Gestaltung und Verbesserung von Software- und Bereitstellungspipelines.
• Konzeption und Implementierung von Aktualisierungsverfahren und Softwareintegrationen im laufenden System.
• Implementierung und Aufrechterhaltung bester Sicherheitspraktiken gemäß unseren Informationssicherheitspolitiken und Branchenstandards (ISO 27001).
• Regelmäßige Überprüfung und Verbesserung der Sicherheitsmaßnahmen zum Schutz von Daten und Infrastruktur.
• Aktuelle Trends und aufkommende Technologien verfolgen, einschließlich Virtualisierung, Infrastrukturtechnologien, Automatisierung, Konfigurationsmanagement, Infrastrukturbereitstellung und CI/CD-Pipelines.
• Proaktive Identifizierung von Möglichkeiten zur Verbesserung der Galaxy Europe-Instanz und Festlegung allgemeiner Bereitstellungsrichtlinien für andere Galaxy-Instanzen.
• Integration infrastruktureller Komponenten wie verschiedene Speichersysteme und spezielle Berechnungs-Knoten mit Beschleunigern wie GPUs.
• Gemeinschaftsunterstützung für andere Galaxy-Administratoren und -Benutzer durch Behebung technischer Probleme und Wissensaustausch.
• Entwicklung umfassender Dokumentations- und Schulungsmaterialien für Automatisierungs-Workflows und administrative Aufgaben zur Förderung des Lernens und der Effizienz.
• Durchführung von Workshops und Live-Schulungen für Administratoren, um ihnen die Fähigkeiten und Kenntnisse zu vermitteln, um Galaxy-Dienste effektiv zu verwalten und zu betreiben.
• Diagnose und Behebung von Problemen in Linux-Systemen und HPC-Infrastrukturen sowie Verwaltung von Speicherlösungen wie NFS zur Gewährleistung von hoher Verfügbarkeit, Leistung und Zuverlässigkeit.
• Analyse und Verbesserung der Systemleistung durch Identifizierung und Behebung von Engpässen und Ineffizienzen.

Wir suchen einen engagierten und motivierten Teamplayer mit starken Kommunikationsfähigkeiten und guten Englischkenntnissen. Der erfolgreiche Bewerber wird ein Experte für Linux-Systemadministration mit fundierten Kenntnissen in Python, Git und SQL-Datenbanken sein. Der ideale Kandidat ist ein analytischer Denker, Problemlöser und zuverlässig, mit einem starken Wunsch zu lernen und mit dem Team zusammenzuarbeiten.

Erforderliche Fähigkeiten und Qualifikationen:

• Experte für Linux-Systemadministration (5+ Jahre Erfahrung) mit starker Beherrschung von Python, Shell-Skripting, Git und Kommandozeilenwerkzeugen.
• Experte in der Fehlersuche bei komplexen Software- und Hardwareproblemen und Durchführung von Ursachenanalysen.
• Erfahrung in der Netzwerktechnik, einschließlich TCP/IP, DNS, Firewalls und Routing.
• Erfahrung in der Konfiguration von Continuous Integration und Continuous Deployment (CI/CD)-Systemen und -Werkzeugen wie Jenkins.
• Beherrschung von Konfigurationsmanagement-Tools wie Ansible und Bereitstellungstools wie Terraform.
• Beherrschung von Hochleistungsrechnerumgebungen (HPC) und Netzwerkdateisystemen (NFS).
• Fähigkeit zur Zusammenarbeit in einem Teamumfeld und zur Interaktion mit Community-Mitgliedern.
• Starke Dokumentationsfähigkeiten, mit der Fähigkeit, umfassende Leitfäden und Handbücher zu erstellen.
• Starke analytische und problemlösende Fähigkeiten, mit der Fähigkeit, kritisch zu denken und innovative Lösungen zu entwickeln.
• Fähigkeit, mehrere Aufgaben zu verwalten und effektiv in einem schnelllebigen Umfeld zu priorisieren.
• Bachelor- oder Masterabschluss in Informatik oder gleichwertiger Qualifikation.

Zusätzliche vorteilhafte Fähigkeiten:

• Beherrschung von Virtualisierungstechnologien wie KVM.
• Erfahrung mit Cloud-Plattformen wie OpenStack und AWS sowie hybriden Infrastrukturumgebungen.
• Erfahrung im Aufbau und Management von containerisierten Anwendungen mit Docker, Singularity oder Kubernetes.

Unser Institut, das sich in einer Region befindet, die Deutschland, Frankreich und die Schweiz verbindet, bietet ein internationales Forschungsumfeld mit hervorragenden Infrastruktureinrichtungen und einer positiven Arbeitsatmosphäre, die großen Wert auf die Work-Life-Balance legt.

Das Gehalt richtet sich nach Ihren Qualifikationen und beruflichen Erfahrungen gemäß dem deutschen TV-L-Entgeltsystem.

Ein Team von Administratoren und Entwicklern, mit dem Sie zusammenarbeiten können.

Professionelle Schulungs- und Entwicklungsmöglichkeiten.

Herausfordernde Aufgaben in europaweit verteilten Projekten in einem modernen Arbeitsumfeld.

Flexible Arbeitszeiten und vertrauensbasierte Arbeitszeitgestaltung.

30 Tage Urlaub pro Jahr.

Günstige öffentliche Verkehrsmittel im lokalen Bereich.

Familienfreundliche Angebote (angegliederte Kindertagesstätte am Institut, Familienservice).

Wir schätzen und fördern Vielfalt, Inklusion und Chancengleichheit und begrüßen Bewerbungen aus allen Hintergründen. Wir begrüßen insbesondere Bewerbungen von schwerbehinderten Menschen. Wir möchten auch den Anteil von Frauen in Bereichen erhöhen, in denen sie unterrepräsentiert sind, und ermutigen daher ausdrücklich Frauen zur Bewerbung.

Diese Position ist sofort verfügbar und für zwei Jahre finanziert, mit der Möglichkeit einer Verlängerung.

Weitere Informationen über das European Galaxy-Projekt finden Sie auf unserer Website.