Im Wissenschaftliche/-r Mitarbeiter/-in -Bioinformatiker/-in im Bereich Molekularpathologie- (w/m/d)
Einsatzort: Institut für Pathologie -Bereich Molekularpathologie/Next Generation Sequencing-
Arbeitszeit: 80% der vollen tariflich vereinbarten Arbeitszeit (zzt. 38,5 Std./W.)
Befristung: unbefristet
Einstieg: 01.12.2026
Vergütung: EG 13 (TV-L)
Aufgaben:
- Bioinformatische Analysen (primär Hochdurchsatz-Sequenzier-/NGS-Daten) und Qualitätskontrolle innerhalb der Krankenversorgung
- Kontinuierliche Anpassung und Infrastrukturmanagement nach Qualitätsmanagement- und GDPR-Vorgaben innerhalb der Krankenversorgung
- Entwicklung und Wartung UNIX-basierter Recheninfrastrukturen
- Entwicklung und Etablierung neuer bioinformatischer Analysemethoden und -pipelines zur Verbesserung der Krankenversorgung
- Fachliche Vertretung der Fachrichtung Bioinformatik innerhalb Molekularer Tumorboards (MTB)
- Unterstützung translationaler Forschung im NGS-Bereich innerhalb des Institutes für Pathologie
Profil:
- Masterabschluss (Molekular)Biologie/Biotechnologie oder vergleichbar mit ausgewiesener bioinformatischer, praktischer Expertise im Bereich der Verarbeitung von NGS-Daten im Krankenversorgungskontext der Molekularpathologie via Lebenslauf
- Vorwissen im Bereich Tumorgenetik
- Sicherer Umgang mit UNIX-basierten Systemen
- Kenntnisse mit bash, R, Python, snakemake und Nextflow
- Nachweisbare Erfahrungen in der Bearbeitung und Qualitätskontrolle NGS-basierter Sequenzdaten (Primär short read Sequenzierung)
- Erfahrung und sicherer Umgang in der Wartung RHEL- und Ubuntu-basierter HPC-Serversysteme
- Publikationsleistung im Bereich NGS-Bioinformatik
- Wünschenswert:
- Interesse und eine gute Übersicht über aktuelle und zukünftige (primär) NGS-basierten Sequenziertechniken und Analysetools
- Vorkenntnisse zu Arbeiten mit Illumina Dragen Software- und Sequenziersystemen, snakemake- oder Nextflow-basierten Pipelines
- Kenntnisse in gängigen Machine Learning-Toolsuites (scikit-learn, Keras, TensorFlow, PyTorch, XGBoost und weitere)
- Zusätzliche Programmiersprachenkenntnisse
- Gute Deutsch- und Englischkenntnisse (Level c1)
- Organisationskompetenz, eigenverantwortliches Arbeiten, engagierter Teamplayer mit lösungsorientierter Denk- und Arbeitsweise
Warum Sie sich für uns entscheiden sollten?
- 30 Tage Urlaub/Jahr bei Vollzeitbeschäftigung
- Mitarbeitende werben Mitarbeitende für verschiedene Berufsgruppen / Prämie von 3.000 Euro
- Überdurchschnittliche betriebliche Altersversorgung der VBL
- Fort- und Weiterbildungsmöglichkeiten
- Entspannter Arbeitsweg - vergünstigtes ÖPNV-Ticket oder Parkplatz sowie Möglichkeit der Teilnahme an der GoFlux App
- Familienfreundliche Unternehmenskultur
- Betriebskindergarten, Kinderland
- flexible Arbeitszeitmodelle sowie
- vielfältige Beratungs- und Unterstützungsangebote zur Vereinbarkeit von Beruf und Familie durch die Personalbetreuung
- Eine Onboarding-App für neue Mitarbeitende
- Fit und Gesund - von Gesundheitsförderung bis Hochschulsport – wir haben alles für Sie
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Wissenschaftliche/-r Mitarbeiter/-in -Bioinformatiker/-in im Bereich Molekularpathologie- (w/m/d) in Aachen Arbeitgeber: Arbeitsagentur
Unsere moderne Steuerkanzlei in Merseburg bietet Ihnen die Möglichkeit, Ihr Wissen und Talent in einem freundlichen und offenen Team einzubringen. Wir legen großen Wert auf ein angenehmes Betriebsklima, flexible Arbeitszeiten und vielfältige Weiterbildungsmöglichkeiten, um Ihre berufliche Entwicklung zu fördern. Bei uns sind Sie nicht nur ein Mitarbeiter, sondern ein geschätztes Mitglied, das aktiv zum Erfolg unserer Kanzlei beiträgt.
