Auf einen Blick
- Aufgaben: Entwickle Modelle für Mutationen und Algorithmen zur Inferenz in der Phylogenetik.
- Unternehmen: Forschungsinstitut in Wädenswil, Schweiz mit innovativem Team.
- Vorteile: Wettbewerbsfähiges Gehalt, flexible Arbeitszeiten und Zugang zu modernster Technologie.
- Weitere Informationen: Dynamisches Umfeld mit exzellenten Entwicklungsmöglichkeiten in der Wissenschaft.
- Warum dieser Job: Arbeite an spannenden Projekten, die die Zukunft der Genomforschung gestalten.
- Qualifikationen: MSc in Informatik oder verwandtem Bereich, starke Programmierkenntnisse, idealerweise in Rust oder C++.
Das prognostizierte Gehalt liegt zwischen 45000 - 65000 € pro Jahr.
Um unser Team in Wädenswil, Schweiz, zu verstärken, suchen wir eine PhD-Position in Computational Phylogenetics.
Jobaufgaben:
- Genomsequenzen werden als sich entlang binärer phylogenetischer Bäume entwickelnd modelliert durch stochastische string‑wertige Substitutions- und Einfüge-Löschprozesse (indel).
- Gegeben eine Menge von gegenwärtigen Sequenzen sind klassische Inferenzprobleme in der Phylogenetik: (i) Homologieinferenz, (ii) Baum-Inferenz und (iii) Rekonstruktion ancestral Sequenzen.
- Ein zentraler Fokus unserer jüngsten Arbeiten war die Entwicklung schneller frequentistischer indel-unabhängiger Ansätze für diese Probleme.
- Für die Handhabbarkeit müssen die Modelle in den meisten Fällen annehmen, dass Residuen unabhängig über Standorte evolvieren.
- In Wirklichkeit werden Mutationswahrscheinlichkeiten durch den Sequenzkontext beeinflusst, einschließlich positionsspezifischer struktureller und funktioneller Einschränkungen.
- In den letzten Jahren hat die Konvergenz von computergestützter Biologie und datengestützten Methoden zur Entwicklung von genomischen großen Sprachmodellen (gLLMs) geführt, die Kontextabhängigkeiten von Sequenzen modellieren können.
- Aufbauend auf unserer vorherigen Arbeit ist es unser Ziel, neuro-symbolische Methoden zu entwickeln, die die mechanistische Grundlage der klassischen Phylogenetik beibehalten und die repräsentative Vielfalt von gLLMs integrieren.
- Als PhD-Student werden Sie Mutationsmodelle entwerfen, Inferenzalgorithmen entwickeln, diese in unserem Rust-Code-Basis implementieren und die Methoden durch Simulation und mit realen Daten evaluieren.
Profilanforderungen:
- Sie sollten einen MSc in Informatik, Computational Science, Computational Biology, Statistik / Angewandte Mathematik oder einem verwandten quantitativen Bereich haben, mit einem starken Hintergrund in:
- Algorithmen, insbesondere kombinatorische Optimierung
- Stochastische Modellierung
- Computational inferential statistics
- Programmierung, idealerweise in Rust und/oder C++
- Kenntnisse in Phylogenetik und/oder ein Verständnis von neuronalen Netzwerken sind von Vorteil.
PhD position in Computational Phylogenetics Arbeitgeber: SIB Swiss Institute of Bioinformatics
Unser Unternehmen in Wädenswil, Schweiz, bietet eine inspirierende Arbeitsumgebung für aufstrebende Wissenschaftler im Bereich der Computational Phylogenetics. Wir fördern eine offene und kollaborative Kultur, die den Austausch von Ideen und die persönliche Entwicklung unterstützt. Zudem profitieren unsere Mitarbeiter von flexiblen Arbeitszeiten, Zugang zu modernster Technologie und der Möglichkeit, an innovativen Projekten zu arbeiten, die einen echten Einfluss auf die wissenschaftliche Gemeinschaft haben.
Kontaktdaten:
SIB Swiss Institute of Bioinformatics Recruiting-Team
StudySmarter Expertenrat🤫
Wir sind der Meinung, dass Sie so PhD position in Computational Phylogenetics erhalten könnten
✨Tipp Nummer 1
Netzwerken ist der Schlüssel! Nutze Plattformen wie LinkedIn, um mit Fachleuten aus der Computational Phylogenetics in Kontakt zu treten. Frag nach ihren Erfahrungen und Tipps – das kann dir helfen, einen Fuß in die Tür zu bekommen.
✨Tipp Nummer 2
Bereite dich auf Vorstellungsgespräche vor, indem du häufige Fragen zu phylogenetischen Modellen und Algorithmen übst. Zeig dein Wissen über gLLMs und wie sie in der Forschung eingesetzt werden können. Das wird dir helfen, selbstbewusst aufzutreten!
✨Tipp Nummer 3
Zeige deine Programmierfähigkeiten! Wenn du Rust oder C++ beherrschst, bringe Beispiele deiner bisherigen Projekte mit. Das zeigt, dass du nicht nur theoretisches Wissen hast, sondern auch praktisch arbeiten kannst.
✨Tipp Nummer 4
Bewirb dich direkt über unsere Website! So kannst du sicherstellen, dass deine Bewerbung die richtige Aufmerksamkeit erhält. Und vergiss nicht, deine Leidenschaft für Computational Phylogenetics zu zeigen – das macht einen großen Unterschied!
Wir glauben, dass du diese Fähigkeiten brauchst, um PhD position in Computational Phylogenetics mit Bravour zu bestehen
Einige Tipps für deine Bewerbung 🫡
Mach deine Bewerbung persönlich:Zeig uns, wer du bist! Verwende eine freundliche und authentische Sprache, die deine Persönlichkeit widerspiegelt. Wir möchten nicht nur deinen Lebenslauf sehen, sondern auch einen Einblick in deine Motivation und Leidenschaft für Computational Phylogenetics.
Betone deine relevanten Fähigkeiten:Stell sicher, dass du deine Kenntnisse in Algorithmen, stochastischer Modellierung und Programmierung klar hervorhebst. Zeig uns, wie deine Erfahrungen und Fähigkeiten zu den Anforderungen der Stelle passen. Das macht einen großen Unterschied!
Sei präzise und strukturiert:Halte deine Bewerbung übersichtlich und gut strukturiert. Verwende klare Absätze und Aufzählungen, um wichtige Informationen hervorzuheben. So können wir schnell erkennen, was du zu bieten hast und wie du ins Team passt.
Bewirb dich über unsere Website:Wir empfehlen dir, deine Bewerbung direkt über unsere Website einzureichen. So stellst du sicher, dass sie an die richtige Stelle gelangt und wir sie schnell bearbeiten können. Wir freuen uns auf deine Unterlagen!
Wie man sich auf ein Vorstellungsgespräch bei SIB Swiss Institute of Bioinformatics vorbereitet
✨Verstehe die Grundlagen der Phylogenetik
Mach dich mit den grundlegenden Konzepten der Phylogenetik vertraut, insbesondere mit homology inference und tree inference. Zeige im Interview, dass du die Herausforderungen und aktuellen Trends in diesem Bereich verstehst.
✨Bereite dich auf technische Fragen vor
Erwarte technische Fragen zu Algorithmen und stochastischen Modellen. Übe, wie du deine Kenntnisse in diesen Bereichen klar und präzise erklären kannst, und sei bereit, Beispiele aus deiner bisherigen Arbeit oder Studien zu nennen.
✨Zeige deine Programmierkenntnisse
Da Kenntnisse in Rust und/oder C++ wichtig sind, solltest du deine Programmierfähigkeiten demonstrieren können. Bereite ein kleines Projekt oder Beispiel vor, das deine Fähigkeiten zeigt, und sei bereit, darüber zu sprechen.
✨Frage nach den zukünftigen Projekten
Zeige dein Interesse an der Forschung des Unternehmens, indem du Fragen zu ihren aktuellen und zukünftigen Projekten stellst. Das zeigt, dass du nicht nur an der Position interessiert bist, sondern auch an der Weiterentwicklung des Teams.
