Finde einen Job 
Finde eine Ausbildung 
Top Arbeitgeber 
Top Universitäten 
Für Unternehmen Auf einen Blick
- Aufgaben: Entwickle innovative Modelle zur Analyse von Wirts-Pathogen-Interaktionen.
- Arbeitgeber: Bernhard Nocht Institut für Tropenmedizin, führend in der tropischen Forschung.
- Mitarbeitervorteile: 30 Tage Urlaub, flexible Arbeitszeiten und Weiterbildungsmöglichkeiten.
- Warum dieser Job: Gestalte die Zukunft der Infektionsbiologie mit modernster Technologie.
- Gewünschte Qualifikationen: Masterabschluss in Informatik oder Bioinformatik, Programmierkenntnisse in Python oder R.
- Andere Informationen: Dynamisches Team mit Fokus auf Diversität und Chancengleichheit.
Das voraussichtliche Gehalt liegt zwischen 45000 - 63000 € pro Jahr.
Das Bernhard Nocht Institut für Tropenmedizin ist das größte Forschungsinstitut für Tropenmedizin in Deutschland und das nationale Referenzzentrum für tropische Krankheitserreger. Die Abteilung für Computational Infection Biology, geleitet von Thomas Otto, sucht einen hochmotivierten Doktoranden (in Datenwissenschaft, m/w/d) in Vollzeit. Unsere Gruppe entwickelt rechnergestützte Ansätze, um die Interaktionen zwischen Wirt und Erreger sowie deren Evolution zu verstehen, mit dem langfristigen Ziel, neue Strategien für therapeutische Interventionen zu identifizieren.
Dieses Promotionsprojekt wird großangelegte Einzelzell-RNA-Sequenzierungs- und räumliche Transkriptomik-Datensätze aus der Infektionsbiologie nutzen, um Modelle zu entwickeln, die zelluläre Reaktionen auf Infektionen über Gewebe und Bedingungen hinweg erfassen. Der Kandidat wird systematische Verzerrungen und biologische Störfaktoren in bestehenden Datensätzen untersuchen, rechnergestützte Strategien zur Korrektur oder Berücksichtigung dieser Verzerrungen entwickeln und prädiktive Modelle erstellen, die biologische Reaktionen auf in silico-Störungen wie genetische oder pharmakologische Interventionen simulieren.
Die Kernaufgaben dieser Position umfassen:
- Training, Erkundung und Modifikation von transformerbasierten Modellen
- Charakterisierung der Art, des Umfangs und der Auswirkungen systematischer Verzerrungen und Störvariablen sowie Verbesserung der Modelle zur Korrektur dieser Variablen
- Integration multimodaler Datenquellen im Kontext von Wirt-Erreger-Datensätzen
- Einrichtung einer prädiktiven Pipeline für Transferlernen und Arzneimittelzielentdeckung
- Anwendung von Modellen auf Pathogen- und immunologische Datensätze
- Bereitstellung von bioinformatischen Unterstützungen für andere BNITM-Gruppen
- Beitrag zu Lehr- und Ausbildungsaktivitäten innerhalb der Otto-Gruppe
- Beitrag zur Projektentwicklung und unabhängigen Forschungsinitiativen
Ihr Profil:
- Abgeschlossenes Masterstudium oder gleichwertig in Informatik, Bioinformatik oder verwandten Bereichen mit Interesse an Biologie
- Starke Programmierkenntnisse, insbesondere in Python oder R
- Fähigkeit, in einer Linux-Umgebung zu arbeiten
- Interesse an biologischen Fragestellungen und Krankheitsmechanismen
- Grundlegendes Verständnis der Möglichkeiten und Einschränkungen von LLMs und Transformermodellen
- Erfahrung mit Genomik oder Transkriptomik, Analyse von Next-Generation-Sequencing ist von Vorteil
- Expertise in KI/ML ist von Vorteil
- Erfahrung mit Job-Submission-Systemen/HPC ist von Vorteil
- Gute Englischkenntnisse (mündlich und schriftlich)
- Ausgezeichnete organisatorische Fähigkeiten und die Fähigkeit, Experimente unabhängig und flexibel zu planen und durchzuführen
- Starker Teamgeist und Kommunikationsfähigkeiten
- Kreatives Denken und starke Problemlösungsfähigkeiten
- Kenntnisse in gängiger Bürosoftware werden erwartet (z.B. Office, Adobe ist von Vorteil)
Was wir bieten:
- Eine interessante und herausfordernde Tätigkeit in einem kreativen, unterstützenden und hochmotivierten Team
- Ein attraktives, interdisziplinäres Forschungsumfeld mit modernster Ausstattung
- Möglichkeiten zur Realisierung unabhängiger Forschungsprojekte
- 30 Tage Urlaub pro Jahr
- Flexible und familienfreundliche Arbeitszeiten
- Kindergeldzuschuss
- Zuschuss für HVV-ProfiTicket als "Deutschlandticket" (Basis)
- Betriebliche Altersvorsorge
- Möglichkeiten zur Weiterbildung und Schulung
Die Vergütung erfolgt gemäß TV-AVH (Tarifvertrag des Hamburger Arbeitsrechtverbands) in Entgeltgruppe EG 13. Die Stelle soll im Frühjahr 2026 beginnen und ist zunächst auf 3 Jahre befristet. Wir unterstützen unsere Mitarbeiter bei der Vereinbarkeit von Beruf und Familie und fördern die berufliche Gleichstellung von Frauen, Männern und nicht-binären Personen. Wir setzen uns dafür ein, Frauen in ihrer wissenschaftlichen Karriere zu unterstützen, die Anzahl der Frauen in der Forschung zu erhöhen und Unterrepräsentation in allen Bereichen und Positionen zu verringern. Wir begrüßen ausdrücklich Bewerbungen von Menschen mit Behinderungen. Als Mitglied der Charta der Vielfalt, dem größten Netzwerk für Diversity-Management in Deutschland, setzen wir uns auch dafür ein, Vielfalt zu einem integralen Bestandteil unserer Instituts-kultur zu machen. Unser Ziel ist es, ein Arbeitsumfeld zu schaffen, das frei von Vorurteilen ist.
Bitte bewerben Sie sich bis zum 25.03.2026 vorzugsweise online mit den erforderlichen Unterlagen (Anschreiben, Lebenslauf, Hochschulzeugnisse und Ihre Masterprojektzusammenfassung/Softwareprojektzusammenfassung sowie Kontaktdaten von 2 Referenzen) über unser Online-Formular. Bei Fragen zum formalen Bewerbungsprozess oder zum Auswahlverfahren wenden Sie sich bitte an Frau Jeannette Meurer aus der Personalabteilung (meurer@bnitm.de). Für alle anderen Fragen kontaktieren Sie bitte Prof. Thomas Otto - thomas.otto@bnitm.de.
PhD Student (in data science, m/f/d) – full-time, EG 13 TV-AVH – Dpt. Computational Infection B[...] Arbeitgeber: Bernhard-Nocht-Institut für Tropenmedizin
Kontaktperson:
Bernhard-Nocht-Institut für Tropenmedizin HR Team
StudySmarter Bewerbungstipps 🤫
So bekommst du den Job: PhD Student (in data science, m/f/d) – full-time, EG 13 TV-AVH – Dpt. Computational Infection B[...]
✨Tipp Nummer 1
Mach dir eine Liste von Fragen, die du während des Interviews stellen möchtest. Das zeigt dein Interesse und hilft dir, mehr über das Team und die Projekte zu erfahren.
✨Tipp Nummer 2
Bereite dich darauf vor, deine bisherigen Projekte und Erfahrungen zu präsentieren. Zeig, wie deine Fähigkeiten in Python oder R direkt zur Stelle passen und wie du Herausforderungen kreativ gelöst hast.
✨Tipp Nummer 3
Netzwerke mit anderen in der Branche! Nutze LinkedIn oder lokale Meetups, um Kontakte zu knüpfen. Oft erfährt man so von Stellenangeboten, bevor sie offiziell ausgeschrieben werden.
✨Tipp Nummer 4
Bewirb dich direkt über unsere Website! Das macht es einfacher für uns, deine Bewerbung zu finden und zu bearbeiten. Und vergiss nicht, deine Leidenschaft für die Forschung und das Team zu zeigen!
Diese Fähigkeiten machen dich zur top Bewerber*in für die Stelle: PhD Student (in data science, m/f/d) – full-time, EG 13 TV-AVH – Dpt. Computational Infection B[...]
Tipps für deine Bewerbung 🫡
Mach deine Bewerbung persönlich!: Zeig uns, wer du bist! Dein Anschreiben sollte nicht nur deine Qualifikationen auflisten, sondern auch deine Motivation und Leidenschaft für das Projekt und die Forschung im Bereich der Infektionsbiologie widerspiegeln.
Struktur ist alles!: Achte darauf, dass dein Lebenslauf klar strukturiert und übersichtlich ist. Verwende Abschnitte für Ausbildung, Berufserfahrung und Fähigkeiten, damit wir schnell einen Überblick über deine Qualifikationen bekommen.
Referenzen sind wichtig!: Vergiss nicht, die Kontaktdaten von zwei Referenzen anzugeben. Diese sollten Personen sein, die deine Fähigkeiten und Erfahrungen gut kennen und bereit sind, positive Rückmeldungen über dich zu geben.
Bewirb dich online!: Wir empfehlen dir, deine Bewerbung direkt über unser Online-Formular einzureichen. So stellst du sicher, dass alle Unterlagen korrekt ankommen und du keine Fristen verpasst!
Wie du dich auf ein Vorstellungsgespräch bei Bernhard-Nocht-Institut für Tropenmedizin vorbereitest
✨Verstehe die Forschungsziele
Mach dich mit den spezifischen Forschungszielen des Instituts vertraut, insbesondere im Bereich der Computational Infection Biology. Zeige im Interview, dass du die Bedeutung von Host-Pathogen-Interaktionen verstehst und wie deine Fähigkeiten in Data Science dazu beitragen können.
✨Bereite praktische Beispiele vor
Sei bereit, konkrete Beispiele aus deiner bisherigen Arbeit oder deinem Studium zu nennen, die deine Programmierkenntnisse in Python oder R demonstrieren. Zeige, wie du bereits mit großen Datensätzen gearbeitet hast und welche Herausforderungen du dabei gemeistert hast.
✨Fragen stellen
Bereite einige durchdachte Fragen vor, die du dem Interviewer stellen kannst. Das zeigt dein Interesse an der Position und hilft dir, mehr über die Teamdynamik und die Projekte zu erfahren, an denen du arbeiten würdest.
✨Teamarbeit betonen
Hebe deine Teamfähigkeit und Kommunikationsfähigkeiten hervor. Da das Institut Wert auf Zusammenarbeit legt, ist es wichtig, dass du zeigst, wie du in einem interdisziplinären Team arbeiten kannst und bereit bist, Wissen zu teilen und zu lernen.