Computational Metabolomics Scientist (LC-MS/QTOF)

Schließen Sie sich einer hochdurchsatzfähigen Massenspektrometrie (MS)-basierten Omics-Plattform an, die mehr als 100.000 menschliche Plasma-Proben im Rahmen einer wichtigen europäischen Bevölkerungs-Gesundheitsinitiative analysiert. Das Center for Molecular Fingerprinting (CMF) ist eine interdisziplinäre, gemeinnützige Forschungseinrichtung, die von dem Nobelpreisträger in Physik 2023, Prof. Dr. Ferenc Krausz, geleitet wird. Wir sind ein internationales Team von Laserspezialisten, Molekularbiologen, Medizinern, Ingenieuren und Datenanalysten, die sich zusammengefunden haben, um die Grenzen der Gesundheitsüberwachung und der Erforschung der menschlichen Gesundheit zu erweitern. Unsere Mission wird von der Vision eines zuverlässigen, kosteneffektiven Ansatzes zur Sicherung der Gesundheit ganzer Bevölkerungen und der Entwicklung neuer Möglichkeiten zur frühestmöglichen Erkennung von Krankheiten wie Krebs, Herz-Kreislauf-Erkrankungen und Diabetes getragen.

Im Rahmen unseres bahnbrechenden H4H (Health for Hungary - Hungary for Health) Programms bauen wir eine der ehrgeizigsten longitudinalen Gesundheitsüberwachungsinitiativen in Europa auf. Über einen Zeitraum von 10 Jahren werden Biofluidproben von Tausenden von Freiwilligen gesammelt, um großangelegte molekulare Profilierungen und frühe Krankheitsdetektionen zu ermöglichen. Um diese Bemühungen zu unterstützen, richtet CMF eine großangelegte Metabolomik- und Lipidomik-Plattform für die Analyse menschlicher Plasma-Proben ein. In den nächsten drei Jahren werden mehr als 100.000 Plasma-Proben mit einer hochdurchsatzfähigen LC–MS-Plattform analysiert, die aus sieben Waters G3 QTOF-Massenspektrometern besteht.

Wir suchen einen erfahrenen Wissenschaftler für die Verarbeitung von MS-basierten Omics-Daten, der unsere Rohdatenvorverarbeitungs- und Qualitätskontroll-Workflows leitet und analysierbare Datensätze erstellt. Diese Rolle ist ideal für jemanden mit einem starken Hintergrund in der LC-MS Metabolomik-Datenanalyse, der es genießt, robuste, automatisierte Datenverarbeitungs-Pipelines für die routinemäßige Probenanalyse zu entwickeln.

Ihre Aufgaben:

• Entwicklung und Optimierung von untargetierten LC-MS Rohdatenverarbeitungs-Workflows zur Bereitstellung hochwertiger Datensätze für die nachgelagerte biologische Interpretation großer Metabolomik-Datensätze (Stichprobengröße n>100.000) und Proteomik-Datensätze.
• Durchführung von Merkmalsdetektion, Ausrichtung, Normalisierung und Merkmalsauswahl mit Software wie XCMS und/oder MZmine.
• Entwurf und Implementierung von Qualitätskontrollstrategien unter Verwendung von stabilisotopenmarkierten internen Standards.
• Überwachung der analytischen Leistung und Festlegung von QC-Akzeptanzkriterien.
• Enge Zusammenarbeit mit unseren erfahrenen Laborspezialisten und analytischen Chemikern, um zuverlässige, reproduzierbare und hochwertige Massenspektrometriedaten sicherzustellen.
• Beitrag zur kontinuierlichen Verbesserung und Automatisierung der routinemäßigen Datenanalyse-Pipelines.

Ihr Profil:

• Doktortitel in Metabolomik, Proteomik, Analytischer Chemie, Bioinformatik oder einem verwandten Fachgebiet oder gleichwertige industrielle Erfahrung.
• Praktische Erfahrung mit der Verarbeitung von LC-MS-basierten Omics-Daten.
• Starkes Wissen über XCMS/MZmine oder vergleichbare Metabolomik-Software zur Merkmalsextraktion.
• Vertrautheit mit statistischer Analyse und Datenqualitätsbewertung.
• Exzellente analytische und problemlösende Fähigkeiten.
• Gute Kommunikationsfähigkeiten und fließendes Englisch.
• Nicht erforderlich, aber von Vorteil: Erfahrung in der Gestaltung und Implementierung von QC-Verfahren unter Verwendung stabilisotopenmarkierter Standards.

Wir bieten:

• Die Möglichkeit, eine hochmoderne, hochdurchsatzfähige Metabolomik-Einrichtung von Grund auf aufzubauen.
• Ein dynamisches Arbeitsumfeld mit der Möglichkeit, sich in einem sich schnell entwickelnden und innovativen Bereich zu engagieren.
• Ein kollaboratives und internationales Arbeitsumfeld.
• Eine unbefristete Vollzeitstelle mit Möglichkeiten zur Gestaltung von Laborabläufen und Qualitätsstandards.
• Eine lösungsorientierte Atmosphäre mit der Chance, zum Erfolg einer dynamischen und wachsenden Organisation beizutragen.

Bewerbungsfrist: 05. September 2026