Auf einen Blick
- Aufgaben: Entwickle innovative Methoden zur Erkennung neuartiger Erreger und analysiere komplexe Daten.
- Unternehmen: Robert Koch-Institut - ein internationales Team für Gesundheitsschutz.
- Vorteile: Fachliche Weiterentwicklung, spannende Projekte und ein dynamisches Arbeitsumfeld.
- Weitere Informationen: Flexible Arbeitszeiten und die Möglichkeit zur Teilnahme an internationalen Fachkonferenzen.
- Warum dieser Job: Trage aktiv zum Schutz der Gesundheit bei und arbeite an zukunftsweisenden wissenschaftlichen Fragestellungen.
- Qualifikationen: Abgeschlossenes Hochschulstudium in Naturwissenschaften oder verwandten Disziplinen, Promotion erwünscht.
Das prognostizierte Gehalt liegt zwischen 45000 - 57000 € pro Jahr.
Das Robert Koch-Institut - das sind ca. 1.500 Köpfe aus über 52 Nationen mit einem Ziel: Die Gesundheit der Menschen zu schützen. Wir erheben und analysieren Gesundheitsdaten, erkennen Risiken, beraten Politik und Fachwelt und entwickeln neue wissenschaftliche Methoden. Unsere Standorte sind in Berlin, Wildau und Wernigerode.
Die Mitarbeit erfolgt im Rahmen eines durch das BMG geförderten Projekts „MIRAI - Sicherstellung der Detektion bioterroristisch relevanter neuartiger Agenzien und synthetischer Wirkmittel in der veränderten Bedrohungslage“. Im Projekt sollen insbesondere Methoden zur Erkennung, Identifizierung und Charakterisierung unbekannter bakterieller und viraler Erreger und weiteren Agenzien aus komplexen Matrices und Metagenomdatensätzen entwickelt werden.
Ihre Aufgabe bei uns:
- Eigenverantwortliche Herstellung von NGS-Bibliotheken sowie selbstständige Durchführung von Illumina-Sequenzierungen (MiSeq) einschließlich Qualitätskontrolle der Bibliotheken und Sequenzierläufe.
- Integration, Interpretation und Validierung molekularbiologischer, mikrobiologischer und bioinformatischer Daten zur Charakterisierung neuartiger Erreger.
- Planung, Durchführung und wissenschaftliche Auswertung metagenomischer Analysen einschließlich der Entwicklung und Optimierung bioinformatischer Analysepipelines.
- Entwicklung und Anwendung KI-gestützter Verfahren zur Identifizierung und Charakterisierung unbekannter sowie neuartiger bakterieller Erreger aus komplexen Probenmatrizes anhand metagenomischer Datensätze.
- Konzeption, Koordination und Bearbeitung wissenschaftlicher Fragestellungen sowie Publikation und Präsentation der Ergebnisse in nationalen und internationalen Fachgremien.
Ihr Profil:
- Formale Voraussetzungen: Abgeschlossenes wissenschaftliches Hochschulstudium (Universitätsdiplom/Master/Staatsexamen) der Naturwissenschaften, Veterinärmedizin, Humanmedizin oder einer vergleichbaren Disziplin. Promotion erwünscht. Bei ausländischen Bildungsqualifikationen benötigen wir einen Nachweis über die Gleichwertigkeit mit einem deutschen Abschluss.
- Kenntnisse und Erfahrungen: Illumina-basierte Next-Generation-Sequencing-Verfahren, einschließlich Gerätebedienung, Probenvorbereitung, Bibliotheksherstellung, Sequenzierung und Qualitätskontrolle in der bioinformatischen Auswertung von NGS-Daten, insbesondere bakterieller Genome und Metagenomdaten in einer Linux-basierten Analyseumgebung (HPC-Cluster). Entwicklung, Implementierung und Validierung bioinformatischer Analysepipelines mit KI- und Machine-Learning-gestützten Methoden zur Identifizierung und Charakterisierung bakterieller Pathogene und komplexe Metagenomdatensätze.
- Sprachkenntnisse: Deutsch mind. B2, Englisch mind. C1.
- Wünschenswert: Praktische mikrobiologische und molekularbiologische Erfahrung im Umgang mit Bakterien der Risikogruppe 3. Erfahrung mit Methoden zur Identifizierung und Charakterisierung bakterieller Pathogene. Praktische Erfahrung mit Oxford-Nanopore-Sequenzierung. Programmierkenntnisse, insbesondere in Python und/oder R.
Persönliche Kompetenzen:
- Eigeninitiative und hohe Eigenmotivation.
- Zielorientierung und Konzeptentwicklung zur Zielerreichung.
- Kooperations- und Teamfähigkeit und Erarbeitung von Lösungen zusammen mit anderen Teammitgliedern.
- Konfliktfähigkeit und Konzentration auf Lösungen, die der Zielsetzung und den Beteiligten gerecht werden.
Weitere Voraussetzungen:
- Bereitschaft zur regelmäßigen Teilnahme an 24/7 Rufbereitschaften sowie die Erreichbarkeit des RKI in einer Stunde.
- Bereitschaft zur Teilnahme an einer erweiterten Sicherheitsüberprüfung nach § 9 Sicherheitsüberprüfungsgesetz (SÜG) sowie deren positiver Abschluss.
Wissenschaftliche Mitarbeiterin / Wissenschaftlicher Mitarbeiter Hochpathogene mikrobielle Erre[...] Arbeitgeber: Robert Koch-Institut
Das Robert Koch-Institut ist ein herausragender Arbeitgeber, der seinen Mitarbeitern nicht nur eine sinnstiftende Tätigkeit im Bereich Gesundheitsschutz bietet, sondern auch ein unterstützendes und kollegiales Arbeitsumfeld in Berlin, Wildau und Wernigerode schafft. Mit attraktiven Benefits wie 30 Tagen Urlaub, geförderter Altersvorsorge und individuellen Fortbildungsmöglichkeiten fördert das Institut die persönliche und berufliche Entwicklung seiner Mitarbeiter und setzt auf Chancengleichheit und Diversität.
