Data Architect / Knowledge Engineer – Euro-BioImaging (AI4Access)

Euro-BioImaging ERIC ist eine europäische Forschungsinfrastruktur, die Lebenswissenschaftlern den offenen Zugang zu fortschrittlichen Bildgebungstechnologien, Fachwissen, Schulungen und Datendiensten über fast 300 Bildungseinrichtungen in 40 Knoten in ganz Europa ermöglicht. Das Euro-BioImaging Hub ist auf drei Standorte verteilt: der rechtliche Sitz (Finnland), der Med-Hub (Italien) und der Bio-Hub, der von EMBL in Heidelberg gehostet wird.

Das Euro-BioImaging Access Portal ist die Infrastruktur-Schnittstelle, die es Benutzern ermöglicht, Bild- und Bilddaten-Technologien aus einem umfangreichen und reichen Serviceportfolio zu durchsuchen, anzufordern und darauf zuzugreifen. Es ist auch die Plattform, über die Euro-BioImaging und die dienstleistenden Einrichtungen die eingehenden Zugriffsanfragen und Benutzerinteraktionen verwalten.

Das AI4Access-Projekt wird einen „Research Navigator“ (eine LLM-Anwendung) entwickeln, die in das Euro-BioImaging Access Portal integriert ist, um Forscher zu den richtigen Dienstleistungen, Arbeitsabläufen und Ressourcen innerhalb der Infrastruktur zu führen. Eine wichtige Grundlage ist eine strukturierte, gepflegte, ontologie-aligned Wissensbasis, die zuverlässig vom Navigator abgefragt werden kann.

Ihre Rolle

Wir suchen einen technisch versierten Kollegen, der die Datenbank und die Datenaufnahme-Pipeline, die der ontologiegetriebenen Wissensbasis von AI4Access zugrunde liegt, entwirft, einrichtet und pflegt, mit dem Euro-BioImaging Bio-Hub-Team und der Gemeinschaft an der Entwicklung relevanter Ontologien und Wissensgraphen arbeitet und robuste technische Schnittstellen zwischen der Wissensbasis und dem Research Navigator zusammen mit dem Euro-BioImaging Seat-Team und den eigenen Informations- und Managementsystemen der Euro-BioImaging-Knoten entwickelt.

Verantwortlichkeiten umfassen unter anderem:

• Entwurf und Implementierung eines ontologie-aligned Datenmodells, seiner technischen Darstellung (Datenbank + Schema, Versionierung, Dokumentation) und des minimal funktionsfähigen Dienstes.
• Zusammenarbeit mit den Bio-Hub-Bildgebungsspezialisten und kollegialen Ansprechpartnern, um reale Dienstbeschreibungen in eine wartbare strukturierte Form über gemeinschaftlich vereinbarte Ontologien und/oder kontrollierte Vokabulare zu übersetzen.
• Unterstützung bei der Integration von semantischen und Metadaten-Elementen (kontrollierte Vokabulare, Identifikatoren/PIDs, Herkunft) zusammen mit Fachexperten.
• Entwicklung und Pflege automatisierter ETL-Workflows zur Handhabung von Datenaufnahme-Pipelines (Datenquellen, Annotationen, Transformationen, Validierungs-/QA-Regeln, wiederholbare Updates), die an eine Vielzahl von Daten und Datenquellen angepasst sind.
• Implementierung robuster APIs und Zugriffsschichten, die für LLM-Anwendungen optimiert sind, um Dienste, Fähigkeiten und Einschränkungen mit hoher Zuverlässigkeit und Transparenz abzufragen.
• Zusammenarbeit mit dem Seat-Team bei Integration, Tests, Release-Planung und technischer Dokumentation.

Sie haben

• Ein motivierter, strukturierter und praktischer Kollege, der gerne zuverlässige Systeme aufbaut, die von einer breiten wissenschaftlichen Gemeinschaft genutzt werden.
• Abschluss (MSc / PhD oder gleichwertige Erfahrung) in einem relevanten Bereich (Daten-/Informatik, Bioinformatik, Informationssysteme oder ähnlich).
• Vertrautheit mit Metadaten, Ontologien, kontrollierten Vokabularen und persistenten Identifikatoren.
• Fortgeschrittene Python-Programmierkenntnisse und nachgewiesene Erfahrung in der Gestaltung und Wartung produktionsbereiter Datenbanken für strukturierte Inhalte (z.B. Postgres/Grafikspeicher) und beim Aufbau von APIs für nachgelagerte Anwendungen.
• Erfahrung mit CI/CD-Datenpipelines (Aufnahme, Transformation, Validierung) und Praktiken zur Datenqualität, einschließlich Erfahrung mit Versionskontrollframeworks (GitHub/GitLab).
• Fähigkeit, effektiv mit mehreren Stakeholdern (technisch und nicht-technisch) in einem internationalen Umfeld zu arbeiten.
• Fließend in schriftlichem und gesprochenem Englisch.

Sie haben möglicherweise

• Erfahrung in der Bioimaging- oder Lebenswissenschaftsdaten- und Metadatenverarbeitung.
• Erfahrung mit Wissensgraphen und dem semantischen Web, die mit Linked Data-Standards (RDF, SPARQL, SHACL) und/oder hybriden Abrufansätzen (GraphRAG) in KI-Anwendungen arbeiten.
• Erfahrung mit Graphdatenbanken (Neo4J).
• Erfahrung mit Forschungsinfrastrukturen, FAIR-Datenpraktiken oder dem Management von Dienstkatalogen in wissenschaftlichen Umgebungen.
• Praktische Erfahrung mit Containerisierung (Docker) und Orchestrierung (Kubernetes).

Vertragslaufzeit: 3 Jahre

Gehalt: Grad 5-6 je nach relevanter Erfahrung, monatliches Gehalt ab 4.031 EUR nach Steuern und vor den 13% EMBL Sozialversicherungsabzügen, plus finanzielle Zulagen basierend auf familiären Umständen.

Warum Sie sich uns anschließen sollten

EMBL ist neugiergetrieben, gemeinschaftsorientiert und international. Als inklusiver Arbeitgeber, der Chancengleichheit bietet, glauben wir, dass Vielfalt es uns ermöglicht, effektiver zusammenzuarbeiten und innovativ in unseren Ansätzen zu sein. Wir setzen uns daher dafür ein, eine inklusive und flexible Kultur zu schaffen - eine, in der jeder sein volles Potenzial ausschöpfen und einen positiven Beitrag zu unserer Organisation leisten kann. Wir ermutigen Bewerbungen von Personen, die unser bestehendes Team ergänzen können – wir glauben, dass Erfolg auf Teams basiert, deren Hintergründe und persönliche Erfahrungen die Vielfalt der Bevölkerungen widerspiegeln, die unsere Wissenschaft bedient. Wir ermutigen aktiv Bewerbungen von allen Geschlechtern und Kulturen, ethnischen Gruppen und allen Demografien, um zu helfen, Vorurteile und Versäumnisse an diesem transformativen Punkt in unserer Personalstrategie zu vermeiden.

Genießen Sie viele Vorteile:

• Finanzielle Anreize: Gehalt ohne Einkommenssteuer, monatliche Familien- und Kindergeldzulagen, jährliche Gehaltsüberprüfung, Rentenversicherung, Todesfallleistung, Langzeitpflege-, Unfall- und Arbeitslosenversicherungen.
• Flexible Arbeitszeiten.
• Private Krankenversicherung für Sie und Ihre unmittelbare Familie (einschließlich aller Rezepte und großzügiger Zahn- & Augenversicherung).
• Großzügige Freizeit: 30 Tage Jahresurlaub pro Jahr, zusätzlich zu Feiertagen.
• Campusleben: Kostenloser Shuttlebus (nur einige Standorte), Bibliothek vor Ort, subventionierte Cafeteria vor Ort, legere Kleiderordnung, umfangreiche Sport- und Sozialclubaktivitäten (auf dem Campus und remote).
• Familienleistungen: Kindergarten (Heidelberg), 10 Tage Kinderkrankheit, großzügige bezahlte Mutterschafts-/Elternzeit und monatliche Familien- & Kindergeldzulagen.

Für detaillierte Informationen besuchen Sie bitte unsere Seite zu den Mitarbeiterbenefits hier.

Was Sie sonst noch wissen müssen

EMBL ist Unterzeichner von DORA. Erfahren Sie hier, wie wir die DORA-Prinzipien auf unsere Rekrutierungs- und Leistungsbewertungsprozesse anwenden.

Diversität und Inklusion: Bei EMBL glauben wir, dass vielfältige Teams Innovation und wissenschaftliche Exzellenz vorantreiben. Wir ermutigen Bewerbungen von Kandidaten aller Geschlechter, Identitäten, Nationalitäten und/oder anderer vielfältiger Hintergründe.

Wie man sich bewirbt: Um sich zu bewerben, reichen Sie bitte ein Anschreiben und einen Lebenslauf über unser Online-System ein. Die Bewerbungen schließen um 23:59 Uhr MEZ am unten angegebenen Datum. Wir streben an, innerhalb von zwei Wochen nach dem Schließdatum eine Antwort zu geben.

Bewerbungsfrist: 15/05/2026