Systems Engineer & DevOps for Genomics Platform

Systems Engineer & DevOps for Genomics Platform

Freiburg im Breisgau Befristet 46800 - 57200 € / Jahr (geschätzt) Homeoffice (teilweise)
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Auf einen Blick

  • Aufgaben: Entwickle und pflege die Galaxy-Serverinfrastruktur und unterstütze innovative Projekte.
  • Unternehmen: Freiburger Universität im internationalen Forschungsumfeld mit einem engagierten Team.
  • Vorteile: Flexible Arbeitszeiten, 30 Tage Urlaub, Weiterbildungsmöglichkeiten und familienfreundliche Angebote.
  • Weitere Informationen: Internationale Zusammenarbeit und hervorragende Karrierechancen in einem modernen Arbeitsumfeld.
  • Warum dieser Job: Arbeite an spannenden Projekten in der Bioinformatik und entwickle deine Fähigkeiten in einem dynamischen Team.
  • Qualifikationen: Erfahrung in Linux-Systemadministration, Python, Git und SQL; Bachelor oder Master in Informatik.

Das prognostizierte Gehalt liegt zwischen 46800 - 57200 € pro Jahr.

Die Abteilung für Informatik eröffnet eine Stelle für einen Systems Engineer / DevOps Engineer (m/w/d), der die Entwicklungs- und Betriebsfunktionen innerhalb einer der beliebtesten und etabliertesten Datenanalyseplattformen für die Lebenswissenschaften verbindet. Der Ingenieur ist verantwortlich für die Implementierung, Unterstützung und Dokumentation mehrerer großangelegter Anwendungssysteme. Diese Rolle umfasst unter anderem die Installation, Modifikation, Tests und Upgrades von Anwendungen, Betriebssystemen, Dateisystemen, Hardware und Cloud-Umgebungen. Die Arbeit wird zusammen mit anderen Administratoren durchgeführt.

Wer wir sind

Das europäische Galaxy-Team ist eine Kerngruppe innerhalb des weltweiten Galaxy-Projekts. Wir sind eine offene, leidenschaftliche und unterstützende Forschungsgruppe an der Universität Freiburg, die stark in viele Softwareprojekte der globalen Galaxy-Community involviert ist, einschließlich der Leitung der Bioconda- und BioContainers-Projekte sowie der Entwicklung modernster computergestützter Workflows für Genomik, Metagenomik, Transkriptomik und Pharmakogenomik-Daten. Basierend in Freiburg bietet usegalaxy.eu das Wissenschaftsportal, das eine Open-Access-Computing-Infrastruktur für den Zugriff auf und die Ausführung eines umfangreichen Katalogs von Datenressourcen, Tools und Workflows bereitstellt. Es wird von fast 100.000 Nutzern weltweit verwendet.

Ihre Möglichkeiten

Diese Position ermöglicht es dem Stelleninhaber, mit einem interdisziplinären Team aus Bioinformatikern, Datenwissenschaftlern und Softwareentwicklern zu interagieren, das mit modernster Cloud-Infrastruktur in ganz Europa arbeitet und sich mit fortgeschrittenen Themen wie verteiltem heterogenem Computing, verschlüsselter Datenverarbeitung oder intelligenter Jobplanung über föderierte Ressourcen beschäftigt.

Ihre Aufgaben

  • Entwicklung und Wartung des Galaxy-Servers und der zugehörigen Infrastruktur, z.B. TIaaS (Training Infrastructure as a Service), Pulsar-Netzwerk und Beacon-Service
  • Arbeiten im Team der Administratoren zur Gestaltung und Verbesserung der entwickelten Software und Bereitstellungspipelines
  • Konzeption von Aktualisierungsverfahren und Softwareintegrationen im laufenden System
  • Implementierung und Aufrechterhaltung bester Sicherheitspraktiken und Einhaltung unserer Informationssicherheitsrichtlinien und Branchenstandards
  • Aktuell bleiben mit Branchentrends und neuen Technologien, z.B. Virtualisierung und Infrastrukturtechnologien, Automatisierung und CI/CD-Pipelines
  • Proaktive Identifizierung von Möglichkeiten zur Verbesserung der Galaxy Europe-Instanz sowie allgemeiner Bereitstellungsanleitungen für andere Galaxy-Instanzen
  • Integration infrastruktureller Komponenten wie verschiedene Speichersysteme und spezielle Rechenknoten mit Beschleunigern wie GPUs
  • Community-Support und Schulung
  • Entwicklung von Dokumentation und Schulungsmaterial für Galaxy-Administratoren und Automatisierungs-Workflows
  • Unterstützung von Dienstadministratoren, Durchführung von Workshops und Schulung anderer Administratoren in Live-Sitzungen

Ihr Profil

Wir suchen einen engagierten und motivierten Teamplayer mit starken Kommunikationsfähigkeiten und guten Englischkenntnissen. Der erfolgreiche Bewerber wird ein Experte für Linux-Systemadministration mit fundierten Kenntnissen in Python, Git und SQL-Datenbanken sowie einem Bachelor- oder Masterabschluss in Informatik oder einer gleichwertigen Qualifikation sein. Er/Sie ist ein analytischer Denker, Problemlöser und zuverlässig, mit einem starken Wunsch zu lernen und mit dem Team zusammenzuarbeiten.

Zusätzliche Fähigkeiten, die von Vorteil sind:

  • mehrjährige Erfahrung
  • Erfahrung im Aufbau containerisierter Anwendungen
  • Erfahrung in der Konfiguration von Continuous Integration und Continuous Delivery (CI/CD) Systemen
  • Kenntnisse in Konfigurationsmanagement-Tools (Terraform, Ansible)
  • Vertrautheit mit Cloud-Technologien (z.B. OpenStack)
  • Erfahrung in Hochleistungsrechenumgebungen

Was wir bieten

Unser Institut, gelegen in einer Region, die Deutschland, Frankreich und die Schweiz verbindet, bietet ein internationales Forschungsumfeld mit hervorragenden Infrastruktureinrichtungen und einer positiven Arbeitsatmosphäre, die großen Wert auf die Work-Life-Balance legt.

  • Ein Team von Administratoren, mit dem Sie arbeiten können
  • Professionelle Ausbildungs- und Entwicklungsmöglichkeiten
  • Herausfordernde Aufgaben in europaweit verteilten Projekten in einem modernen Arbeitsumfeld
  • Flexible Arbeitszeiten und vertrauensbasierte Arbeitszeit
  • 30 Tage Urlaub pro Jahr
  • Günstige öffentliche Verkehrsmittel im lokalen Bereich
  • Familienfreundliche Angebote (angeschlossene Kindertagesstätte am Institut, Familienservice)

Diese Position ist sofort verfügbar und für zwei Jahre finanziert, mit der Möglichkeit der Verlängerung. Das Gehalt wird gemäß TV-L bis E13 festgelegt, sofern die persönlichen und tariflichen Anforderungen erfüllt sind.

Bereit, unserem Team beizutreten? Bitte reichen Sie Ihre vollständigen Bewerbungsunterlagen, einschließlich einer einseitigen Motivationszusammenfassung, Lebenslauf und Kontaktdaten ein.

Wir freuen uns besonders über Bewerbungen von Frauen für die hier ausgeschriebene Position.

Bitte senden Sie Ihre Bewerbung in Englisch, einschließlich der oben genannten Unterlagen unter Angabe der Referenznummer 00003737, bis spätestens 10.06.2024. Bitte senden Sie Ihre Bewerbung an die folgende Adresse in schriftlicher oder elektronischer Form:

Systems Engineer & DevOps for Genomics Platform Arbeitgeber: de.NBI

Das Deutsche Krebsforschungszentrum (DKFZ) in Heidelberg bietet eine herausragende Arbeitsumgebung für Cloud Engineers und Bioinformatiker, die an der Spitze der biomedizinischen Forschung stehen möchten. Mit einem starken Fokus auf interdisziplinäre Zusammenarbeit, modernster Ausstattung und umfangreichen Weiterbildungsmöglichkeiten fördert das DKFZ nicht nur die persönliche Entwicklung seiner Mitarbeiter, sondern auch deren Beitrag zu bedeutenden gesellschaftlichen Projekten im Bereich der Krebsforschung. Die familienfreundliche Kultur und die Möglichkeit von mobilem Arbeiten machen das DKFZ zu einem attraktiven Arbeitgeber für talentierte Fachkräfte.

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Kontaktdaten:

de.NBI Recruiting-Team

StudySmarter Expertenrat🤫

Wir sind der Meinung, dass du so Systems Engineer & DevOps for Genomics Platform erhalten könntest

Netzwerken in der Entwicklerszene

Besuche lokale Meetups oder Hackathons in der Software-Entwicklung, um direkt mit Leuten aus der Branche in Kontakt zu treten. Dort hast du die Chance, nicht nur von anderen zu lernen, sondern auch persönliche Eindrücke bei potenziellen Arbeitgebern wie de.NBI zu hinterlassen.

Open Source Beiträge leisten

Engagiere dich in Open-Source-Projekten, um deine Fähigkeiten zu zeigen und für de.NBI sichtbar zu werden. Das ist nicht nur eine super Möglichkeit, praktische Erfahrungen zu sammeln, sondern auch eine tolle Möglichkeit, sich einen Namen in der Entwicklergemeinschaft zu machen.

Auf Praktikumsprogramme achten

Halte Ausschau nach spezifischen Programmen für befristete Stellen, die viele Unternehmen anbieten, um junge Talente zu fördern. Diese Fenster sind oft zeitlich begrenzt, also mach dich bereit, wenn die Bewerbungen öffnen, und verpasse nicht die Gelegenheit, dich bei de.NBI zu bewerben!

Portfolio aufbauen und sichtbar machen

Erstelle dir ein starkes Portfolio, das deine besten Projekte zeigt. Teile dieses Portfolio in Entwickler-Communities und auf Plattformen wie GitHub, damit Unternehmen wie de.NBI sofort sehen, was du kannst. Das steigert deine Chancen, in der Software-Entwicklung aufzufallen!

Wir glauben, dass du diese Fähigkeiten brauchst, um Systems Engineer & DevOps for Genomics Platform mit Bravour zu bestehen

Linux System Administration
Python
Git
SQL-Datenbanken
Containerisierte Anwendungen
CI/CD Systeme
Konfigurationsmanagement-Tools (Terraform, Ansible)

Einige Tipps für deine Bewerbung 🫡

Dein GitHub ist dein bester Freund!:Für eine befristete Stelle in der Software-Entwicklung ist dein GitHub-Profil super wichtig. Zeig uns deine besten Projekte und deinen Code! Wenn du Seitenprojekte oder Beiträge zu Open-Source-Projekten hast, pack die unbedingt in deine Bewerbung, das gibt uns einen tollen Einblick in deine Fähigkeiten.

Skills, Skills, Skills!:Mach eine Liste deiner technischen Skills und Technologien, die du beherrschst. In der Software-Entwicklung ist es wichtig, diese klar und präzise in deinem Lebenslauf zu präsentieren. Liste Frameworks, Programmiersprachen und Tools auf, die du nutzt, und versichere dich, dass sie zum Job bei de.NBI passen!

Deine Motivation zeigt, dass du lernbereit bist:In deinem Anschreiben solltest du darauf eingehen, warum du dich für die befristete Stelle bei de.NBI interessierst und was du dir von der Erfahrung erhoffst. Heb hervor, wie diese Position dir helfen kann, deine Fähigkeiten zu verbessern und neue Technologien zu lernen.

Projektbesprechung und persönliche Note:Wenn du ein Portfolio hast, das deine Entwicklungsprojekte zeigt, füge das unbedingt an. Außerdem kannst du in deinem Anschreiben erwähnen, warum du gerade bei de.NBI arbeiten möchtest und wie du zur Unternehmenskultur passt. Das gibt uns einen persönlicheren Eindruck von dir als Bewerber!

Wie man sich auf ein Vorstellungsgespräch bei de.NBI vorbereitet

Code die Erwartungen!

Bei einem Interview in der Software-Entwicklung solltest du bereit sein, dein Coding-Know-how unter Beweis zu stellen. Mache dich mit typischen Coding-Challenges und Systemdesign-Fragen vertraut, die dir während des Interviews gestellt werden könnten. Vielleicht gibt es sogar Live-Coding-Sessions, also übe, deinen Denkprozess laut zu kommunizieren!

Bring dein Portfolio mit!

Auch wenn es sich um eine befristete Stelle handelt, ist es wichtig, deinem potenziellen Arbeitgeber dein Können zu zeigen. Stelle ein Portfolio mit deinen besten Projekten zusammen – idealerweise solche, die relevant für de.NBI sind. Denk daran, dass du nicht nur die Lösungen präsentieren solltest, sondern auch den Prozess und die Technologien, die du verwendet hast.

Sei flexibel und lernwillig!

Für befristete Stellen suchen Unternehmen oft nach Kandidaten, die schnell dazulernen können. Betone in deinem Interview deine Lernbereitschaft und vielleicht Beispiele, wie du in der Vergangenheit neue Technologien oder Programmiersprachen schnell beherrscht hast. Das zeigt, dass du gut ins Team passt und bereit bist, dich den Herausforderungen zu stellen.

Frage nach Team-Tools und Methoden!

Informiere dich über die Tools und Arbeitsmethoden, die das Team bei de.NBI verwendet. Hast du Erfahrung mit agilem Arbeiten oder Tools wie Jira, Git oder Slack? Wenn du gezielt Fragen zu diesen Aspekten stellst, zeigst du dein Interesse an der Teamdynamik und wie du dich schnell einbringen kannst.