(Senior) Bioinformatician

„Forschung für ein Leben ohne Krebs“ ist unsere Mission am Deutschen Krebsforschungszentrum. Wir untersuchen, wie Krebs entsteht, identifizieren Risikofaktoren und suchen nach neuen Strategien zur Krebsprävention. Wir entwickeln neue Methoden, mit denen Tumore präziser diagnostiziert und Krebspatienten erfolgreicher behandelt werden können. Jeder Beitrag zählt – ob in der Forschung, Verwaltung oder Infrastruktur. Das macht unsere tägliche Arbeit so sinnvoll und spannend.

Das Nationale Centrum für Tumorerkrankungen (NCT) ist eine langfristige Kooperation zwischen dem Deutschen Krebsforschungszentrum (DKFZ), hervorragenden Partnern der Universitätsmedizin und anderen Forschungseinrichtungen an sechs Standorten in Deutschland. Ziel des NCT ist es, vielversprechende Ergebnisse aus der Krebsforschung schnell und sicher in die klinische Anwendung zu bringen. Dieser Ansatz soll Krebspatienten landesweit Zugang zu innovativen Behandlungsoptionen bieten.

Eine der sechs NCT-Standorte ist das NCT Dresden (NCT/UCC), das eine Zusammenarbeit zwischen dem DKFZ, dem Universitätsklinikum Carl Gustav Carus Dresden (UCC), der Medizinischen Fakultät Carl Gustav Carus der TU Dresden und dem Helmholtz-Zentrum Dresden-Rossendorf (HZDR) darstellt.

Die Abteilung für Translationale Medizinische Onkologie sucht so schnell wie möglich einen (Senior) Bioinformatiker.

Das NCT und das DKFZ haben die Grundlagen gelegt, um neue Herausforderungen in der personalisierten Onkologie durch das MASTER-Programm anzugehen. Diese prospektive Registerstudie nutzt umfassende molekulare Profilierung und integrierte Datenanalyse (WGS/WES, RNA-Sequenzierung, genomweite DNA-Methylierungsprofilierung; wann immer möglich massenspektrometriebasierte (Phosphor)Proteomik, ex vivo Arzneimittelempfindlichkeitsprofilierung und räumliche Auflösung der Immunumgebung). Basierend auf dem MASTER-Workflow bieten wir klinisch relevante Managementempfehlungen in einem multizentrischen molekularen Tumorboard (MTB) und verfolgen das klinische Management von Patienten.

Die resultierende multidimensionale klinische und molekulare Datensätze haben sehr erfolgreiche interdisziplinäre Forschungsprojekte angestoßen (z.B. Heining et al. Cancer Discov 2018, Gröschel et al. Nat Commun 2019, Horak et al. Cancer Discov 2021, Möhrmann et al. Nat Commun 2022, Jahn et al. Ann Oncol 2022).

Die Abteilung für Translationale Medizinische Onkologie untersucht die molekularen und zellulären Mechanismen der Krebsentwicklung, -proliferation und -evolution. Die Abteilung engagiert sich sowohl in klinischen als auch in experimentellen Aktivitäten, um einen schnellen Übergang wissenschaftlicher Ergebnisse in die klinische Anwendung und klinische Ergebnisse in neue Hypothesen zu gewährleisten. Experimentell wird hochdurchsatzfähige, multiparametrische molekulare Profilierung eingesetzt, um Unterschiede im Genom von Tumor- und normalen Zellen zu entdecken und neuartige Ziele für die Krebstherapie auf genomischer oder zellulärer Ebene zu identifizieren. Geeignete Modellsysteme werden entwickelt und verwendet, um die funktionalen und mechanistischen Auswirkungen neuer Ziele zu charakterisieren und ihr Potenzial für die klinische Anwendung zu bewerten.