Scientist in Computational Biology

Das Deutsche Krebsforschungszentrum (DKFZ) ist eines der größten Krebsforschungszentren Europas. "Forschung für ein Leben ohne Krebs" ist die Mission unserer weltweit führenden Wissenschaftler und aller Teammitglieder. Das DKFZ ist ein Ort, an dem die hellsten Köpfe mutige Ideen verfolgen und Antworten auf wegweisende wissenschaftliche Fragen durch Zusammenarbeit, Innovation und Erkundung in vielen Disziplinen suchen. Wir bieten ein dynamisches Umfeld, das Exzellenz mit modernster Technologie, hochmodernen Infrastrukturen und einem globalen wissenschaftlichen Netzwerk fördert.

Die Precision Sarcoma Research Group am Deutschen Krebsforschungszentrum und dem Nationalen Centrum für Tumorerkrankungen Heidelberg (Leitung: Dr. Priya Chudasama) sucht zum nächstmöglichen Zeitpunkt einen Wissenschaftler in der Computational Biology. Wir suchen einen Computational Biologen, der sich den Bemühungen des Konsortiums "DECIPHER‑M: Deciphering Metastasis with Multimodal Artificial Intelligence Foundation Models" anschließt. Dieses 5-jährige Konsortium wird vom Bundesministerium für Bildung und Forschung (BMBF) im Rahmen der "Großen unbeantworteten Fragen in der Krebsforschung" im Rahmen der Nationalen Dekade gegen Krebs gefördert. Das DECIPHER‑M-Konsortium ist eine multi-institutionelle Initiative zur Transformation des Verständnisses und der klinischen Behandlung von Metastasen durch die Erstellung von Grundmodellen unter Verwendung routinemäßig gesammelter klinischer Daten, einschließlich Pathologie-Bildern, Radiologie-Bildern, elektronischen Gesundheitsakten und Multi-Omics-Daten. Diese Position bietet eine spannende Gelegenheit, an der Schnittstelle von Krebsbiologie, räumlicher Multi-Omics und künstlicher Intelligenz zu arbeiten.

Ihre Aufgaben

• Entwicklung und Implementierung von computergestützten Pipelines zur Analyse und Integration von räumlichen Multi-Omics- und anderen multimodalen Datensätzen.
• Entwurf und Feinabstimmung von Machine Learning- und Deep Learning-Modellen zur Extraktion bedeutungsvoller Muster und Vorhersage des metastatischen Verhaltens.
• Enge Zusammenarbeit mit Experimentalisten zur mechanistischen Analyse multimodaler Signaturen zur Identifizierung diagnostischer oder prognostischer Biomarker oder therapeutischer Ziele.
• Leitung der kollaborativen Initiative und Kommunikation der Ergebnisse in gemeinsamen Sitzungen, Publikationen und auf internationalen Konferenzen.
• Unterstützung bei der Betreuung von Teammitgliedern, die rechnergestützte Aufgaben übernehmen.

Ihr Profil

• Masterabschluss oder gleichwertig in Bioinformatik, Computational Biology, Krebsbiologie oder ähnlichem.
• Starker Hintergrund in der Analyse und Integration großangelegter Bulk-Multi-Omics-Datensätze; Erfahrung in Einzelzell- und räumlichen Omics-Ansätzen wird als Vorteil angesehen.
• Beherrschung von Programmiersprachen wie R und Python, Bash-Skripting und Deep Learning-Frameworks.
• Fähigkeit, Daten von Sequenzierungsanlagen oder öffentlichen Ressourcen zu erwerben und zu verarbeiten, mit HPCs zu arbeiten, bestehende Pipelines (in-house oder nf-core) auszuführen und anzupassen sowie neue zu entwickeln.
• Beherrschung des Aufbaus und der Feinabstimmung von Machine Learning- und Deep Learning-Modellen zur biologischen Datenanalyse.
• Starke Publikationsbilanz, einschließlich Hauptautorschaften, mit Erfahrung in der kollaborativen Forschung und der Betreuung von Studierenden oder Praktikanten.
• Umfassendes Wissen über Krebsbiologie und Krebsgenomik, das durch rigorose Literaturrecherche aufrechterhalten wird und auf die Dateninterpretation und Projektentwicklung angewendet wird.
• Nachgewiesene Fähigkeit, sowohl unabhängig als auch im Team zu arbeiten, mit hoher Eigeninitiative, starkem Arbeitsethos und teamorientierter Denkweise.

Die Bewerbungen müssen einen Lebenslauf, ein Anschreiben, eine vollständige Liste der Publikationen, Referenzen oder Empfehlungsschreiben sowie das erwartete Verfügbarkeitsdatum enthalten. Unvollständige Bewerbungen werden nicht berücksichtigt. Bitte bewerben Sie sich ausschließlich über das Bewerbungsportal. Bei Fragen senden Sie bitte eine E-Mail an priya.chudasama@nct-heidelberg.de.

Wir bieten

• Exzellente Rahmenbedingungen: modernste Ausstattung und Möglichkeiten für internationales Networking auf höchstem Niveau.
• 30 Tage Urlaub pro Jahr.
• Flexible Arbeitszeiten.
• Vergütung nach TV-L inkl. betrieblicher Altersvorsorge und vermögenswirksamen Leistungen.
• Möglichkeit der Teilzeitarbeit.
• Familienfreundliches Arbeitsumfeld.
• Nachhaltige Anreise zur Arbeit: subventioniertes Deutschland-Ticket.
• Entfalten Sie Ihr volles Potenzial: gezielte Angebote für Ihre persönliche Entwicklung zur Weiterentwicklung Ihrer Talente.
• Unser Programm für betriebliches Gesundheitsmanagement bietet einen ganzheitlichen Ansatz für Ihr Wohlbefinden.

Kontakt: Dr. Priya Chudasama, Telefon: +49 6221 42 1600. Die Stelle ist zunächst auf 1 Jahr befristet mit der Möglichkeit der Verlängerung. Bewerbungsfrist: 20.12.2025. Bewerbungen per E-Mail können nicht akzeptiert werden. Bitte beachten Sie auch, dass wir Bewerbungen, die per Post eingereicht werden, nicht zurücksenden können.

Sind Sie interessiert? Dann werden Sie Teil des DKFZ und helfen Sie uns, zu einem Leben ohne Krebs beizutragen! Bewerben Sie sich jetzt.

Wir sind überzeugt, dass ein innovatives Forschungs- und Arbeitsumfeld von der Vielfalt seiner Mitarbeiter profitiert. Daher begrüßen wir Bewerbungen von talentierten Menschen, unabhängig von Geschlecht, kulturellem Hintergrund, Nationalität, Ethnie, sexueller Identität, körperlicher Fähigkeit, Religion und Alter. Menschen mit schweren Behinderungen werden bevorzugt, wenn sie die gleiche Eignung aufweisen.

Hinweis: Wir unterliegen den Vorschriften des Infektionsschutzgesetzes (IfSG). Daher müssen alle unsere Mitarbeiter einen Immunitätsnachweis gegen Masern erbringen.

Deutsches Krebsforschungszentrum | Im Neuenheimer Feld 280 | 69120 Heidelberg | www.dkfz.de