Principal Scientist - Omics Engineering

Spannende Gelegenheit bei einem globalen Pharmaunternehmen mit Sitz in Deutschland.

Aufgaben & Verantwortlichkeiten

• Als Mitglied des Computational Biology Data and Infrastructure-Teams tragen Sie zur Generierung standardisierter und hochwertiger Datenressourcen aus Omics-Datenquellen bei.
• In enger Zusammenarbeit mit den Teams der Computational Biology unterstützen Sie die Aktivierung und Integration von Omics-Daten, die den gesamten Datenlebenszyklus vom konzeptionellen Design bis zu gebrauchsfertigen abgeleiteten Daten abdecken, die den FAIR-Prinzipien entsprechen.
• Sie treiben die Wertschöpfung voran, indem Sie die Bereitstellung der richtigen Datenressource für die Teams der Computational Biology sicherstellen.
• Als Teil eines erfahrenen Teams übernehmen Sie die Verantwortung für komplexe Datenverarbeitungs-Pipelines für multimodale Omics-Datenquellen und tragen zur Entwicklung unserer Datenressourcen bei, einschließlich der Erstellung und Optimierung von Computational Biology-Pipelines sowie der Datenbankentwicklung.
• Da Datenquellen häufig extern zum Unternehmen sein können, sind Sie verantwortlich für die Festlegung der Standardisierungsprozesse zur Homogenisierung der Datenqualität und -formate.
• Sie arbeiten mit unserem Genomik-Labor zusammen, um unseren NGS-End-to-End-Workflow zu optimieren.
• Sie arbeiten eng mit verschiedenen Stakeholdern zusammen, um unsere Fähigkeiten zur Modellierung, Integration und Verarbeitung von Daten kontinuierlich zu verbessern.
• Darüber hinaus konzipieren und treiben Sie die Implementierung skalierbarer innovativer Softwarelösungen für die Analyse und Visualisierung von Daten vor, basierend auf den Bedürfnissen der Benutzer innerhalb unserer Abteilung.
• Sie tragen zur operativen Exzellenz bei, indem Sie unsere täglichen Abteilungsprozesse verbessern.

Zusätzliche Aufgaben & Verantwortlichkeiten für den Principal Scientist

• Als Principal Scientist konzipieren und treiben Sie die Implementierung skalierbarer innovativer Softwarelösungen für die Analyse und Visualisierung von Daten vor, basierend auf den Bedürfnissen der Benutzer innerhalb unserer Abteilung.
• Sie sind verantwortlich für das Stakeholder-Management der Computational-Teams und ermöglichen eine enge Zusammenarbeit durch Förderung positiver Interaktionen.
• Darüber hinaus übernehmen Sie die Leitung großer Projekte, indem Sie innovative Lösungen und modernste Methoden vorschlagen, die in unsere Infrastruktur integriert werden.

Anforderungen

• PhD in Informatik, Software Engineering, Computational Biology, Data Science oder einem verwandten Bereich mit mehreren Jahren relevanter Erfahrung, vorzugsweise in der Biotechnologie- und/oder Pharmaindustrie.
• Umfangreiche Erfahrung im Umgang mit Omics-Datentypen, insbesondere in Bezug auf Datenspeicherung, -verarbeitung und -pipeline für die Bereitstellung von sofort verfügbaren abgeleiteten Daten.
• Kenntnisse über Datenintegrationskonzepte wie semantische Datenintegration, Datenmodellierung (z. B. Ontologien und Taxonomien), Wissensgraphen und Daten-FAIRifizierung.
• Robuste Software-Engineering-Fähigkeiten wie Testing, Continuous Integration und Continuous Delivery sowie ausgezeichnete Programmierkenntnisse (Python, R, MatLab).
• Analytische und innovative Denkweise mit ausgeprägten Problemlösungsfähigkeiten.
• Starke Kommunikationsfähigkeiten.
• Sehr gute Englischkenntnisse (mündlich und schriftlich).

Zusätzliche Anforderungen für den Principal Scientist

• Praktische Erfahrung mit Orchestrierungsframeworks für Datenverarbeitungs- und Analyse-Pipelines, idealerweise Nextflow.
• Berufserfahrung mit SQL- und NoSQL-Datenbanken.
• Umfangreiche Kenntnisse über Datenmanagementkonzepte und Erfahrung in verteilten Systemen und Cloud-Computing (AWS).
• Projektleitungskompetenzen.
• Nachweisbare Erfahrung im Management großer Stakeholder.