Senior Data Engineer - Chemoinformatics

Um unser Team in Schwabenheim (nahe Mainz) zu unterstützen, suchen wir einen Senior Data Engineer - Chemoinformatics (m/w/d).

Ihre Verantwortlichkeiten und Aufgaben:

• Sie sind verantwortlich für die Implementierung, Verwaltung und Leitung der Schnittstelle zwischen Geschäft und IT im Bereich Chemoinformatik, einschließlich Prozess- und Datenanalyse.
• In dieser Position arbeiten Sie eng mit unseren Stakeholdern und Wissenschaftlern in den R&D-Teams für Arzneimittelentdeckung, Antiparasitika und Antiinfektiva sowie mit interdisziplinären IT-Entwicklungsteams (z.B. Datenwissenschaft, Datenbank, Produktteams) zusammen.
• Sie bieten rechnergestützte Anleitung und Lösungen zur Unterstützung bei der Lösung chemiebezogener Probleme.
• Zusammenarbeit mit den Entdeckungsteams für Tiergesundheit und menschliche Gesundheit zur Evaluierung, Anwendung, Optimierung und Visualisierung von maschinellen Lernmodellen für neuartige wissenschaftliche Fragestellungen (z.B. ADMET-Modelle).
• Implementierung, Koordination und Nutzung von maschinellen Lernansätzen zur Beschleunigung der Forschung und Fähigkeiten in neuen Bereichen, die für die Chemie in der Arzneimittelentdeckung und -entwicklung relevant sind.

Hauptverantwortlichkeiten:

• Zusammenarbeit mit unseren Teams für Arzneimittelentdeckung in der Tiergesundheit und menschlichen Gesundheit an mehreren innovativen Projekten zur Evaluierung, Analyse, Anwendung, Visualisierung und Optimierung bestehender maschineller Lernmodelle.
• Übersetzung von Geschäfts- und Benutzeranforderungen in geeignete Lösungen unter Verwendung der richtigen Werkzeuge in den Hochleistungsclustern (HPC) und cloudbasierten Infrastrukturen.
• Arbeiten mit IT-Entwicklungsteams zur Implementierung und Sicherstellung, dass sie die Spezifikationen vollständig verstehen.
• Arbeiten in verschiedenen interkulturellen lokalen und virtuellen globalen Teams in Zusammenarbeit mit Geschäftsvertretern und verschiedenen IT-Gruppen zur Bereitstellung innovativer Chemoinformatiklösungen bei der Entdeckung neuartiger Arzneimittel.
• Proaktive Koordination und Kommunikation zwischen den verschiedenen Geschäftsinteressengruppen, IT-Entwicklern und den unterstützenden Funktionen im gesamten interdisziplinären Team, einschließlich der Anpassung von Business Intelligence und Modellierungswerkzeugen.

Die primären Aktivitäten umfassen, sind aber nicht beschränkt auf:

• Leitung und Mitwirkung an der Entwicklung von Datenanalyse-Workflows und Chemoinformatik-Lösungen der nächsten Generation im Bereich maschinelles Lernen.
• Unterstützung und Partnerschaft mit Forschern der Arzneimittelentdeckung und externen Partnern bei der Planung, Analyse, Interpretation, Präsentation und Veröffentlichung vielfältiger chemischer und biologischer Datensätze.
• Verantwortung für die Analyse und Interpretation chemischer und biologischer Daten, Analyse und Test virtueller Screening-Daten sowie Unterstützung im Entscheidungsprozess der Projektteams für potenzielle Arzneimittelkandidaten.
• Zusätzlich Leitung, Entwicklung und Validierung prädiktiver Modelle, Zusammenarbeit mit multidisziplinären Teams und Beitrag zur Software- und Tool-Entwicklung.
• Bereitstellung von Chemoinformatikberatung und Softwaretraining für Forscher.
• Bereitstellung rechnergestützter Anleitung/Simulationen zur Unterstützung bei der Lösung chemiebezogener Probleme.
• Definition des Einsatzes von maschinellen Lernansätzen zur Verbesserung der Modellierungsfähigkeiten in neuen Bereichen, die für die chemiebezogene Arzneimittelentdeckung und -entwicklung relevant sind.

Detaillierte Aktivitäten:

• Datenanalyse und -interpretation: Verantwortlich für die Analyse und Interpretation chemischer und biologischer Daten mithilfe rechnergestützter Werkzeuge, Algorithmen und statistischer Techniken.
• Datenmining und -analyse: Extrahieren von bedeutenden Informationen aus chemischen (Biovia, Perkin Elmer Produkte) und biologischen Datenbanken (Activity Base, IDBS), um Muster, Beziehungen und Trends zu identifizieren, die bei der Entdeckung neuartiger chemischer Verbindungen und der Optimierung bestehender Moleküle helfen.
• Virtuelles Screening: Einsatz rechnergestützter Methoden zur effizienten Durchsuchung großer chemischer Datenbanken, um den Prozess der Arzneimittelentdeckung zu beschleunigen, indem potenzielle Arzneimittelkandidaten oder bioaktive Verbindungen identifiziert werden.
• Zusammenarbeit mit funktionsübergreifenden Teams weltweit an AI/ML-Initiativen. Kenntnisse zur Analyse von Modellen, Werkzeugen und Methoden in diesem Bereich wie Stardrop, MOE, RDKit, Spotfire, PyMOL usw. sind von Vorteil.
• Chemoinformatik-Softwareentwicklung: Beitrag zur Entwicklung von Softwaretools und Algorithmen, die auf die Verarbeitung, Analyse und Modellierung chemischer Daten zugeschnitten sind, um die Effizienz von Workflows, Datenmanagement und den Zugang zu leistungsstarken rechnergestützten Methoden für die wissenschaftliche Gemeinschaft zu verbessern.

Ihre Qualifikationen:

• Akademisches Niveau - z.B. abgeschlossenes Bachelor- oder Masterstudium in Chemoinformatik.
• Idealerweise ein Doktortitel in Lebenswissenschaften und ein starkes Hintergrundwissen in der Implementierung chemoinformatikbasierter Ansätze für die Arzneimittelentdeckung kleiner Moleküle.
• Erfahrung in der Implementierung chemoinformatikbasierter Ansätze für die Arzneimittelentdeckung kleiner Moleküle, einschließlich gängiger Werkzeuge wie Schrödinger LiveDesign, MOE, TorxMake, DataGrok und Hochdurchsatzplattformen von Biovia, Perkin Elmer und IDBS-Anbietern.
• Umfassende und breite Erfahrung in der computergestützten Chemie.
• Vertrautheit mit AWS-Cloud-Umgebungen und Big-Data-Ansätzen.
• Solide Programmierkenntnisse und Kenntnisse statistischer Methoden.
• Fließende schriftliche und mündliche Englisch- und Deutschkenntnisse.

Wir sind stolz darauf, ein Unternehmen zu sein, das den Wert der Zusammenführung vielfältiger, talentierter und engagierter Menschen schätzt. Der schnellste Weg zu bahnbrechenden Innovationen ist, wenn unterschiedliche Ideen in einem integrativen Umfeld zusammenkommen. Wir ermutigen unsere Kollegen, respektvoll die Denkweise des anderen herauszufordern und Probleme gemeinsam anzugehen. Wir sind ein Arbeitgeber, der Chancengleichheit bietet und uns verpflichtet hat, ein integratives und diverses Arbeitsumfeld zu fördern. Menschen mit schweren Behinderungen und deren Gleichgestellte werden bevorzugt behandelt, wenn sie gleich qualifiziert sind.

Erforderliche Fähigkeiten: Business Intelligence (BI), Chemoinformatik, datengetriebenes Entscheiden, Datenengineering, Daten-ETL, Datenmanagement, Datenwissenschaft, Datenvisualisierung, Arzneimittelentdeckungsprozess, IT-Projektlebenszyklus, maschinelles Lernen (ML), molekulare Analyse, multidisziplinäre Zusammenarbeit, Projektmanagement, PyMOL, Softwareentwicklung.

Bevorzugte Fähigkeiten: Datenanalyse, Datenmining, prädiktive Modellierung, Python (Programmiersprache), Structured Query Language (SQL).