PhD Position in Experimental Single-Cell Genomics - RNA Regulation in Development and Disease ([...]

Vollzeit – 39 Std./Woche

Neuherberg bei München

Teilweise Home Office möglich

Am Helmholtz München entwickeln wir bahnbrechende Lösungen für eine gesündere Gesellschaft in einer sich schnell verändernden Welt. Wir glauben, dass vielfältige Perspektiven Innovationen vorantreiben. Durch starke Partnerschaften beschleunigen wir den Transfer neuer Ideen aus dem Labor in die Praxis und verbessern das Leben.

Das Cortés López Labor am Helmholtz München, eingebettet im Computational Health Center und eng verbunden mit dem LMU Kinderkrankenhaus (Dr. von Hauner Kinderkrankenhaus), untersucht, wie RNA-Regulation und alternatives Spleißen die zelluläre Plastizität in Entwicklung und Krankheit prägen. Durch die Kombination von Long-Read- und Einzelzell-Transkriptomik mit multimodalen Datenintegrationen und KI-basiertem Modellieren zielen wir darauf ab, RNA-Programme aufzudecken, die die Gesundheit und Krankheit von Kindern antreiben.

Das Projekt ist im Deutschen Zentrum für Kinder- und Jugendgesundheit (DZKJ) eingebettet und bietet direkten Zugang zu klinisch annotierten pädiatrischen Proben und patientenabgeleiteten experimentellen Modellen. Diese einzigartige Integration von Genomik, Computation und klinischer Expertise gewährleistet sowohl mechanistische Tiefe als auch starke medizinische Relevanz.

Wir suchen einen hochmotivierten Doktoranden (f/m/x) in Molekularbiologie / Experimenteller Genomik, um dieses interdisziplinäre Forschungsprogramm zu unterstützen.

Ihre Aufgaben

• Untersuchung der RNA-Spleißregulation in Entwicklungs- und pädiatrischen Krankheitskontexten innerhalb eines kollaborativen, translationalen Forschungsumfelds.
• Enger Austausch zwischen experimentellen und computergestützten Disziplinen zur iterativen Verfeinerung des Studiendesigns und zur Übersetzung der Ergebnisse in biologisch sinnvolle Erkenntnisse.
• Generierung und Analyse von Einzelzell- und Long-Read-Transkriptomdaten aus pädiatrischen Geweben, Organoidmodellen und Krankheitsproben.
• Anwendung und Weiterentwicklung von Multi-Omik-Protokollen, die Transkriptomik mit Zelloberflächenproteomik und gezieltem Genotyping kombinieren.
• Entwurf und Durchführung von Störungs-, Co-Kultur- oder mikroenvironment-fokussierten Experimenten zur funktionalen Untersuchung der RNA-Regulation.

Ihr Profil

• Master-Abschluss in Molekularbiologie, Biomedizinischen Wissenschaften, Genetik oder einem verwandten Bereich.
• Starkes Interesse an RNA-Biologie, Entwicklung und Forschung zu pädiatrischen Krankheiten.
• Exzellente Kommunikationsfähigkeiten und die Fähigkeit, in einem multidisziplinären Team zusammenzuarbeiten.
• Wissenschaftliche Neugier, Initiative und Motivation, um in einem translationalen Forschungsumfeld erfolgreich zu sein.

Wünschenswerte Qualifikationen

• Erfahrung mit primären Zellen, Organoiden oder Einzelzellansätzen ist sehr wünschenswert.
• Erfahrung mit Long-Read-Sequenzierungstechnologien (z.B. ONT, PacBio) oder Störungs-/genetischen Screening-Ansätzen (CRISPR, KO/KD) ist von Vorteil.

Wenn Sie alle Anforderungen erfüllen, können Sie möglicherweise eine Gehaltsstufe von bis zu E 13 50% erhalten. Die sozialen Leistungen basieren auf dem Tarifvertrag für den öffentlichen Dienst (TVöD). Die Stelle hat eine (anfängliche) Befristung von 3 Jahren, kann jedoch unter bestimmten Umständen verlängert werden.

Leistungen

• Karriereentwicklung: Postdoc-Programm, wissenschaftliche Schulungen & Karrierezentrum mit maßgeschneiderten Angeboten
• Wissenschaftliche Ressourcen: Modernste Infrastruktur und Kernanlagen
• Erholung: 30 Tage Jahresurlaub, Flexi-Tage sowie Feiertage
• Internationaler Mitarbeiterservice: Unterstützung bei Umzugs- und Integrationsprozessen in Deutschland
• Gesundheitsförderung: Sport, Betriebsarzt, Initiativen zur psychischen Gesundheit

Interessiert an einer Bewerbung? Wenn Sie Fragen haben, wenden Sie sich gerne an Mariela Cortés López, die Ihnen gerne weiterhilft. Unsere Rekrutierung ist dezentralisiert – Ihre Bewerbung wird direkt von der Fachabteilung geprüft, in der Sie zukünftig arbeiten könnten.

Bitte senden Sie Ihre Bewerbung ausschließlich über unser Online-Antragssystem und mit den folgenden Unterlagen:

• Kontaktdaten von mindestens zwei Referenzen
• Lebenslauf
• Ein kurzes Motivationsschreiben

Wir setzen uns für die Förderung einer Kultur der Vielfalt ein und begrüßen Bewerbungen von talentierten Menschen unabhängig von Geschlecht, kulturellem Hintergrund, Nationalität, Ethnie, sexueller Identität, körperlichen Fähigkeiten, Religion oder Alter. Qualifizierte Bewerber mit körperlichen Behinderungen werden bevorzugt.

Erfahren Sie mehr über Vielfalt am Helmholtz München.

Helmholtz München Deutsches Forschungszentrum für Gesundheit und Umwelt (GmbH) Institut für Computational Biology Ingolstädter Landstr. 185 764 Neuherberg