Academic research assistant (m/f/x) / Wissenschaftlicher Mitarbeiter (m/w/d) in Saarbrücken

Saarland University ist eine international anerkannte Campus-Universität mit starken Forschungsprogrammen. Die Förderung junger akademischer Talente und die Schaffung idealer Bedingungen für Lehre und Forschung sind ein zentraler Bestandteil der Mission der Universität. Als Teil der Universität der Großregion ermöglicht die Saarland Universität den Studierenden und Mitarbeitenden, Wissen und Ideen zwischen Disziplinen, Universitäten und über Grenzen hinweg auszutauschen.

Die Abteilung für Klinische Bioinformatik am Zentrum für Bioinformatik in Saarbrücken lädt zur Bewerbung auf die folgende Position ein, die so schnell wie möglich beginnt.

Arbeitsplatz/Abteilung: Der Lehrstuhl für Klinische Bioinformatik, geleitet von Prof. Dr. Andreas Keller, arbeitet an der Schnittstelle von Medizin, Bioinformatik und Informatik. Die Gruppe untersucht die molekularen Mechanismen des Alterns und der Neurodegeneration. Sie hat eine lange Erfolgsbilanz in der Biologie nicht-kodierender RNAs, in nicht-invasiven Biomarkern und in der Gehirn-Blut-Achse. Diese Arbeit nutzt zunehmend Einzelzell- und räumliche Transkriptomik. Ein zweiter Zweig am Helmholtz-Institut für Pharmazeutische Forschung Saarland (HIPS) beschäftigt sich mit Mikrobiom- und Infektionsbiologie. Eine systemische, gewebsübergreifende Sicht verbindet die beiden Bereiche, wobei maschinelles Lernen und KI zentral für die Arbeitsweise der Gruppe sind.

Wir suchen einen Kandidaten mit einer soliden Grundlage in maschinellem Lernen und KI, der über die Anwendung bestehender Werkzeuge hinausgehen und eigene Methoden entwickeln und anpassen möchte. Sie würden mit den hochdimensionalen Daten der Gruppe arbeiten, die Einzelzell- und Einzelkern-RNA-seq, räumliche Transkriptomik, Immunrepertoire und nicht-kodierende RNA umfassen. Die Aufgabe besteht darin, ML- und KI-Methoden für Fragen zu entwickeln, anzupassen und zu benchmarken, die von Standardwerkzeugen schlecht behandelt werden, im Kontext von Altern und Neurodegeneration. Dies ist methodische Arbeit, die sich auf Modelle, Algorithmen und Inferenz konzentriert, wobei die biologischen Fragestellungen den Rahmen setzen.

Stellenanforderungen und Verantwortlichkeiten:

• Entwicklung, Anpassung und Benchmarking von Methoden des maschinellen Lernens und der KI für hochdimensionale biomedizinische Daten
• Umsetzung konkreter Datenprobleme in gut definierte Modelle und deren rigorose Validierung
• Erstellung skalierbarer, wiederverwendbarer und gut dokumentierter Software und Werkzeuge für die Gruppe
• Vorbereitung und Ausarbeitung von Ergebnissen und Methoden für wissenschaftliche Publikationen

Für den Einstieg auf Master-Niveau kann die Position zu einer Promotion führen: Je nach Thema und Betreuung ist eine Doktorandenregistrierung entweder über die Medizinische Fakultät (Dr. rer. nat.) oder die Fakultät für Mathematik und Informatik (Dr.-Ing. oder Dr. rer. nat.) möglich.

Ihre akademischen Qualifikationen:

• Abgeschlossenes Hochschulstudium in Informatik, Data Science, Maschinellem Lernen, Mathematik, Bioinformatik oder einem verwandten Fachgebiet (Master oder PhD), mit einem starken, nachweisbaren computergestützten Hintergrund.
• Sprachkenntnisse (gemäß GER): Englisch - C1 (z.B.: Deutsch - C2) (optionale notwendige Sprachkenntnisse)

Der erfolgreiche Kandidat wird auch erwartet:

• Eine solide Grundlage in maschinellem Lernen und KI, unterstützt durch frühere Projekte (z.B. eine Thesis, Studienarbeiten oder Open-Source-Arbeiten)
• Starke Programmierkenntnisse (C++/Python/R oder ähnlich) und die Fähigkeit, effizienten, gut strukturierten Code zu schreiben, mit einem soliden Verständnis von Algorithmen und Datenstrukturen
• Vertrautheit mit UNIX-basierten Systemen und CLI-Tools sowie GPU-/verteiltem (HPC) Computing
• Vertrautheit mit Versionskontrolle (Git) und idealerweise Containern wie Docker
• Ein echtes Interesse an der Biologie und den Fragen hinter den Daten
• Selbstständiges und ergebnisorientiertes Arbeiten innerhalb eines interdisziplinären Teams
• Beachtung der Prinzipien guter wissenschaftlicher Praxis, reproduzierbarer Forschung und verantwortungsvoller Umgang mit sensiblen biomedizinischen Daten
• Beitrag zu Labor- und Konsortialbesprechungen, Berichten und Dokumentationen sowie Präsentation von Ergebnissen auf internationalen Konferenzen
• Im Laufe der Zeit Unterstützung von Vorlesungen und (Mit-)Betreuung von Studierenden während ihrer Abschlussarbeiten (Bachelor/Master)

Was wir Ihnen bieten können:

• Ein flexibles Arbeitszeitmodell, das Ihnen ermöglicht, Arbeit und Familie zu vereinbaren, unter anderem die Möglichkeit des Homeoffice
• Sichere und zukunftsorientierte Beschäftigung mit attraktiven Bedingungen
• Ein breites Spektrum an Weiterbildungs- und beruflichen Entwicklungsmöglichkeiten (z.B. Sprachkurse)
• Ein Modell des betrieblichen Gesundheitsmanagements mit zahlreichen attraktiven Optionen, wie unserem Hochschulsportprogramm
• Zusätzliche Altersvorsorge (RZVK)
• Ermäßigte Tickets für lokale öffentliche Verkehrsmittel (‘Job-Ticket‘ des saarVV)
• Jobrad-Leasing (JobRad)

Wir freuen uns auf Ihre aussagekräftige Online-Bewerbung (in einer PDF-Datei) bis zum 30.09.2026 an andreas.keller@ccb.uni-saarland.de. Bitte geben Sie die Referenznummer W2910 im Betreff der E-Mail an. Bei Fragen stehen wir Ihnen gerne zur Verfügung. Ihr Kontakt: Frau Berit Andres, berit.andres@ccb.uni-saarland.de.

Die Eingruppierung erfolgt nach den besonderen Details der jeweiligen Position und dem Grad, in dem der Bewerber die Anforderungen der Entgeltgruppe innerhalb des TV-L erfüllt. Teilzeitbeschäftigung ist grundsätzlich möglich.

Wenn Sie einen ausländischen Hochschulabschluss erworben haben, ist vor der Einstellung ein Nachweis über die Gleichwertigkeit dieses Abschlusses mit einem deutschen Abschluss durch die Zentralstelle für ausländisches Bildungswesen (ZAB) erforderlich. Bitte beantragen Sie dies gegebenenfalls rechtzeitig.

Leider können weder Kosten für die Teilnahme an einem Vorstellungsgespräch an der Saarland Universität noch Kosten für eine Zertifikatsbewertung durch die ZAB grundsätzlich erstattet werden.

Wir begrüßen Bewerbungen unabhängig von Geschlecht, Nationalität, ethnischer und sozialer Herkunft, Religion/Glauben, Behinderung, Alter sowie sexueller Orientierung und Identität. Im Einklang mit der Politik zur Erhöhung des Frauenanteils ermutigt die Universität aktiv Bewerbungen von Frauen. Bewerbungen von schwerbehinderten Personen werden bei gleicher Eignung bevorzugt berücksichtigt.

Mit der Einreichung einer Bewerbung an der Saarland Universität übermitteln Sie personenbezogene Daten. Bitte beachten Sie unsere Datenschutzerklärung für Informationen darüber, wie wir personenbezogene Daten gemäß Art. 13 der Datenschutz-Grundverordnung erheben und verarbeiten. Mit der Einreichung Ihrer Bewerbung bestätigen Sie, dass Sie die Informationen in der Datenschutzerklärung der Saarland Universität zur Kenntnis genommen haben.