Postdoctoral Researcher / AI & Scientific Software Engineer – Autonomous Live-Cell Microscopy a[...]

Als führende Forschungseinrichtung für mikrobielle Biotechnologie konzentriert sich das Institut für Bio- und Geowissenschaften – Biotechnologie (IBG-1) auf molekulare und angewandte Mikrobiologie. Interdisziplinäre Teams entwickeln biotechnologische Prozesse für die Industrie von morgen, mit einem Fokus auf zunehmend automatisierte und miniaturisierte Experimente.

Wir suchen einen hochmotivierten Forscher zur Entwicklung neuartiger Methoden des maschinellen Lernens und der Computer Vision für autonome Live-Zell-Mikroskopie, intelligente Experimentsteuerung und wissenschaftliche Workflows. Schließen Sie sich einem interdisziplinären Team an der Schnittstelle von KI, Mikrobiologie und Laborautomatisierung an, um die Zukunft der datengestützten Live-Zellanalyse zu gestalten.

Ihr Job:

• Entwicklung von workflows und wissenschaftlicher Software auf Basis von maschinellem Lernen für Segmentierung, Artenklassifikation und Verfolgung von Linien in Zeitraffer-Mikroskopiedaten.
• Optimierung von Modellen und Analyse-Pipelines für Echtzeitleistung, um adaptive Bildgebung und Feedbackkontrolle zu ermöglichen.
• Entwicklung von aktiven Lern- und Neutrainingsstrategien zur robusten Generalisierung auf neue mikrobielle Gemeinschaften.
• Entwicklung von ereignisgesteuerten Algorithmen und Softwarekomponenten für autonome Experimentsteuerung und adaptive Bildakquisition.
• Aufbau skalierbarer, wartbarer und Open-Source-Software für hochdurchsatzfähige Bildanalyse und Laborautomatisierung.

Sie werden Ihre Ergebnisse auf internationalen Konferenzen präsentieren, in führenden peer-reviewed Zeitschriften veröffentlichen und zur Betreuung und Ausbildung von Studierenden innerhalb des Konsortiums beitragen.

Ihr Profil:

• Exzellenter Master in Informatik, Ingenieurwesen, Biophysik, Angewandte Mathematik, Computational Biology oder einem verwandten Fachgebiet.
• Nachgewiesene Programmierkenntnisse in Python (wissenschaftliches Python, PyTorch) mit solider Erfahrung in wissenschaftlichem Rechnen, reproduzierbarer Softwareentwicklung und modernen Softwareengineering-Praktiken; Vertrautheit mit C++, Linux und Hochleistungsrechnen ist von Vorteil.
• Starker Hintergrund im maschinellen Lernen für Bildanalyse und Computer Vision, idealerweise mit Mikroskopie, Zeitrafferaufnahmen oder anderen hochdimensionalen wissenschaftlichen Bildgebungsverfahren.
• Erfahrung in einem oder mehreren der folgenden Bereiche: Objekterkennung und -segmentierung, Multi-Objekt-Verfolgung, Zeitreihenanalyse, probabilistische Modellierung und Unsicherheitsquantifizierung, Echtzeit- oder Streaming-Datenverarbeitung oder multimodales Lernen.
• Starker mathematischer und statistischer Hintergrund, kombiniert mit hervorragenden analytischen und problemlösenden Fähigkeiten.
• Interesse an der Entwicklung von KI-Methoden an der Schnittstelle von Biologie, Robotik und Laborautomatisierung, mit Begeisterung für die enge Zusammenarbeit mit experimentellen Wissenschaftlern. Vorherige Erfahrungen im Labor sind willkommen, aber nicht erforderlich.
• Exzellente Kommunikations- und Kollaborationsfähigkeiten, mit Begeisterung für die Arbeit in einem internationalen und hochgradig interdisziplinären Forschungsumfeld.
• Nachweisbare Forschungserfolge durch Veröffentlichungen, Beiträge zu Open-Source-Software, Praktika, Abschlussarbeiten oder vergleichbare wissenschaftliche Leistungen.
• Exzellente Englischkenntnisse; Deutschkenntnisse sind von Vorteil, aber nicht erforderlich.

Unsere Vorteile für Sie:

• Bedeutungsvolle Aufgaben: Ein spannendes, interdisziplinäres Forschungsumfeld an der Schnittstelle von KI, Bildgebung, Mikrobiomforschung und Laborautomatisierung innerhalb einer Helmholtz-weiten Zusammenarbeit.
• Zugang zu modernster Live-Zell-Bildgebung, Mikrofluidik, Laborautomatisierung und GPU-Computing-Infrastruktur.
• Die Möglichkeit, KI-Methoden und wissenschaftliche Software zu entwickeln, die direkt auf modernsten experimentellen Plattformen eingesetzt werden.
• Urlaub: Sie erhalten 30 Tage Urlaub plus zusätzliche freie Tage (z.B. zwischen Weihnachten und Neujahr).
• Wissen & Weiterbildung: Ihre berufliche Entwicklung ist uns wichtig – wir bieten gezielte, individuelle Unterstützung.
• Gesundheit & Wohlbefinden: Ihre Gesundheit ist uns wichtig. Sie können sich auf ein umfassendes betriebliches Gesundheitsmanagement-Programm mit einer Vielzahl von Angeboten freuen, z.B. einem Beachvolleyballplatz, Laufgruppen, Yogakursen und vielem mehr. Vor-Ort-Medizinische Dienste und ein Sozialberatungsteam stehen Ihnen zur Verfügung.
• Erfolgreicher Start: Wir bieten eine strukturierte Einarbeitung für Ihre Aufgaben und Unterstützung von Anfang an, einschließlich Welcome Days und Welcome Guide.
• Campus-Erlebnis: Unser Forschungscampus bietet kollegialen Austausch und Aktivitäten; eine Cafeteria bietet Optionen für Mahlzeiten.
• Unterstützung für internationale Mitarbeiter: Unser International Advisory Service hilft internationalen Mitarbeitern beim Einstieg.
• Karrierezentrum: Explizite Unterstützung in Bezug auf Karriereentwicklungsmöglichkeiten.

Wir bieten einen befristeten Vertrag in einem internationalen, interdisziplinären Arbeitsumfeld. Gehalt und Leistungen entsprechen dem Tarifvertrag für den öffentlichen Dienst (TVöD-Bund), Entgeltgruppe E13. Die monatlichen Gehälter in Euro finden Sie auf der BMI-Website. Weitere Informationen zum TVöD-Bund sind dort verfügbar.

Zusätzlich zu spannenden Aufgaben und einem kollegialen Arbeitsumfeld bieten wir weitere Informationen auf unserer Campus-Vorteilsseite.

Wir begrüßen Bewerbungen von Menschen mit unterschiedlichen Hintergründen. Ein vielfältiges und inklusives Arbeitsumfeld mit Chancengleichheit ist uns wichtig.

Arbeitsort: Jülich

Startdatum: Arbeitszeit: 39 Stunden/Woche

Gehalt: Entgeltgruppe 13 TVöD-Bund

Bewerbungsfrist: Die Stelle wird ausgeschrieben, bis sie erfolgreich besetzt ist.