Wissenschaftliche/-r Mitarbeiter/-in -Bioinformatiker/-in im Bereich Molekularpathologie- (w/m/d) in Aachen

Im Institut für Pathologie besetzen wir eine Stelle als

Wissenschaftliche/-r Mitarbeiter/-in -Bioinformatiker/-in im Bereich Molekularpathologie- (w/m/d)

Einsatzort: Institut für Pathologie -Bereich Molekularpathologie/Next Generation Sequencing-Arbeitszeit: 80% der vollen tariflich vereinbarten Arbeitszeit (zzt. 38,5 Std./W.)
Befristung: unbefristet
Einstieg: 01.12.2026
Vergütung: EG 13 (TV-L)

Aufgaben:

Eigenverantwortliche Betreuung der bioinformatorischen Analysen (primär Hochdurchsatz-Sequenzier-/NGS-Daten) Qualitätskontrolle und Infrastruktur innerhalb der (molekularen) Krankenversorgung der Pathologie.

• Bioinformatische Analysen (primär Hochdurchsatz-Sequenzier-/NGS-Daten) und Qualitätskontrolle innerhalb der Krankenversorgung
• Kontinuierliche Anpassung und Infrastrukturmanagement nach Qualitätsmanagement- und GDPR-Vorgaben innerhalb der Krankenversorgung
• Entwicklung und Wartung UNIX-basierter Recheninfrastrukturen
• Entwicklung und Etablierung neuer bioinformatischer Analysemethoden und -pipelines zur Verbesserung der Krankenversorgung
• Fachliche Vertretung der Fachrichtung Bioinformatik innerhalb Molekularer Tumorboards (MTB)
• Unterstützung translationaler Forschung im NGS-Bereich innerhalb des Institutes für Pathologie

Profil:

• Masterabschluss (Molekular)Biologie/Biotechnologie oder vergleichbar mit ausgewiesener bioinformatischer, praktischer Expertise im Bereich der Verarbeitung von NGS-Daten im Krankenversorgungskontext der Molekularpathologie via Lebenslauf
• Vorwissen im Bereich Tumorgenetik
• Sicherer Umgang mit UNIX-basierten Systemen
• Kenntnisse mit bash, R, Python, snakemake und Nextflow
• Nachweisbare Erfahrungen in der Bearbeitung und Qualitätskontrolle NGS-basierter Sequenzdaten (Primär short read Sequenzierung)
• Erfahrung und sicherer Umgang in der Wartung RHEL- und Ubuntu-basierter HPC-Serversysteme
• Publikationsleistung im Bereich NGS-Bioinformatik
• Wünschenswert:
  • Interesse und eine gute Übersicht über aktuelle und zukünftige (primär) NGS-basierten Sequenziertechniken und Analysetools
  • Vorkenntnisse zu Arbeiten mit Illumina Dragen Software- und Sequenziersystemen, snakemake- oder Nextflow-basierten Pipelines
  • Kenntnisse in gängigen Machine Learning-Toolsuites (scikit-learn, Keras, TensorFlow, PyTorch, XGBoost und weitere)
  • Zusätzliche Programmiersprachenkenntnisse
• Gute Deutsch- und Englischkenntnisse (Level c1)
• Organisationskompetenz, eigenverantwortliches Arbeiten, engagierter Teamplayer mit lösungsorientierter Denk- und Arbeitsweise

Warum Sie sich für uns entscheiden sollten?

Wir bieten…

• 30 Tage Urlaub/Jahr bei Vollzeitbeschäftigung
• Mitarbeitende werben Mitarbeitende für verschiedene Berufsgruppen / Prämie von 3.000 Euro
• Überdurchschnittliche betriebliche Altersversorgung der VBL
• Fort- und Weiterbildungsmöglichkeiten
• Entspannter Arbeitsweg - vergünstigtes ÖPNV-Ticket oder Parkplatz sowie Möglichkeit der Teilnahme an der GoFlux App
• Familienfreundliche Unternehmenskultur
  • Betriebskindergarten, Kinderland
  • flexible Arbeitszeitmodelle sowie
  • vielfältige Beratungs- und Unterstützungsangebote zur Vereinbarkeit von Beruf und Familie durch die Personalbetreuung
• Eine Onboarding-App für neue Mitarbeitende
• Fit & Gesund - von Gesundheitsförderung bis Hochschulsport – wir haben alles für Sie

Kontakt:

Uniklinik RWTH Aachen, Direktor des Instituts für Pathologie, Herr Univ.-Prof. Dr. med. Danny Jonigk, FRCPath, Pauwelsstraße 30, 52074 Aachen.
Bei Rückfragen steht Ihnen Frau Andrea Altdorfgerne zur Verfügung.
E-Mail: aaltdorf@ukaachen.de
Telefon: +49 (0)241 80 89280

Diese Stellenausschreibung richtet sich an alle Geschlechter.

Die Uniklinik RWTH Aachen fördert Chancengerechtigkeit und Vielfalt. Bewerbungen von Frauen sind ausdrücklich erwünscht und werden nach Maßgabe des LGG bevorzugt berücksichtigt.

Bewerbungen schwerbehinderter Menschen sind uns willkommen und werden bei gleicher Eignung vorrangig berücksichtigt.

Eine Beschäftigung unterhalb der oben angegebenen Wochenarbeitszeit ist grundsätzlich möglich.

Diese Stellenausschreibung wurde unter Einsatz eines KI gestützten Systems erstellt. Die finale inhaltliche Prüfung und Verantwortung liegen beim Universitätsklinikum Aachen.

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