Auf einen Blick
- Aufgaben: Modernisiere Bioinformatik-Infrastruktur und entwickle automatisierte Pipelines für Genom-Analysen.
- Unternehmen: IAEA, eine führende Organisation im Bereich nuklearer Techniken für Entwicklung und Umweltschutz.
- Vorteile: Tägliche Vergütung bis zu 260 €, Reisekosten und Gesundheitsversorgung.
- Weitere Informationen: Arbeiten in einem dynamischen Umfeld mit Möglichkeiten zur beruflichen Weiterentwicklung.
- Warum dieser Job: Gestalte die Zukunft der Tiergesundheit mit innovativen Technologien und einem globalen Einfluss.
- Qualifikationen: Master-Abschluss in Genomik/Bioinformatik und mindestens fünf Jahre Erfahrung.
Organizational Setting
Die Abteilung für Nuklearwissenschaften und Anwendungen setzt das Hauptprogramm 2 der IAEA, "Nukleare Techniken für Entwicklung und Umweltschutz", um. Dieses Hauptprogramm umfasst Einzelprogramme zu Lebensmitteln und Landwirtschaft, menschlicher Gesundheit, Wasserressourcen, Umwelt und Strahlungstechnologien. Diese Programme werden von Laboren in Seibersdorf, Monaco und Wien unterstützt. Das Ziel des Hauptprogramms ist es, die Kapazität der Mitgliedstaaten zu erhöhen, um grundlegende menschliche Bedürfnisse zu erfüllen und die marinen und terrestrischen Umgebungen durch den Einsatz nuklearer und isotopischer Techniken in nachhaltigen Entwicklungsprogrammen zu bewerten und zu verwalten.
Der Gemeinsame FAO/IAEA-Zentrum für Nukleartechniken in Lebensmitteln und Landwirtschaft unterstützt die Mitgliedstaaten der Ernährungs- und Landwirtschaftsorganisation der Vereinten Nationen (FAO) und der IAEA bei der Nutzung nuklearer Techniken und verwandter Technologien zur Verbesserung der Ernährungssicherheit, zur Linderung von Armut und zur Förderung nachhaltiger Landwirtschaft. Das Gemeinsame Zentrum besteht aus fünf Sektionen, jede mit einem zugehörigen Labor (in Seibersdorf, 45 km südöstlich von Wien), in den Bereichen Tierproduktion und -gesundheit; Pflanzenzüchtung und Genetik; Insektenbekämpfung; Boden- und Wasserbewirtschaftung sowie Düngemittelmanagement; und Lebensmittel- und Umweltschutz.
Die Sektion für Tierproduktion und -gesundheit und das Labor unterstützen die Mitgliedstaaten dabei, die Produktivität der Viehzucht durch den effizienten Einsatz lokal verfügbarer Futtermittelressourcen, Fortpflanzungs- und Zuchtpraktiken sowie Diagnosetools und Kontrollmaßnahmen zu verbessern.
Main Purpose
Der Berater wird das Labor für Tierproduktion und -gesundheit (APHL) bei der Modernisierung seiner Bioinformatikinfrastruktur unterstützen. Zu den Hauptaufgaben gehören die Konfiguration von Forschungsservern zu einem Hochleistungsrechnercluster (HPC) und die Bereitstellung einer lokalen Galaxy-Instanz zur Verbesserung der Zugänglichkeit der Pipeline. Der Berater wird automatisierte Workflows für Whole Genome Sequencing (WGS), Shotgun Metagenomics und Metatranscriptomics unter Verwendung von Machine Learning (ML) und fortgeschrittener Bioinformatik einrichten. Diese Pipelines müssen mehrere Plattformen unterstützen, einschließlich Oxford Nanopore, Ion Torrent, PacBio und Illumina. Ein Schwerpunkt liegt auf dem Kapazitätsaufbau für den APHL-Kurs im November 2026. Der Berater wird eine dedizierte virtuelle Maschine (VM) und syntax-hervorgehobene Schulungsmaterialien entwickeln. Diese Bemühungen stärken die Rolle des APHL als Collaborating Centre der Weltorganisation für Tiergesundheit (WOAH) und unterstützen das Netzwerk der Ernährungs- und Landwirtschaftsorganisation der Vereinten Nationen (FAO), um eine qualitativ hochwertige genomische Analyse und Krankheitsdiagnose für die Mitgliedstaaten zu ermöglichen.
Functions / Key Results Expected
- Technische Expertise bei der Einrichtung automatisierter Pipelines für die Analyse und Visualisierung von WGS-, Shotgun-Metagenomik- und Metatranskriptom-Datensätzen bereitstellen.
- Eine Analyse für Whole Genome Sequencing (WGS), Shotgun Metagenomic und Metatranscriptomic-Daten unter Verwendung fortschrittlicher Bioinformatik- und Machine Learning (ML)-Tools durchführen.
- Technische Eingaben zur Konfiguration von Forschungs- und Schulungsservern in einen Hochleistungscomputercluster bereitstellen, der für die Analyse großer Datenmengen optimiert ist.
- Expertise bei der Bereitstellung einer lokalen Instanz von Galaxy auf Forschungsservern und der Migration bestehender APHL-Pipelines in Galaxy-Workflows zur Verbesserung der Zugänglichkeit für APHL-Mitarbeiter beitragen.
- Technische Expertise bei der Aktualisierung der aktuellen APHL-Bioinformatik-Pipelines zur Unterstützung der Datenanalyse für Oxford Nanopore, Ion Torrent (S5), PacBio und Illumina-Plattformen bereitstellen.
- Technische Expertise bei der Erstellung umfassender Schulungsmaterialien für den APHL-Kurs, der für November 2026 geplant ist.
- Eine dedizierte virtuelle Maschine (VM) entwickeln, die mit der erforderlichen Software vorinstalliert ist, und syntax-hervorgehobene Schulungsmaterialien erstellen, um effektives Lernen für die Auszubildenden sicherzustellen.
Knowledge, Skills and Abilities
Tierkrankheiten
Qualifications and Experience
Fortgeschrittener Hochschulabschluss (Master) in Genomik/Bioinformatik oder einem anderen verwandten Bereich. Mindestens fünf Jahre Erfahrung in der Schulung in Bioinformatik und im Kapazitätsaufbau zu Datenanalysepipelines, bakterieller und viraler Genomik sowie Methoden des maschinellen Lernens zur Krankheitsvorhersage. Starker Hintergrund im Management von Hochleistungsrechenanlagen. Gute mündliche und schriftliche Englischkenntnisse. Kenntnisse anderer offizieller IAEA-Sprachen (Arabisch, Chinesisch, Französisch, Russisch und Spanisch) sind von Vorteil.
Remuneration
Die Vergütung für diese Beratung beträgt eine Tagespauschale von bis zu maximal 260 €, basierend auf Qualifikationen und Erfahrung. Falls Dienstreisen im Rahmen des Auftrags erforderlich sind, werden eine tägliche Reisekostenpauschale (DSA) und Reisekosten übernommen. Die Gesundheitsversorgung und die Pensionskasse liegen in der Verantwortung des Stelleninhabers.
Consultant - Bioinformatics Pipeline Automation Specialist Arbeitgeber: BlackCube Labs
Die Internationale Atomenergie-Organisation (IAEO) bietet eine herausragende Arbeitsumgebung, die sich durch ein starkes Engagement für nachhaltige Entwicklung und den Einsatz modernster Technologien auszeichnet. Als Consultant im Bereich Bioinformatik-Pipeline-Automatisierung haben Sie die Möglichkeit, an bedeutenden Projekten zur Verbesserung der Lebensmittelsicherheit und des Tierschutzes mitzuwirken, während Sie in einem internationalen Team arbeiten, das Vielfalt und Zusammenarbeit schätzt. Zudem profitieren Sie von attraktiven Vergütungen, flexiblen Arbeitsbedingungen und umfangreichen Weiterbildungsmöglichkeiten, die Ihre berufliche Entwicklung fördern.
StudySmarter Expertenrat🤫
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✨Tipp Nummer 1
Nutze dein Netzwerk! Sprich mit Leuten, die in der Branche arbeiten oder schon bei der IAEA waren. Oft gibt es ungeschriebene Stellenangebote oder wertvolle Tipps, die dir helfen können, den Fuß in die Tür zu bekommen.
✨Tipp Nummer 2
Bereite dich auf das Vorstellungsgespräch vor! Informiere dich über die neuesten Entwicklungen in der Bioinformatik und sei bereit, deine Erfahrungen mit HPC und automatisierten Pipelines zu teilen. Zeige, dass du nicht nur die Theorie kennst, sondern auch praktische Lösungen anbieten kannst.
✨Tipp Nummer 3
Sei proaktiv! Wenn du eine interessante Stelle siehst, bewirb dich direkt über unsere Website. Warte nicht darauf, dass die perfekte Gelegenheit zu dir kommt – zeig Initiative und Interesse!
✨Tipp Nummer 4
Erstelle ein Portfolio deiner bisherigen Arbeiten! Zeige konkrete Beispiele für Projekte, an denen du gearbeitet hast, insbesondere im Bereich der Genomik und Bioinformatik. Das hilft, deine Fähigkeiten greifbar zu machen und hebt dich von anderen Bewerbern ab.
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Einige Tipps für deine Bewerbung 🫡
Mach deine Bewerbung persönlich!:Zeig uns, wer du bist! Verwende eine freundliche und authentische Sprache, um deine Motivation und Leidenschaft für die Bioinformatik zu vermitteln. Lass uns wissen, warum du genau zu uns passt!
Betone deine Erfahrungen:Erzähle uns von deinen bisherigen Projekten und Erfahrungen im Bereich Bioinformatik und HPC. Konkrete Beispiele helfen uns, deine Fähigkeiten besser zu verstehen und wie du unser Team unterstützen kannst.
Sei klar und strukturiert:Achte darauf, dass deine Bewerbung gut strukturiert ist. Verwende Absätze und Aufzählungen, um wichtige Informationen hervorzuheben. So wird es für uns einfacher, deine Qualifikationen nachzuvollziehen.
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Wie man sich auf ein Vorstellungsgespräch bei BlackCube Labs vorbereitet
✨Verstehe die Anforderungen
Mach dich mit den spezifischen Anforderungen der Stelle vertraut. Lies die Stellenbeschreibung gründlich durch und notiere dir, welche Fähigkeiten und Erfahrungen besonders betont werden. So kannst du gezielt auf diese Punkte während des Interviews eingehen.
✨Bereite konkrete Beispiele vor
Überlege dir konkrete Beispiele aus deiner bisherigen Berufserfahrung, die deine Fähigkeiten in Bioinformatik, Pipeline-Automatisierung und Machine Learning demonstrieren. Diese Geschichten helfen dir, deine Kompetenzen anschaulich zu präsentieren und zeigen, dass du die Anforderungen der Position verstehst.
✨Technisches Wissen auffrischen
Stelle sicher, dass du über die neuesten Entwicklungen in der Bioinformatik und den verwendeten Technologien informiert bist. Sei bereit, technische Fragen zu beantworten und deine Kenntnisse über HPC-Cluster, Galaxy und verschiedene Sequenzierungstechniken zu erläutern.
✨Fragen vorbereiten
Bereite einige Fragen vor, die du dem Interviewer stellen möchtest. Das zeigt dein Interesse an der Position und der Organisation. Du könntest zum Beispiel nach den aktuellen Projekten im APHL oder den Herausforderungen bei der Implementierung neuer Technologien fragen.
