Postdoc in ecology and evolution of plasmids in polar waters at HIFMB (f/d/m)

Hintergrund

Unsere Gruppe hat umfangreiche Erfahrungen in der Softwareentwicklung und marinen mikrobiellen Ökologie und ist ein Experte für Omics-Datentypen und -strategien. Wir haben kürzlich maschinelle Lernwerkzeuge entwickelt, um Plasmide aus metagenomischen Assemblierungen zu gewinnen und deren Ökologie und Evolution im menschlichen Darm zu charakterisieren (Nature). Der Hauptzweck dieses Projekts besteht darin, unser Wissen zu übertragen, um Plasmide in marinen Systemen zu untersuchen, ihre Vielfalt und Biogeographie zu charakterisieren und computergestützte Einblicke in ihren Beitrag zum mikrobiellen Stoffwechsel und ihre Rolle bei mikrobiellen Reaktionen auf Umweltveränderungen zu gewinnen.

Wir suchen einen motivierten Kollegen, der von mikrobieller Evolution und Stoffwechsel inspiriert ist, begeistert ist, intensiv mit einer Gruppe internationaler Wissenschaftler mit hohen Standards zu arbeiten, und von einer Erfahrung am Helmholtz-Institut für Funktionelle Marine Biodiversität (HIFMB) profitieren wird, einer jungen Institution mit vielfältigen Forschungsprogrammen in Norddeutschland, die Zugang zu einem enormen Fachwissen in der marinen Mikrobiologie durch das Alfred-Wegener-Institut für Polar- und Meeresforschung, das Institut für Chemie und Biologie des Meeres (ICBM) an der Universität Oldenburg und das Max-Planck-Institut für marine Mikrobiologie hat.

Dies ist eine rein rechnerische Arbeit, aber offen für Wet-Lab-Übersetzungen für weitere Experimente, was unsere Gruppe sehr interessiert.

Ihre Aufgaben

• Erstellen von Workflows zur Gewinnung von Plasmiden aus marinen Metagenomen und Organisieren dieser in Plasmidsysteme
• Vergleichen von Plasmidgenomen mit gut untersuchten aus marinen Systemen und anderen Biomen
• Identifizieren von zusätzlichen metabolischen Genen in Plasmiden und Vergleichen mit dem metabolischen Potenzial, das in bakteriellen und archaealen Chromosomen gefunden wird

Ihr Profil

• Doktorat in Mikrobiologie, mikrobieller Ökologie, Bioinformatik oder anderen relevanten Bereichen
• Nachweisbare wissenschaftliche Produktivität durch Veröffentlichungen in internationalen Fachzeitschriften

Bevorzugte Qualifikationen und Fähigkeiten

• Umfassendes Verständnis von Plasmiden und/oder anderen mobilen genetischen Elementen, mikrobieller Evolution und mikrobieller Ökologie
• Erfahrung mit modernen Omics-Datentypen und -strategien
• Fließende Kenntnisse der UNIX-Terminalumgebung und der Arbeit mit großen und komplexen Datensätzen
• Engagement für Prinzipien und Praktiken der offenen Wissenschaft
• Ein starkes Verlangen, der Gesellschaft und der Forschungsgemeinschaft etwas zurückzugeben
• Sehr gute Englischkenntnisse (ungefähr entsprechend dem CEFR-Niveau C1)

Weitere Informationen

• Unser wissenschaftlicher Erfolg – hervorragende Forschungszusammenarbeit und Kooperation – intra-institutell, national und international, interdisziplinäre Entwicklungsmöglichkeiten – am Arbeitsplatz und in Richtung anderer Positionen
• Ein internationales Umfeld – täglicher Kontakt mit Menschen aus der ganzen Welt
• Flexible Arbeitszeiten
• Gesundheitsförderung und Unternehmensfitness mit Hansefit und Wellhub
• Unterstützungsdienste und eine Kultur der Vereinbarkeit von Beruf und Familie
• Betriebliche Altersvorsorge (VBL)

AWI schätzt Vielfalt und fördert aktiv die Geschlechterparität sowie ein offenes, inklusives Umfeld, das Chancengleichheit bietet. Wir sind überzeugt, dass vielfältige Teams und verschiedene Perspektiven unsere Arbeit und unsere tägliche Zusammenarbeit bereichern. In einem kontinuierlichen Prozess des Lernens und der Reflexion streben wir an, dass alle unsere Mitarbeiter sie selbst sein können und ein Gefühl der Zugehörigkeit empfinden. Wir begrüßen Bewerbungen von qualifizierten Personen unabhängig von binären und nicht-binären Geschlechtern, Rasse und Nationalität, ethnischem und sozialem Hintergrund, Religion, Alter, körperlichen Fähigkeiten, Neurodivergenz, sexueller Orientierung und anderen Identitäten. Bewerber mit Behinderungen werden bei gleichwertigen Qualifikationen bevorzugt. AWI fördert die Vereinbarkeit von Beruf und Familie auf verschiedene Weise und hat aufgrund dieses Engagements mehrere Auszeichnungen erhalten. Und als neues internationales Mitglied unseres Teams können Sie sicher sein, dass wir Ihnen helfen werden, sich einzuleben. Unser Family Office und International Office unterstützen Sie gerne, sogar bevor Sie bei AWI anfangen.

Dieses Forschungszentrum ist Teil der Helmholtz-Gemeinschaft Deutscher Forschungszentren. Mit mehr als 42.000 Mitarbeitern und einem Jahresbudget von über 5 Milliarden Euro ist die Helmholtz-Gemeinschaft die größte wissenschaftliche Organisation Deutschlands.