PhD position in Computational Phylogenetics

PhD position in Computational Phylogenetics

Wädenswil Vollzeit 45000 - 65000 € / Jahr (geschätzt) Kein Homeoffice möglich
SIB Swiss Institute of Bioinformatics

Auf einen Blick

  • Aufgaben: Entwickle Modelle für Mutationen und Algorithmen zur Inferenz in der Phylogenetik.
  • Unternehmen: Forschungsinstitut in Wädenswil, Schweiz mit innovativem Team.
  • Vorteile: Wettbewerbsfähiges Gehalt, flexible Arbeitszeiten und Zugang zu modernster Technologie.
  • Weitere Informationen: Dynamisches Umfeld mit exzellenten Entwicklungsmöglichkeiten in der Wissenschaft.
  • Warum dieser Job: Arbeite an spannenden Projekten, die die Zukunft der Genomforschung gestalten.
  • Qualifikationen: MSc in Informatik oder verwandtem Bereich, starke Programmierkenntnisse, idealerweise in Rust oder C++.

Das prognostizierte Gehalt liegt zwischen 45000 - 65000 € pro Jahr.

Um unser Team in Wädenswil, Schweiz, zu verstärken, suchen wir eine PhD-Position in Computational Phylogenetics.

Jobaufgaben:

  • Genomsequenzen werden als sich entlang binärer phylogenetischer Bäume entwickelnd modelliert durch stochastische string‑wertige Substitutions- und Einfüge-Löschprozesse (indel).
  • Gegeben eine Menge von gegenwärtigen Sequenzen sind klassische Inferenzprobleme in der Phylogenetik: (i) Homologieinferenz, (ii) Baum-Inferenz und (iii) Rekonstruktion ancestral Sequenzen.
  • Ein zentraler Fokus unserer jüngsten Arbeiten war die Entwicklung schneller frequentistischer indel-unabhängiger Ansätze für diese Probleme.
  • Für die Handhabbarkeit müssen die Modelle in den meisten Fällen annehmen, dass Residuen unabhängig über Standorte evolvieren.
  • In Wirklichkeit werden Mutationswahrscheinlichkeiten durch den Sequenzkontext beeinflusst, einschließlich positionsspezifischer struktureller und funktioneller Einschränkungen.
  • In den letzten Jahren hat die Konvergenz von computergestützter Biologie und datengestützten Methoden zur Entwicklung von genomischen großen Sprachmodellen (gLLMs) geführt, die Kontextabhängigkeiten von Sequenzen modellieren können.
  • Aufbauend auf unserer vorherigen Arbeit ist es unser Ziel, neuro-symbolische Methoden zu entwickeln, die die mechanistische Grundlage der klassischen Phylogenetik beibehalten und die repräsentative Vielfalt von gLLMs integrieren.
  • Als PhD-Student werden Sie Mutationsmodelle entwerfen, Inferenzalgorithmen entwickeln, diese in unserem Rust-Code-Basis implementieren und die Methoden durch Simulation und mit realen Daten evaluieren.

Profilanforderungen:

  • Sie sollten einen MSc in Informatik, Computational Science, Computational Biology, Statistik / Angewandte Mathematik oder einem verwandten quantitativen Bereich haben, mit einem starken Hintergrund in:
  • Algorithmen, insbesondere kombinatorische Optimierung
  • Stochastische Modellierung
  • Computational inferential statistics
  • Programmierung, idealerweise in Rust und/oder C++
  • Kenntnisse in Phylogenetik und/oder ein Verständnis von neuronalen Netzwerken sind von Vorteil.

PhD position in Computational Phylogenetics Arbeitgeber: SIB Swiss Institute of Bioinformatics

Unser Unternehmen in Wädenswil, Schweiz, bietet eine inspirierende Arbeitsumgebung für aufstrebende Wissenschaftler im Bereich der Computational Phylogenetics. Wir fördern eine offene und kollaborative Kultur, die den Austausch von Ideen und die persönliche Entwicklung unterstützt. Zudem profitieren unsere Mitarbeiter von flexiblen Arbeitszeiten, Zugang zu modernster Technologie und der Möglichkeit, an innovativen Projekten zu arbeiten, die einen echten Einfluss auf die wissenschaftliche Gemeinschaft haben.

SIB Swiss Institute of Bioinformatics

Kontaktdaten:

SIB Swiss Institute of Bioinformatics Recruiting-Team

StudySmarter Expertenrat🤫

Wir sind der Meinung, dass Sie so PhD position in Computational Phylogenetics erhalten könnten

Nutz die Wissenschafts-Community!

In der Biologie gibt es tolle Labor- und Forschungsnetzwerke. Schau dir Plattformen wie ResearchGate oder LinkedIn-Gruppen für Biologen an, um mit Gleichgesinnten zu vernetzen und über aktuelle Stellenangebote in der Branche informiert zu bleiben.

Finde relevante Konferenzen und Events

Besuche branchenspezifische Konferenzen oder Workshops, um Kontakte zu knüpfen und potenzielle Arbeitgeber direkt zu treffen. Das ist eine super Möglichkeit, um in die Branche reinzuschnuppern und dein Netzwerk zu erweitern!

Nutze Praktika und Forschungsprojekte

Viele Unternehmen im biologischen Bereich bieten Vollzeitstellen für Leute, die schon Erfahrung durch Praktika oder projektbasierte Arbeiten gesammelt haben. Schau dir deine Uni oder lokale Institute an – die haben oft Kontakte.

Bewirb dich direkt über uns!

Wenn du auf der Suche nach einer Vollzeitstelle im Bereich Biologie bist, zögere nicht und bewirb dich direkt über unsere Website bei SIB Swiss Institute of Bioinformatics. Wir haben oft spannende Jobangebote, die genau auf deine Qualifikationen zugeschnitten sind!

Wir glauben, dass du diese Fähigkeiten brauchst, um PhD position in Computational Phylogenetics mit Bravour zu bestehen

Algorithmen
kombinatorische Optimierung
stochastische Modellierung
computational inferentielle Statistik
Programmierung in Rust
Programmierung in C++
Phylogenetik

Einige Tipps für deine Bewerbung 🫡

Zeig deine Leidenschaft für Biologie:In deinem Anschreiben solltest du deutlich machen, warum du dich für Biologie begeisterst und welche Aspekte dir besonders am Herzen liegen. Erzähl uns von Projekten oder Studienrichtungen, die dich geprägt haben – das gibt deiner Bewerbung eine persönliche Note!

Füge relevante Forschung oder Praktika hinzu:Für eine Vollzeitstelle in der Biologie ist es wichtig, dass du relevante Erfahrungen in Forschung oder Praktika auflistest. Vergiss nicht, spezifische Techniken oder Methoden zu erwähnen, die du beherrschst. Das zeigt uns, dass du die praktische Seite der Biologie wirklich verstehst!

Tabellarischer Lebenslauf – klar und prägnant:Achte darauf, dass dein Lebenslauf übersichtlich und gut strukturiert ist. Listen punktuell deine Erfahrungen, Ausbildungen und relevanten Fähigkeiten auf. Verwende dabei klassische Kategorien, die für die Biologie relevant sind, wie z.B. Laborkenntnisse oder spezifische Software, die du genutzt hast.

Überzeuge mit relevanten Zertifikaten:Falls du zusätzliche Zertifikate oder Kurse im Bereich Biologie oder verwandten Fächern hast, erwähne diese unbedingt! Das kann deinen Lebenslauf aufwerten und zeigt uns, dass du bereit bist, ständig zu lernen und dich weiterzuentwickeln. Bewerb dich direkt über unsere Website – wir freuen uns auf deine Einsendung!

Wie man sich auf ein Vorstellungsgespräch bei SIB Swiss Institute of Bioinformatics vorbereitet

Forschungsprojekte im Gepäck

Bereite dich darauf vor, deine Erfahrungen aus bisherigen Forschungsprojekten oder Praktika zu teilen. Zeige konkret, wie du Methoden in Biologie angewendet hast, und sei bereit, über die Ergebnisse zu diskutieren. Das gibt dem Interviewer einen guten Einblick in dein praktisches Wissen.

Vertraut mit Labortechniken

In der Biologie sind technische Fähigkeiten entscheidend. Sei bereit, Fragen zu spezifischen Labortechniken wie PCR, Mikroskopie oder Zellkultur zu beantworten. Vielleicht wirst du sogar gebeten, eine praktische Demonstration deiner Fähigkeiten zu machen!

Warum möchten wir hier arbeiten?

Da es sich um eine Vollzeitstelle handelt, ist es wichtig, dein langfristiges Interesse an dem spezifischen Bereich der Biologie zu zeigen. Überlege dir genau, warum dich die Forschung oder die Projekte von SIB Swiss Institute of Bioinformatics reizen. Überlege auch, wie du dich da sehen kannst, etwa in einem Jahr oder zwei.

Erstelle dein biologisches Portfolio

Falls du schon an relevanten Arbeiten oder Veröffentlichungen beteiligt warst, bringe ein Portfolio mit oder präsentiere deine digitalen Arbeiten. Das kann ein echter Pluspunkt sein, um deine Leidenschaft für Biologie und deine wissenschaftlichen Fähigkeiten zu unterstreichen.