Doctoral Researcher Position (m/f/div) in Metagenomics

Job-ID 04/2026

Am Leibniz-Institut für Naturstoff-Forschung und Infektionsbiologie (Leibniz-HKI) untersuchen wir die Pathobiologie von Mikroorganismen und entwickeln neue, auf Naturstoffen basierende Wirkstoffe zur Behandlung von Infektionskrankheiten.

Die Position ist zunächst auf vier Jahre befristet.

Ihre Mission

Die Abteilung Microbiome Dynamics (MBD) trägt mit computergestützten Methoden zur Entwicklung personalisierter mikrobiom-basierter Strategien bei, um die Erkennung, Überwachung, Behandlung und Prävention von menschlichen Krankheiten zu unterstützen. MBD koordiniert derzeit das EU-geförderte Konsortium MiCCrobioTAckle, das BMBF-geförderte Konsortium PerMiCCion und ist aktiver Teilnehmer an den EU-geförderten Konsortien FOODGUARD und NUTRIMMUNE sowie am Exzellenzcluster „Balance of the Microverse“, gefördert von der Deutschen Forschungsgemeinschaft, und dem Konsortium SynThera, gefördert von der Carl Zeiss Stiftung.

Wir suchen einen hervorragenden und begeisterten Doktoranden mit starkem Interesse an computergestützter Mikrobiomforschung. Der spezifische Fokus des Doktorandenprojekts wird auf die Fähigkeiten und Interessen des Kandidaten abgestimmt und wird mit den Zielen der oben genannten Konsortien in Einklang stehen. Ein zentraler Bestandteil der Arbeit wird die computergestützte Integration von Multi-Omics-Datensätzen sowohl aus mikrobiellen Gemeinschaften als auch vom Wirt sein, mit dem Ziel, die systemischen Auswirkungen von Darmbakterien auf die menschliche Physiologie zu entschlüsseln.

Im Rahmen dieser Position werden Sie an der Schnittstelle zwischen dem Darmmikrobiom, der Ernährung und dem Immunsystem arbeiten, um die Rolle von Darmbakterien bei verschiedenen Krankheiten zu untersuchen, einschließlich, aber nicht beschränkt auf Krebs, Stoffwechselstörungen, Alterung und Infektionen. Sie werden mit renommierten Wissenschaftlern in einem interdisziplinären und internationalen Umfeld zusammenarbeiten, unterstützt durch modernste Infrastruktur. Gemeinsam wollen wir die Wissenschaft vorantreiben und zu einer gesünderen, saubereren und gerechteren Gesellschaft beitragen, wobei wir akademische Exzellenz in einem kollegialen und integrativen Umfeld fördern.

Ihr Profil

• Ein starkes Interesse an der Durchführung von kooperativer Forschung zu dem oben skizzierten Thema ist von größter Bedeutung.
• Kandidaten sollten daran interessiert sein, an den Grenzen mehrerer Forschungsbereiche zu arbeiten.
• Masterabschluss in Computational Biology, Bioinformatik, Systembiologie, Bioengineering, Chemieingenieurwesen oder einem verwandten Fachgebiet.
• Kenntnisse und Erfahrungen in der Analyse von Metagenomik, untargeted Metabolomics oder anderen biologischen Hochdurchsatzdatensätzen.
• Kenntnisse statistischer Methoden im Kontext biologischer Systeme.
• Erfahrung mit Programmierung (Python, Perl, C++, R).
• Gut ausgeprägte kollaborative Fähigkeiten.

Wir bieten:

Die erfolgreichen Kandidaten werden in der Abteilung Microbiome Dynamics von Prof. Gianni Panagiotou am Leibniz-HKI in einem internationalen, dynamischen Team und einer „Open-Door“-Atmosphäre mit Zugang zu modernsten rechnergestützten Ressourcen untergebracht. Wir bieten ein internationales und multidisziplinäres Umfeld mit starker Expertise in den vorgeschlagenen Forschungsfeldern. Die Gruppe besteht aus etwa 15–20 Mitgliedern auf unterschiedlichen Ebenen der Seniorität.

Das Gehalt wird gemäß dem deutschen TV-L (Tarifvertrag für den öffentlichen Dienst) gezahlt. Als Arbeitgeber, der Chancengleichheit fördert, setzt sich das Leibniz-HKI dafür ein, den Anteil weiblicher Wissenschaftlerinnen zu erhöhen und ermutigt daher insbesondere diese zur Bewerbung.

Kontaktdaten

Prof. Dr. Gianni Panagiotou | Bewerbungen

Das Leibniz-HKI ist stolz darauf, ein Arbeitgeber zu sein, der Chancengleichheit fördert und Vielfalt sowie Inklusion am Arbeitsplatz unterstützt. Es zielt darauf ab, den Anteil unterrepräsentierter Gruppen bei gleicher Eignung zu erhöhen. Alle qualifizierten Personen, unabhängig von Hautfarbe, Religion, Alter, Geschlecht, sexueller Orientierung, Geschlechtsidentität, nationaler Herkunft, Behinderung, Veteranenstatus oder anderer gesetzlich geschützter Klassifikationen, werden bei der Einstellung berücksichtigt.

Vollständige Bewerbungen in englischer Sprache sollten ein Anschreiben, einen Lebenslauf mit vollständiger Liste der Publikationen, eine kurze Darstellung der Forschungserfahrungen, ein Studienzertifikat / Transcript of Records und die Adressen von zwei möglichen Referenzen enthalten und über das Online-Bewerbungssystem des Leibniz-HKI eingereicht werden. Die Frist für die Ausschreibung ist der 28. Februar 2026, aber Bewerbungen werden fortlaufend geprüft.

Leibniz-Institut für Naturstoff-Forschung und Infektionsbiologie Adolf-Reichwein-Straße 23 | 07745 Jena