Molecular Geneticist (m/f/d) (80-100%) Swiss Plant Breeding Center - SPBC

Beschäftigungsdauer: 3 Jahre mit der Option auf unbefristete Anstellung bei hervorragender Leistung.

Überblick: Das Swiss Plant Breeding Center (SPBC) sucht einen erfahrenen und vielseitigen Molekulargenetiker. In dieser Rolle werden Sie Labormethoden etablieren und optimieren, um genomische Daten in umsetzbare Erkenntnisse zu übersetzen und als Bindeglied zwischen Laboranalysen und Zuchtentscheidungen bei Schweizer privaten und öffentlichen Zuchtorganisationen zu fungieren. Ihr Hauptziel ist es, Genomik zu nutzen, um die Entwicklung von widerstandsfähigen und hochwertigen Pflanzenvarianten zu beschleunigen, die gut an die Schweiz angepasst sind.

Hauptverantwortlichkeiten:

• Unterstützung in der molekularen Pflanzenzucht und Widerstandscreenings gegen biotische und abiotische Stressfaktoren über mehrere Kulturen hinweg zur Förderung des Zuchtprogrammerfolgs und zur Erhöhung des genetischen Gewinns.
• Molekulare Markerentwicklung: Entwurf kosteneffizienter Marker und Validierungsexperimente mit Züchtern zur Ermöglichung der routinemäßigen markerassistierten Selektion in Zuchtpipelines.
• Laboreinrichtung: Entwurf und Pflege effizienter Laborabläufe, einschließlich der Beschaffung spezialisierter Laborausrüstung.
• Laborverwaltung und Berichterstattung: Entwurf und Durchführung komplexer Experimente unter Gewährleistung, dass alle Protokolle strengen Qualitätskontroll- (QC) und Qualitätssicherungs- (QA) Standards entsprechen. Erstellung detaillierter technischer Berichte und standardisierter Betriebsverfahren.
• Genomische Analyse: Durchführung von Hochdurchsatz-DNA-Extraktionen und Sequenzierungen (NGS), PCR und Genotypisierungsanalysen mit schnellen Durchlaufzeiten.
• Bioinformatik: Aufbau und Pflege automatisierter bioinformatischer Pipelines zur Verarbeitung genomischer Daten, wie Hochdurchsatz-Genotypisierung (SNP-Chips, KASP) und Genomsequenzierung (gezielte Ansätze, WGS, RNA-Seq), einschließlich der Erstellung von Genomassemblierungen.
• Stakeholder-Engagement und Schulung: Effektive Kommunikation mit Stakeholdern und Schulung anderer.
• Innovation: An der Spitze der genetischen Technologie bleiben (z.B. kosteneffiziente Genotypisierung, Sequenzierung), um interne Methoden zu verbessern.
• Entscheidungsunterstützung: Übersetzung komplexer genomischer Daten in umsetzbare Erkenntnisse für Zuchtentscheidungen.

Wer Sie sind:

• Sie genießen Laborarbeit, entwickeln und optimieren innovative Methoden und Werkzeuge zur Lösung praktischer wissenschaftlicher Herausforderungen in verschiedenen Pflanzenarten in einem komplexen Netzwerk von Zuchtorganisationen.
• Sie sind ein effektiver Kommunikator, der mit einer Vielzahl von Stakeholdern interagieren kann.
• Sie sind motiviert durch die Anwendung neuer Technologien und Methoden in praktischen Zuchtprogrammen und verstehen, dass das Veröffentlichen von Arbeiten nicht der Hauptfokus dieser Rolle ist.
• Sie genießen die Entwicklung effizienter Laborprozesse und -abläufe, die routinemäßig angewendet werden können.
• Sie teilen Ihr Fachwissen gerne offen und frei.
• Sie arbeiten gerne in einem kleinen Team, in dem sich alle gegenseitig unterstützen.

Technische Anforderungen:

• Bildung: PhD (oder MSc mit >6 Jahren Erfahrung) in Molekulargenetik, Molekularbiologie, molekularer Pflanzenzucht, Bioinformatik oder einem verwandten Bereich.
• Laborverwaltung: Umfassendes Wissen über effiziente Laborabläufe und die Fähigkeit, die Beschaffung von Laborausrüstung zu koordinieren. Erfahrung in guter Laborpraxis, Laborinformationsmanagementsoftware (LIMS) und Führung von Teammitgliedern in einem Laborumfeld.
• Genomik: Erfahrung in der Erstellung von Sequenzierungsbibliotheken, Genomassemblierung, Ausrichtung und Variantenaufruf. Expertise in molekularer Klonierung, Primerdesign und Zellkultur.
• Markerdesign: Erfahrung im Entwurf genetischer Marker zur Ermöglichung der markerassistierten Selektion für wichtige Merkmale.
• Wissenschaftliches Rechnen: Erfahrung mit R und Hochleistungsrechnen (HPC), einschließlich Linux-Umgebungen und Cloud-Computing (AWS/GCP).
• Sprachen: Englisch und Deutsch oder Französisch.

Das Swiss Plant Breeding Center:

Das Swiss Plant Breeding Center (SPBC) ist das neu gegründete, unabhängige Kompetenz- und Innovationszentrum für Pflanzenzüchtung in der Schweiz, unterstützt vom Bundesamt für Landwirtschaft (FOAG). Ziel ist es, die Schweizer Pflanzenzucht zu stärken und die Zuchteffizienz zu erhöhen. Zu den Hauptaufgaben gehören die Vernetzung der Akteure in Züchtung und Forschung sowie die Übertragung von Forschungsergebnissen in praktische Zuchtprogramme. Das SPBC bietet Züchtern technische Unterstützung, Know-how und Expertise und spielt eine aktive Rolle bei der Planung und Umsetzung von Innovationen. Es richtet seine Dienstleistungen nach den Bedürfnissen der Kunden aus, ist offen für alle Kulturarten, Anbausysteme und -methoden, deckt breite Fachgebiete durch Netzwerkpartnerschaften ab und ist aktiv an der Akquisition von Kunden- und Drittmittel-Finanzierungen beteiligt.

Unsere Kompetenzen umfassen molekulare Genetik, Genomik, Bioinformatik, quantitative Genetik, Datenanalyse, Versuchsplanung, Zuchtprogrammentwicklung und digitale Phänotypisierung. In all diesen Bereichen konzentrieren wir uns darauf, Zuchtorganisationen zu unterstützen, um Forschungsergebnisse in routinemäßige Anwendungen zu übersetzen.