PhD in the field of amyloid and bio-condensate structural biology by NMR spectroscopy

Die Reif-Gruppe am Bayerischen NMR-Zentrum (BNMRZ) an der TU München sucht einen Doktoranden, der an der Charakterisierung von Amyloidfibrillen, Protein-Kondensaten und der Flüssig-Flüssig-Phasentrennung (LLPS) arbeitet, unter Verwendung einer Kombination aus Lösungs- und MAS Festkörper-NMR-Spektroskopie. Die Position ist sofort verfügbar.

Forschungsfokus: Membranolose Organellen (wie Nucleoli, nukleäre Speckles, Stressgranula usw.) sind für lebende Organismen von entscheidender Bedeutung. Diese biomolekularen Kondensate entstehen durch Multidomain-Proteine, die an multivalenten Wechselwirkungen beteiligt sind. Die Bildung von Kondensaten impliziert sowohl Protein-Protein- als auch Protein-RNA-Wechselwirkungen, die prionähnliche Regionen mit niedriger Komplexität und RNA-Bindungsdomänen umfassen. Das empfindliche Gleichgewicht zwischen Flüssig-Flüssig-Phasentrennung (LLPS) und der Bildung von Amyloidfibrillen erfordert eine strenge Regulierung. Dies kann durch Chaperone, posttranslationalen Modifikationen, kleine Moleküle und/oder Metalle erreicht werden, die dieses Gleichgewicht beeinflussen und entweder die Zersetzung oder die Versteifung von proteinreichen Flüssigkeitstropfen in β-Strang-reiche Proteinfibrillen bewirken. Ziel des Doktorandenprojekts ist es, die Mechanismen besser zu verstehen, die das Gleichgewicht zwischen der Bildung von Amyloidfibrillen und Granulen in der Zelle auf struktureller Basis modulieren.

Protein-Systeme und Methoden: Die untersuchten Proteinsysteme umfassen Faktoren, die mit Stressgranulen (SG) assoziiert sind, das Alzheimer-Krankheit Aβ-Peptid, das mit Diabetes Typ II verbundene humane Insel-Amyloidpolypeptid (hIAPP/amylin), leichte Ketten-Antikörperdomänen, die an AL-Amyloidose beteiligt sind, und Serum-Amyloid A (SAA), das an AA-Amyloidose beteiligt ist. Wir verwenden Lösungs- und MAS Festkörper-NMR zur Charakterisierung dieser Systeme. Darüber hinaus nutzen wir niedermolekulare biophysikalische Methoden wie Fluoreszenzmikroskopie, ThT-Aggregationsassays, CD-Spektroskopie, Elektronenmikroskopie und dynamische Lichtstreuung (DLS).

Allgemeine Informationen: Unsere Gruppe ist in das Bayerische NMR-Zentrum an der Technischen Universität München integriert und ist mit dem Institut für Strukturbiologie am Helmholtz-Zentrum München verbunden. Die Labore befinden sich im Bayerischen NMR-Zentrum am Campus Garching und werden gemeinsam mit den Gruppen von Professoren Michael Sattler, Franz Hagn und Steffen Glaser genutzt. Neben einer hochmodernen NMR-Anlage hat unsere Gruppe direkten Zugang zu einer Röntgenkristallographie-Anlage und zu einer Kryo-EM-Plattform, die mit einem Selectrix-X-Bildfilter und einem modernen Falcon-4i-Direktelektronendetektor ausgestattet ist, was eine hochmoderne Einzelpartikelanalyse und in-situ Kryo-Elektronentomographie ermöglicht. Während Ihrer Arbeit am BNMRZ nehmen Sie an wissenschaftlichen Seminaren teil, die vom BNMRZ und der STB organisiert werden.

Rechtliche Hinweise: Die Position ist für Menschen mit Behinderungen geeignet. Bewerber mit Behinderungen werden bei grundsätzlich gleicher Eignung, Befähigung und fachlicher Leistung bevorzugt.

Kontakt: Interessierte Kandidaten senden eine E-Mail mit einer Kopie Ihres Lebenslaufs und Ihrer Zeugnisse an Prof. Dr. Bernd Reif, E-Mail: reif@tum.de

Website: Für weitere Informationen besuchen Sie bitte unsere Webseite: https://www.bio.nat.tum.de/ocb/home/