PostDoc (m/w/d)

Responsibilities

• Analyze and integrate single-cell RNA‑seq data from public and newly generated fibrosis datasets.
• Experimental design and analysis of longitudinal, spatial and multimodal measurements of fibrogenesis in a human ex vivo model.
• Identify spatial, multimodal niches with existing or newly developed tools.
• Set up reproducible analysis pipelines and environments to follow open science practices.

Ihr Aufgabenbereich

• Analyse und Integration von Einzelzell‑RNA‑Sequenzierungsdaten aus öffentlichen sowie neu generierten Fibrose‑Datensätzen.
• Experimentelle Planung und Auswertung longitudinaler, räumlicher und multimodaler Messungen der Fibrogenese in einem humanen ex vivo‑Modell.
• Identifikation räumlich‑multimodaler Nischen mithilfe bestehender oder neu entwickelter Werkzeuge.
• Einrichtung reproduzierbarer Analysepipelines und -umgebungen zur Einhaltung von Open‑Science‑Prinzipien.

Unsere Anforderungen

• Promotion in Bioinformatik, Computational Biology, Statistik oder verwandten Fächern.
• Fundierte Programmierkenntnisse in Python und Statistik.
• Erfahrung in scRNA‑seq Datenanalyse.
• Wünschenswert: Kenntnisse im Bereich der Single‑Cell‑RNAseq‑Datenintegration.
• Wünschenswert: Kenntnisse im Bereich Spatial Omics und Bilddaten‑Analyse.

Required

• PhD in Bioinformatics, Computational Biology, Statistics, or a related discipline.
• Solid programming skills in Python and statistical analysis.
• Experience in single‑cell RNA‑seq data analysis.
• Expertise in single‑cell RNA‑seq data integration (preferred).
• Familiarity with spatial omics and image data analysis (preferred).

Unser Angebot

• Sie haben die Möglichkeit, an der Mitgestaltung der Konzeption und Analyse eines einzigartigen longitudinalen, räumlichen und multimodalen Datensatzes menschlicher Gewebeproben mitzuwirken – von der Rohdatenverarbeitung bis zur Identifikation therapeutischer Zielstrukturen.
• Sie arbeiten eng mit Forschungsgruppen am Helmholtz Zentrum München, der Klinik der LMU sowie einem Industriepartner zusammen und erhalten Einblicke in die Rolle computergestützter Analysen für die klinische und translationale Forschung.
• Die Vergütung richtet sich nach dem Tarifvertrag für den Öffentlichen Dienst der Länder (TV‑L) einschließlich aller im Öffentlichen Dienst üblichen Zulagen.

Angebote und Leistungen des Arbeitgebers

• Fort- und Weiterbildungen
• Jobticket
• Betriebliche Altersvorsorge
• Vergünstigungen
• Kinderbetreuungsangebote
• Personalwohnraum (soweit verfügbar)
• Mobile Arbeit (bei Eignung)

Herr Dr.med. Gerckens, Michael
089 4400 73094

Bewerbungsformat

Bitte verwenden Sie das Online-Formular für Ihre Bewerbung.

Schwerbehinderte Bewerber (m/w/d) werden bei ansonsten im Wesentlichen gleicher Eignung bevorzugt.

Bitte beachten Sie, dass wir keine Fahrt- und Reisekosten erstatten können, die durch Vorstellungsgespräche entstehen.

Bitte haben Sie Verständnis dafür, dass postalische Bewerbungen nicht zurückgesendet, sondern datenschutzkonform vernichtet werden.

Für postalische Bewerbungen gilt auch der Datenverwendungshinweis!