Bioinformatics Scientist

Die Labor für biologische Ingenieurwissenschaften (Prof. Randall J. Platt) an der ETH Zürich in Basel, Schweiz, entwickelt Technologien an der Schnittstelle von biologischer Ingenieurwissenschaft, molekularen (DNA, RNA, Protein) Störungstechnologien und funktioneller Genomik und wendet diese an, um Krankheiten zu verstehen und zu behandeln.

Zur Unterstützung dieser Bemühungen suchen wir einen Bioinformatiker, der eng mit Professor Platt zusammenarbeitet, die rechnergestützte Forschung der Gruppe leitet, zu laufenden Projekten beiträgt und unabhängige Forschungsrichtungen verfolgt, die mit den Zielen des Labors übereinstimmen.

Projekt Hintergrund

Unsere Gruppe baut Hochdurchsatz-Experimentierplattformen auf, die die Entwicklung neuartiger rechnergestützter Methoden erfordern. Zwei Beispielbereiche, in denen der Kandidat beitragen würde, sind unten beschrieben.

• CRISPR-Störungsscreenings: Diese transformieren, wie wir die Genfunktion im großen Maßstab studieren. Wir haben kürzlich eine AAV-basierte Methode für direkte in vivo Einzelzell-CRISPR-Screenings entwickelt und erweitern diesen Ansatz, um in vivo Zelltyp-Störungsatlanten zu erstellen, Krankheitsmechanismen zu untersuchen und therapeutische Ziele zu identifizieren.
• Transkriptom-Aufzeichnung und Rekonstruktion der zellulären Geschichte: Wir verbessern unsere CRISPR-basierte transkriptionale Aufzeichnungsmethode, die vorübergehende zelluläre Ereignisse in DNA kodiert und sie durch Sequenzierung ausliest.

Der erfolgreiche Kandidat wird eine zentrale Rolle bei der Planung von Projekten und Experimenten, der Entwicklung rechnergestützter Methoden, der Analyse multi-omischen Datensätze, der Überprüfung von Ergebnissen und der Interpretation von Erkenntnissen spielen.

Zu den Verantwortlichkeiten gehören auch Publikationen, Antragsstellung, Peer-Review, akademische Kooperationen, Partnerschaften mit der Industrie, Abteilungsdienste, Forschungsdissemination und Lehre.

Es wird erwartet, dass der Kandidat auf der Ebene des etablierten Forschers eingestellt wird. Eine Karriereentwicklung mit klaren Meilensteinen und Zeitplänen wird eingerichtet.

Profil

Der ideale Kandidat hat einen PhD oder gleichwertigen Abschluss in Bioinformatik, computergestützter Biologie, Informatik, angewandter Statistik oder einem verwandten Bereich, mit umfangreicher Erfahrung in der Entwicklung und Anwendung rechnergestützter Methoden auf großangelegte biologische Datensätze.

Wir suchen jemanden, der Folgendes mitbringt:

• Tiefe methodologische Expertise.
• Softwareentwicklung: Nachweis über die Entwicklung und Veröffentlichung gut dokumentierter rechnergestützter Werkzeuge und Pakete.
• Führung und Mentoring: Fähigkeit, Trainees bei der Planung und Durchführung rechnergestützter Forschungsprojekte zu leiten.
• Starke Kommunikation: Fähigkeit, komplexe Themen klar zu vermitteln.
• Erfahrung in der Publikation: Nachweis über die Veröffentlichung rechnergestützter Arbeiten.
• Fähigkeit zur Antragsstellung: Erfahrung in der Gestaltung und dem Schreiben überzeugender, machbarer und finanzierbarer Forschungsanträge.
• Sichtbarkeit und unabhängige Beiträge: Erfolgreiche Nachweise über anerkannte unabhängige Beiträge zum Fachgebiet.

Wir bieten

Die Position befindet sich im Department of Biosystems Science and Engineering (D-BSSE) der ETH Zürich in Basel. Das D-BSSE ist ein hochinterdisziplinäres Department, das sich auf System- und synthetische Biologie, Bioinformatik und Datenwissenschaft sowie Ingenieurwissenschaften spezialisiert hat.

Wir freuen uns auf Ihre Bewerbung. Bitte reichen Sie Folgendes als eine einzige PDF bis zum 24. März 2026 ein:

• Anschreiben, das Ihren wissenschaftlichen Hintergrund, Fähigkeiten und Interessen kontextualisiert und darlegt, warum Sie interessiert sind, der Gruppe beizutreten.
• Lebenslauf.
• Diplome und Kurszeugnisse.
• Kontaktdaten von mindestens zwei Referenzen.

Bitte reichen Sie Ihre Bewerbung online ein. Bewerbungen per E-Mail werden nicht berücksichtigt.