Forward-Deployed Scientist – Computational & Medicinal Chemistry

Über Apheris

Bei Apheris betreiben wir föderierte Datennetzwerke in den Lebenswissenschaften, um das Datenengpassproblem beim Training hochleistungsfähiger ML-Modelle zu lösen. Öffentlich verfügbare molekulare Datensätze sind unzureichend, um qualitativ hochwertige ML-Modelle zu trainieren, die den Anforderungen der Branche entsprechen. Wir adressieren dies, indem wir Netzwerke hosten, in denen Pharmaorganisationen gemeinsam qualitativ hochwertigere Modelle auf ihren kombinierten Daten trainieren. Das Apheris-Produkt ist eine Reihe von Anwendungen zur Arzneimittelentdeckung, die mit den proprietären Daten der Netzwerkteilnehmer angereichert sind. Unsere föderierte Computerinfrastruktur mit integrierten Governance- und Datenschutzkontrollen stellt sicher, dass das Daten-IP und das Eigentum immer bei den Datenverwaltern bleiben. Derzeit hosten wir zwei Flaggschiff-Netzwerke: das AISB-Netzwerk, das sich auf Protein-Co-Folding und Bindungsaffinitätsvorhersage konzentriert, und das ADMET-Netzwerk, das sich auf die Vorhersage von Eigenschaften kleiner Moleküle konzentriert. Darüber hinaus haben wir gerade unsere Co-Folding-Anwendung gestartet, die es Pharma-Teams ermöglicht, Modelle wie OpenFold3 und Boltz-2 direkt in ihren eigenen Umgebungen einzusetzen - mit weiteren Funktionen, die folgen werden.

Über die Rolle

Wir suchen einen Experten für strukturbasierte Arzneimittelentdeckung, der die Einführung der Co-Folding-Anwendung in führenden Pharma-F&E-Teams vorantreibt. Sie werden selbst ein Power-User der Apheris-Produkte sein und direkt mit computergestützten und medizinischen Chemikern zusammenarbeiten, um ihnen zu helfen, unsere Modelle in realen Programmen zu testen, zu benchmarken und anzuwenden, damit das Produkt effektiv und produktiv als Teil ihrer täglichen Arbeit genutzt wird. Sie werden eng mit Pharma-Nutzern, internen ML-Wissenschaftlern, dem AI Applications Team und dem Produktteam zusammenarbeiten, um die Co-Folding-Anwendung in bestehende F&E-Workflows zu integrieren. Wenn Sie sehen möchten, wie KI in der Arzneimittelentdeckung eingesetzt wird, nicht nur bereitgestellt, dann ist diese Rolle genau das Richtige für Sie.

Was Sie tun werden

• Als forward-deployed scientist agieren, der sich auf die Förderung der Akzeptanz und messbare Auswirkungen konzentriert
• Praktisch mit Pharma-Nutzern der Co-Folding-Anwendung arbeiten, Benchmarking, Tests und Anwendungen in realen Entdeckungsprogrammen leiten
• Beziehungen zu den relevanten Stakeholdern in der Pharma-F&E aufbauen, von computergestützten und medizinischen Chemikern bis hin zu Programmleitern
• Einblicke aus dem Feld an das Produkt- und AI Applications Team zurückmelden, um Plattformverbesserungen zu gestalten
• Persönliche und Remote-Workshops durchführen, um Nutzer zu schulen und Best Practices mit Forschungsteams zu teilen
• Fallstudien entwickeln, die Auswirkungen demonstrieren und über Projekte hinweg repliziert werden können
• Wissenschaftliche Inhalte wie Beispieldatensätze, Nutzungshinweise und Evaluierungsprotokolle beitragen

Was wir von Ihnen erwarten

• Doktortitel in computergestützter Chemie, medizinischer Chemie oder einem verwandten Bereich
• Praktische Erfahrung als Power-User in struktur-basierten Workflows - Co-Folding, Docking, Protein-Ligand-Modellierung in realen Arzneimittelentdeckungsprogrammen
• Vertrautheit mit molekularen Visualisierungs- und Cheminformatik-Tools (z.B. PyMOL, RDKit)
• Glaubwürdigkeit sowohl bei computergestützten als auch bei medizinischen Chemikern und die Fähigkeit, die Bedürfnisse jeder Gruppe zu verbinden
• Grundlegende Skriptfähigkeiten, um Notebooks und Analysen auszuführen und zu erklären
• Komfortables Arbeiten ohne vollständige Spezifikationen - Verantwortung übernehmen, Fortschritte unter Unsicherheit erzielen
• Klare Kommunikation mit technischen und nicht-technischen Zielgruppen

Schön zu haben

• Erfahrung in einer kundenorientierten Rolle (z.B. CRO, Anwendungsspezialist)
• Vertrautheit mit OpenFold, Boltz oder anderen Struktur-/Affinitätsvorhersagetools
• Erfahrung in oder neben Unternehmens-IT/Datenumgebungen, die typisch für große Pharmaunternehmen sind
• Erfahrung mit zeitkritischen oder risikobehafteten Projekten

Was wir Ihnen bieten

• Wettbewerbsfähige Vergütung in der Branche, einschließlich virtueller Aktienoptionen in der Frühphase
• Remote-first-Arbeit – arbeiten Sie dort, wo Sie am besten arbeiten, sei es von zu Hause oder von einem Co-Working-Space in Ihrer Nähe
• Großes Leistungspaket, einschließlich eines Wohlfühlbudgets, psychischer Gesundheitsleistungen, eines Budgets für das Arbeiten von zu Hause, eines Co-Working-Stipendiums und eines Budgets für Lernen und Entwicklung
• Regelmäßige Team-Mittagessen und soziale Veranstaltungen
• Großzügiger Urlaubsanspruch
• Bürotage in unserem Berliner Hauptsitz oder an einem anderen europäischen Standort (3x im Jahr)
• Ein lustiges, vielfältiges Team von mission-driven Individuen mit dem Antrieb, KI und ML zum Guten zu nutzen
• Viel Raum für persönliches und berufliches Wachstum und die Möglichkeit, Ihre eigene Rolle zu gestalten