Postdoc / Semantic Data Architect for Virus Database (m/f/d)

Postdoc / Semantic Data Architect for Virus Database (m/f/d)

Jena Vollzeit 51750 - 63250 € / Jahr (geschätzt) Homeoffice (teilweise)
F

Auf einen Blick

  • Aufgaben: Entwickle Ontologien und Wissensgraphen für eine Virusdatenbank.
  • Unternehmen: Friedrich-Schiller-Universität Jena, innovative und dynamische Forschungsumgebung.
  • Vorteile: Familienfreundliches Arbeitsumfeld, Gesundheitsförderung und individuelle Entwicklungsmöglichkeiten.
  • Weitere Informationen: Teilzeitstelle mit flexiblen Arbeitszeiten und internationalem Team.
  • Warum dieser Job: Gestalte die Zukunft der Bioinformatik und arbeite an spannenden Projekten.
  • Qualifikationen: PhD oder gleichwertige Erfahrung in Informatik oder Bioinformatik erforderlich.

Das prognostizierte Gehalt liegt zwischen 51750 - 63250 € pro Jahr.

Die Juniorforschungsgruppe von Dr. Noriko Cassman am Institut für Informatik sucht einen Teilzeit-Semantischen Datenarchitekten (m/w/d) für die Modellierung von Metadaten, Ontologie-Engineering und das Design von Wissensgraphen für die von NFDI4Microbiota geförderte Virussequenzanalyse-Datenbank VirJenDB. Die Juniorgruppe ist in die Forschungsgruppe von Prof. Dr. Manja Marz (RNA Bioinformatik & Hochdurchsatzanalyse) eingebettet, die RNA-Bioinformatik, Virusdetektion und -evolution sowie RNA-Strukturvorhersage und -annotation untersucht. Die Position befindet sich an der Fakultät für Informatik und Mathematik der Friedrich-Schiller-Universität Jena, einer dynamischen und innovationsgetriebenen Universität mit einem breiten Fächerangebot, und in der jungen und lebhaften Stadt Jena – der Stadt der Wissenschaft.

Ihre Aufgaben:

  • Pflege und Formalisierung des VirJenDB-Metadatenmodells
  • Entwicklung einer Ontologie und Design eines Wissensgraphen
  • Integration des Metadatenmodells, der Ontologie und des Wissensgraphen in Arbeitsabläufe
  • Unterstützung des VirJenDB-Teams und der Nutzer bei der Datenmodellierung und Schema-Design
  • Regelmäßige Kommunikation mit dem NFDI4Microbiota-Konsortium und der Community sowie Durchführung von Schulungen
  • Verfassen von Forschungsarbeiten und Präsentation des Datenbankteams bei Meetings und Symposien

Ihr Profil:

  • Hochmotivierter Kandidat mit einem Doktortitel oder gleichwertiger Erfahrung in Informatik, Bioinformatik, Datenwissenschaft oder einem verwandten Fachgebiet
  • Exzellente Programmierkenntnisse und Erfahrung im Ontologie-Engineering, in Formaten und Graphdatenbanken (Python, C++/Java, MySQL, NoSQL, R, Bash, Neo4j, GraphDB, RDF/S, SPARQL, JSON-LD, RO-Crates, ISA)
  • Nachgewiesenes Engagement für beste Programmierpraktiken unter Anwendung von FAIR-, CLEAR- und Open-Science-Prinzipien sowie Standards des Semantischen Webs
  • Fähigkeit, selbstständig und im Team zu arbeiten
  • Exzellente Kommunikationsfähigkeiten in Englisch sind erforderlich, sowohl schriftlich als auch mündlich; Deutschkenntnisse sind von Vorteil

Wir bieten:

  • Einbettung in eine interdisziplinäre, internationale Forschungsgruppe und ein großes nationales Konsortium mit dem gemeinsamen Ziel, offene und FAIR-Dienste, Unterstützung und Schulungen für die Forschungsgemeinschaft zu entwickeln
  • Individuelle Qualifizierungs- und Entwicklungsmaßnahmen
  • Ein familienfreundliches Arbeitsumfeld mit einer Vielzahl von Angeboten für Familien
  • Universitäre Gesundheitsförderung und ein breites Angebot an Hochschulsportaktivitäten
  • Vergütung nach den Bestimmungen des Tarifvertrags für den öffentlichen Dienst der Länder (TV-L) nach Entgeltgruppe E13 – abhängig von den persönlichen Qualifikationen des Kandidaten – einschließlich einer besonderen jährlichen Zahlung gemäß dem Tarifvertrag

Die endgültige Vollzeitäquivalenz (FTE) hängt von der offiziellen Bekanntgabe der Verlängerung des Projekts ab. Die Position soll am 07.08.2026 beginnen und bis zu einem Jahr dauern. Diese Position ist als Vertretung für Mitarbeiter gedacht, die in Elternzeit gehen. Bewerber mit Schwerbehinderungen werden bei gleicher Qualifikation und Eignung bevorzugt.

Postdoc / Semantic Data Architect for Virus Database (m/f/d) Arbeitgeber: Friedrich-Schiller-Universität Jena

Die Friedrich-Schiller-Universität Jena ist ein hervorragender Arbeitgeber, der eine dynamische und innovationsgetriebene Arbeitsumgebung bietet. Mit einem starken Fokus auf Forschung und Lehre ermöglicht die Universität ihren Mitarbeitern, in einem internationalen und interdisziplinären Umfeld zu arbeiten, während sie gleichzeitig von einem familienfreundlichen Arbeitsklima und umfangreichen Unterstützungsangeboten profitiert. Die Möglichkeit zur persönlichen und beruflichen Weiterentwicklung wird durch die enge Zusammenarbeit mit führenden Forschungsinstitutionen und innovativen Unternehmen gefördert.

F

Kontaktdaten:

Friedrich-Schiller-Universität Jena Recruiting-Team

Wir glauben, dass du diese Fähigkeiten brauchst, um Postdoc / Semantic Data Architect for Virus Database (m/f/d) mit Bravour zu bestehen

Metadata Modelling
Ontology Engineering
Knowledge Graph Design
Data Modeling
Schema Design
Programming Skills
Python