Senior Scientist in Computational Biology (80%)

Vom 1. Juni 2027 oder nach Vereinbarung | zunächst befristet auf 5 Jahre, mit der Möglichkeit der Verlängerung. Die Abteilung für Biomedizinische Technik ist Teil der Medizinischen Fakultät der Universität Basel. Sie trägt zu einer besseren Zukunft bei, indem sie die Gesundheitsbedürfnisse durch innovative biomedizinische Forschung und technische Lösungen erfüllt und grundlegende Wissenschaft in medizinisches Wissen und Gesundheitsinnovationen übersetzt.

Das Pediatric Disease Modeling Lab sucht einen Senior Scientist, um eine wachsende Forschungsgruppe zu leiten. Unsere Mission ist es zu verstehen, wie frühe Expositionen gegenüber dem Mikrobiom die lebenslange Gesundheit durch ihre Auswirkungen auf das sich entwickelnde Immunsystem prägen. Wir entwickeln mathematische Modelle der Mikrobiom-Immunsystem-Koentwicklung, um zu quantifizieren, wie frühe Störungen des Mikrobioms die antimikrobielle Resistenz, die Dynamik von Infektionskrankheiten und nicht übertragbare Krankheiten beeinflussen, mit dem Ziel, unsere Erkenntnisse in umsetzbare Strategien für die pädiatrische Versorgung zu übersetzen.

Ihre Hauptaufgaben umfassen:

• Überwachung der Forschungsprojekte des Labors: Verwaltung von Zeitplänen, Meilensteinen und Ergebnissen über die ERC- und SNSF-Förderungen sowie Vorbereitung wissenschaftlicher und finanzieller Berichte an die Förderer.
• Verwaltung von Projektbudgets, Beschaffung und Verträgen, einschließlich Untervergabe und Dienstleistungsvereinbarungen, in Zusammenarbeit mit der Verwaltung der Abteilung.
• Koordination von Kooperationen mit Partnerkohorten, klinischen Partnern und deren PIs: Organisation von Konsortialtreffen und Standortbesuchen sowie Aufrechterhaltung eines regelmäßigen Informationsflusses zwischen Basel und den Partnerstandorten.
• Überwachung von Daten- und Materialübertragungsvereinbarungen, Ethikanträgen und der Einhaltung von Anforderungen an die Datenverwaltung in Zusammenarbeit mit dem Datenmanager / Bioinformatiker des Labors und den rechtlichen und Forschungsbüros der Universität Basel.
• Überwachung des Datenmanagers / Bioinformatikers des Labors und Überwachung der Pipeline, die analysierbare Datensätze an das Modellierungsteam liefert.
• Beitrag zu den Forschungsprojekten des Labors sowie Koordination und Co-Autorenschaft von Manuskripten im Team und mit Partnern.
• Beitrag zur Lehre und zur Betreuung von Doktoranden und Masterstudenten.
• Vertretung des Labors auf wissenschaftlichen Konferenzen und Unterstützung bei Folgeanträgen.

Ihr Profil:

• Erforderlich: Promotion in Computational Biology, Bioinformatik, Epidemiologie oder einem verwandten quantitativen Bereich mit Postdoc-Erfahrung.
• Erfahrung in der Arbeit an kollaborativen, mehrpartner Forschungsprojekten, idealerweise mit klinischen oder Kohortendaten.
• Starke organisatorische Fähigkeiten und eine Erfolgsbilanz bei der Umsetzung von Forschungsprojekten und Publikationen.
• Kenntnisse in wissenschaftlichem Programmieren (z.B. R oder Python) und Erfahrung mit der Analyse biomedizinischer Daten.
• Ausgezeichnete schriftliche und mündliche Englischkenntnisse sowie die Fähigkeit, effektiv mit Wissenschaftlern, Klinikern und administrativen Partnern zu kommunizieren.
• Wünschenswert: Erfahrung mit Datenübertragungsvereinbarungen, Ethikanträgen oder Datenschutzprozessen.
• Erfahrung mit Projektbudgets, Verträgen oder Berichterstattung an Förderer.
• Vertrautheit mit Mikrobiom-, immunologischen oder multi-omics Daten und/oder mit Kohortenstudien.
• Erfahrung in der Betreuung technischer oder wissenschaftlicher Mitarbeiter.
• Deutschkenntnisse sind von Vorteil, aber nicht erforderlich.

Wir bieten Ihnen eine zentrale Rolle beim Ausbau einer Forschungsgruppe, die durch zwei große Startstipendien gefördert wird, mit einem fünfjährigen Vertrag und der Möglichkeit der Verlängerung. Eine wissenschaftlich aktive Position mit Co-Autorenschaft bei Publikationen und Unterstützung für die Teilnahme an Konferenzen. Ein stimulierendes, interdisziplinäres Umfeld an der Schnittstelle von computergestützter Wissenschaft und pädiatrischer Gesundheit, eingebettet in Basels Lebenswissenschaftsökosystem. Enge Zusammenarbeit mit klinischen, epidemiologischen und experimentellen Partnern auf mehreren Kontinenten. Eine dynamische und unterstützende Teamkultur, die Vielfalt und Inklusion schätzt.

Die Position ist ab dem 1. Juni 2027 oder später nach gegenseitiger Vereinbarung verfügbar. Der Vertrag ist zunächst auf fünf Jahre befristet, mit der Möglichkeit einer Verlängerung. Die Überprüfung der Bewerbungen beginnt sofort und wird fortgesetzt, bis die Position besetzt ist. Bitte reichen Sie Ihre Bewerbung über das Recruiting-Portal der Universität Basel ein, indem Sie die folgenden Dokumente einreichen: (A) ein Anschreiben, in dem Sie Ihre Motivation und Ihre Erfahrungen beschreiben, (B) einen vollständigen Lebenslauf einschließlich einer Liste von Publikationen, (C) Kontaktdaten von mindestens zwei Referenzen, die bereit sind, auf Anfrage Empfehlungsschreiben abzugeben.