Postdoctoral Researcher in Bioimaging Data Storage and Management in Huisken Lab

Die Multiscale Biology Group von Jan Huisken an der Georg-August-Universität Göttingen ist ein Pionier der Lichtblattmikroskopie-Technologie und hat kürzlich das Flamingo-Projekt für teilbare Mikroskope als innovativen Ansatz etabliert, um einer großen Gemeinschaft von Forschern Zugang zu hochmodernen Bildgebungsverfahren zu ermöglichen. Das Projekt bietet eine einzigartige Gelegenheit, Bildprotokolle, Metadatenannotationen, Bilddateiformate und (remote) Bilddatenverarbeitung in Zusammenarbeit mit dem NFDI4BioImage-Konsortium zu standardisieren.

Um eine hochzuverlässige Bilddatengenerierung und -verarbeitung mit diesen tragbaren, modularen und anpassbaren Mikroskopen zu ermöglichen, suchen wir nun einen Postdoctoral Researcher in Bioimaging Data Storage and Management (f/m/d). Diese Position soll bis Juli 2025 besetzt werden. Die reguläre Arbeitszeit beträgt derzeit 39,8 Stunden pro Woche. Der Arbeitsvertrag ist befristet. Gehalt: Entgeltgruppe 13 TV-L.

In dieser Position werden Sie:

• Originalforschung im Bereich des Bioimaging-Datenmanagements durchführen, mit einem Fokus auf dezentralisierte, remote Bildgebung und die Integration von OME-Zarr mit Flamingo.
• Das NFDI4BioImage-Netzwerk nutzen, um Flamingo-Mikroskope als Plattform für standortunabhängige Bildakquisition, Speicherung und Sharing-Lösungen zu implementieren.
• Lokale Infrastrukturen analysieren und messen sowie optimierte Workflows in modernen Bildgebungsversuchen entwickeln und evaluieren.
• Testfälle studieren, um zu demonstrieren, wie FAIR-Prinzipien effektiv in der Bioimaging-Forschung umgesetzt werden können.
• Dokumentationen und Richtlinien schreiben, um die Einführung von FAIR-Konzepten innerhalb der Bioimaging-Community zu erleichtern.
• Zur Entwicklung neuer Forschungsprojekte und Initiativen im Bereich der Bioimaging-Datenlagerung, -verwaltung und -weitergabe beitragen.
• Forschung und Lehre im Bereich der Bildakquisition, -verwaltung und -visualisierung unterstützen.
• Forschungsergebnisse auf Konferenzen und Workshops präsentieren.
• Forschungsergebnisse in erstklassigen Fachzeitschriften veröffentlichen.

Ihr Profil:

• Promotion in Informatik, Computerwissenschaften oder verwandten Bereichen.
• Starkes Forschungsinteresse an moderner Bioimaging, Bildakquiseworkflows und Datenformaten.
• Nachgewiesene Erfahrung in der Softwareentwicklung mit Schwerpunkt auf Datenspeicherlösungen und cloudbasierten Systemen.
• Starke Expertise in Python. Kenntnisse in Java, C / C++ oder ähnlichen Programmiersprachen sind wünschenswert.
• Verständnis von Hochleistungs- und/oder Cloud-Computing-Plattformen, skalierbaren Workflows und großen Datensätzen.
• Erfahrung mit Linux, macOS oder Unix-basierten Systemen.
• Erfahrung in der biomedizinischen Bildanalyse ist wünschenswert.
• Starke Problemlösungsfähigkeiten und die Fähigkeit, innovative Lösungen für die Bioimaging-Community zu schaffen.
• Fähigkeit zur effektiven Zusammenarbeit in einem verteilten, internationalen Team und komplexe technische Konzepte klar in Englisch zu kommunizieren.

Die Universität Göttingen ist ein Arbeitgeber, der Chancengleichheit fördert, mit besonderem Schwerpunkt auf der Förderung von Karrierechancen für Frauen. Qualifizierte Frauen werden daher nachdrücklich ermutigt, sich in Bereichen zu bewerben, in denen sie unterrepräsentiert sind. Die Universität hat sich verpflichtet, eine familienfreundliche Institution zu sein und unterstützt ihre Mitarbeiter dabei, Arbeit und Familie in Einklang zu bringen. Die Mission der Universität besteht darin, eine größere Anzahl schwerbehinderter Personen zu beschäftigen. Bewerbungen von schwerbehinderten Personen mit gleichwertigen Qualifikationen werden bevorzugt behandelt.

Wenn Sie ein motivierter und talentierter Forscher mit einer Leidenschaft für Bioimaging-Datenlagerung und -verwaltung sind, senden Sie bitte Ihre Bewerbung.