Auf einen Blick
- Aufgaben: Entwickle innovative bioinformatische Methoden zur Analyse von Sequenzdaten für diagnostische Technologien.
- Unternehmen: ETH Zürich, ein führendes Forschungsinstitut mit interdisziplinärer Zusammenarbeit.
- Vorteile: Öffentliche Verkehrsmittel, Sportangebote, Kinderbetreuung und attraktive Altersvorsorge.
- Weitere Informationen: Vielfältige und inklusive Arbeitsumgebung mit Fokus auf Nachhaltigkeit.
- Warum dieser Job: Trage zur schnellen Diagnostik von Infektionskrankheiten bei und mache einen echten Unterschied.
- Qualifikationen: Doktorat in Bioinformatik, Informatik oder verwandten Bereichen mit Erfahrung in Sequenzanalyse.
Das prognostizierte Gehalt liegt zwischen 45000 - 65000 € pro Jahr.
Das Clinical Genomics-Team unter der Leitung von Dr. André Kahles am Biomedical Informatics Lab (BMI Lab) der ETH Zürich sucht einen hochmotivierten Postdoktoranden mit einem starken Hintergrund in Sequenz-Bioinformatik, Algorithmen und Datenstrukturen. Der erfolgreiche Kandidat wird Teil eines interdisziplinären Teams, das innovative Diagnosetechnologien auf Basis von Long-Read-Sequenzierung und Echtzeitanalyse von Sequenzen entwickelt.
Hintergrund des Projekts: Die schnelle und genaue Identifizierung bakterieller Infektionen bleibt eine große Herausforderung in der klinischen Praxis, insbesondere in Notfallsituationen, in denen eine verzögerte Diagnose zu suboptimaler oder verspäteter Behandlung und erhöhten Sterblichkeitsraten bei Erkrankungen wie Sepsis führen kann. Aktuelle Diagnosemethoden erfordern oft 24–72 Stunden, was zur empirischen Verwendung von Breitbandantibiotika und zur Entstehung antimikrobieller Resistenzen beitragen kann. Im Rahmen des RADIANT-Dx-Konsortiums entwickelt unser interdisziplinäres Team eine tragbare Diagnosetechnologie auf Basis von Long-Read-Sequenzierung, um eine schnelle transkriptomische Profilierung von Wirtsreaktionen und Pathogenen direkt aus Blutproben zu ermöglichen. Das Projekt integriert experimentelle und rechnergestützte Expertise, um eine Echtzeitanalyse von Sequenzen zu ermöglichen und klinisch umsetzbare Ergebnisse innerhalb von Stunden zu liefern.
Sie werden neuartige rechnergestützte Methoden für die Analyse von Long-Read-Sequenzierungsdaten entwickeln und implementieren, einschließlich der Analyse vor und nach der Basisanrufung, um die Entwicklung einer Diagnosetechnologie der nächsten Generation zu unterstützen.
Sie werden Algorithmen und statistische Modelle für die Echtzeitanalyse von transkriptomischen Daten von Wirten und Pathogenen entwerfen, mit einem Fokus auf robuste und skalierbare Ansätze für klinische Anwendungen.
Sie werden eng mit einem interdisziplinären Team von Bioinformatikern, Mikrobiologen, Klinikern und Ingenieuren an der ETH Zürich, der Universität Zürich und dem Universitätsspital Zürich zusammenarbeiten.
Sie werden zur Integration von Bioinformatikmethoden in ein translationales Forschungsprojekt beitragen, das darauf abzielt, schnelle und klinisch umsetzbare Diagnosen von Infektionskrankheiten zu ermöglichen.
Sie werden rechnergestützte Forschungsprojekte leiten, Ergebnisse in führenden wissenschaftlichen Zeitschriften veröffentlichen und zur Weiterentwicklung von Methoden in der mikrobiellen Genomik, der Analyse von Long-Read-Sequenzierungen und der angewandten rechnergestützten Biologie beitragen.
Profil: Sie sollten über einen Doktortitel in Computational Biology, Bioinformatik, Informatik, Statistik, angewandter Mathematik oder einem verwandten quantitativen Bereich verfügen, mit einem starken Hintergrund in Algorithmen, Datenstrukturen und statistischer Modellierung. Erfahrung in der Sequenzanalyse, mikrobiellen Genomik und Analyse von Long-Read-Sequenzierungsdaten ist sehr wünschenswert. Vertrautheit mit Signalverarbeitung oder angewandtem maschinellem Lernen ist von Vorteil. Sie sollten eine starke Motivation zeigen, innovative rechnergestützte Methoden zu entwickeln und zu interdisziplinärer Forschung mit potenziellen klinischen Auswirkungen beizutragen, idealerweise unterstützt durch eine solide Publikationsbilanz.
Wir bieten: Ihr Job mit Einfluss: Werden Sie Teil der ETH Zürich, die nicht nur Ihre berufliche Entwicklung unterstützt, sondern auch aktiv zu positiven Veränderungen in der Gesellschaft beiträgt. Sie können zahlreiche Vorteile erwarten, wie z.B. öffentliche Verkehrstickets und Carsharing, ein breites Sportangebot des ASVZ, Kinderbetreuung und attraktive Rentenleistungen.
Wir schätzen Vielfalt und Nachhaltigkeit: Im Einklang mit unseren Werten fördert die ETH Zürich eine inklusive Kultur. Wir setzen uns für Chancengleichheit ein, schätzen Vielfalt und pflegen ein Arbeits- und Lernumfeld, in dem die Rechte und die Würde aller Mitarbeiter und Studierenden respektiert werden. Nachhaltigkeit ist ein Kernwert für uns – wir arbeiten konsequent auf eine klimaneutrale Zukunft hin.
Neugierig? So sind wir auch. Wir freuen uns auf Ihre Online-Bewerbung, einschließlich der folgenden Dokumente:
- Forschungsantrag (ca. 2-3 Seiten)
- Lebenslauf
- Anschreiben/persönliche Erklärung einschließlich der Namen von drei Referenzen
Bitte beachten Sie, dass wir ausschließlich Bewerbungen akzeptieren, die über unser Online-Bewerbungsportal eingereicht werden. Bewerbungen per E-Mail oder Post werden nicht berücksichtigt.
Für weitere Informationen über das BMI Lab besuchen Sie bitte unsere Website.
Fragen zur Position richten Sie bitte per E-Mail an Dr. André Kahles (keine Bewerbungen).
Postdoctoral Researcher in Bioinformatics Arbeitgeber: Polytechnicpositions
ETH Zürich ist ein hervorragender Arbeitgeber, der nicht nur Ihre berufliche Entwicklung fördert, sondern auch aktiv zur positiven Veränderung in der Gesellschaft beiträgt. Mit einem interdisziplinären Team und einer Kultur der Vielfalt und Nachhaltigkeit bietet ETH Zürich zahlreiche Vorteile, darunter öffentliche Verkehrstickets, Sportangebote und attraktive Altersvorsorgeleistungen. Hier haben Sie die Möglichkeit, an innovativen Projekten zu arbeiten, die einen direkten klinischen Einfluss haben, und sich in einem unterstützenden Umfeld weiterzuentwickeln.
