PhD student or Postdoctoral Researcher (m/f/d)

Bewerbungsfrist: 30.09.2026

Das Institut für Klinische Genetik und Genommedizin am Universitätsklinikum Würzburg sucht einen hochmotivierten Doktoranden oder Postdoktoranden (m/w/d, 75-100% TV-L) mit einem starken Hintergrund in Bioinformatik, um unser Team im Bereich der Krebsgenomik zu verstärken. Der erfolgreiche Bewerber wird Teil eines interdisziplinären Teams, das an dem von der Deutschen Krebshilfe geförderten Projekt arbeitet, das darauf abzielt, die Wechselwirkungen zwischen leukämischen Zellen, der Tumormikroumgebung und dem Immunsystem zu untersuchen.

Innerhalb dieses Teams wird unsere Gruppe Einzelzell-Geneexpressionsprofilierung (GEX) und multimodale Datenintegration von Tumorzellen durchführen, die aus dem Knochenmark von Kindern mit akuter lymphoblastischer Leukämie isoliert wurden.

Wir bieten:

• Ein internationales, dynamisches und multidisziplinäres Forschungsumfeld mit Möglichkeiten zur Übersetzung neuartiger wissenschaftlicher Erkenntnisse in die Patientendiagnose.
• Unbegrenzten Zugang zu modernsten GPU-basierten Servern, die in der Lage sind, verschiedene KI-, HPC- und Rechenlasten zu bewältigen.
• Flexible Arbeitszeiten und ein familienfreundliches Umfeld, das Ihnen hilft, Ihr persönliches und berufliches Leben in Einklang zu bringen.
• Exzellente Mitarbeiterbenefits, einschließlich Sport- und Gesundheitsworkshops, einer attraktiven betrieblichen Altersvorsorge und einer subventionierten Kantine, um Ihr allgemeines Wohlbefinden zu fördern.

Ihre Aufgaben:

• Einrichtung bioinformatischer Workflows zur Analyse von Einzelzell-GEX-Daten, Langzeit-Sequenzierungsdaten und Integration multimodaler Daten, die mit verschiedenen Techniken gewonnen wurden (z.B. Einzelzell-GEX, Durchflusszytometrie, Langzeit-Sequenzierung).
• Softwareentwicklung.
• Zusammenarbeit mit Wet-Lab-Forschern und klinischen Partnern, die an dem Projekt beteiligt sind.
• Betreuung von Bachelor- und Masterstudenten.
• Veröffentlichung von Ergebnissen in peer-reviewed Zeitschriften.
• Präsentation von Forschungsergebnissen auf internationalen wissenschaftlichen Konferenzen (z.B. ESHG, ISCB, EHA, ASH).

Projekt Hintergrund:

Die Prognose und Behandlung der pädiatrischen akuten lymphoblastischen Leukämie (ALL) werden weitgehend durch zugrunde liegende genetische Veränderungen bestimmt. In etwa 10% der pädiatrischen ALL können jedoch genetische Veränderungen, die für die Risikostratifizierung relevant sind, mit herkömmlichen zytogenetischen, molekulargenetischen und kurzzeitsequenzierungsbasierten Methoden (B-other) identifiziert werden. Kinder, die mit B-other ALL diagnostiziert werden, erhalten eine einheitliche Behandlung, trotz der genetischen Heterogenität ihrer Leukämie, was zu schlechteren Ergebnissen führt (5-Jahres EFS 77,3%) im Vergleich zu Kindern, die mit günstigen genetischen Subtypen diagnostiziert werden. Daher ist die Entdeckung neuer Biomarker dringend erforderlich, um die Risikostratifizierung zu verbessern, maßgeschneiderte therapeutische Ansätze zu ermöglichen und die Ergebnisse bei pädiatrischer B-other ALL zu verbessern. In diesem Projekt werden wir Langzeit-Ganzgenomsequenzierung, integrierte multi-omische und klinische Datenanalyse sowie maschinelles Lernen anwenden, um die genetische und epigenetische Landschaft von B-other ALL zu charakterisieren und neue Biomarker für eine verbesserte Risikostratifizierung zu identifizieren. Vielversprechende Kandidaten werden in funktionalen In-vitro-Modellen weiter untersucht, um ihre biologische Relevanz zu bewerten.

Ihr Profil:

• Master- oder Doktortitel in Bioinformatik, Medizinischer Informatik, Biologie oder einem verwandten Bereich.
• Starke Expertise in Programmierung (z.B. Python, R, Perl).
• Grundkenntnisse in der Generierung von Langzeit-Sequenzierungsdaten und der Analyse von Einzelzell-GEX-Daten sind von Vorteil.
• Exzellente schriftliche und mündliche Englischkenntnisse.
• Selbstständige, strukturierte Arbeitsweise und starke Problemlösungsfähigkeiten.
• Fähigkeit, in einem interdisziplinären Teamumfeld zu arbeiten.

Das können Sie erwarten:

• Herausforderndes, vielfältiges und sich entwickelndes Aufgabengebiet.
• Attraktives Gehalt gemäß TV-L inkl. jährlicher Sonderzahlung.
• Schulungs- und Weiterbildungsmöglichkeiten.
• Betriebliche Altersvorsorge.
• Betriebliche Kindertagesstätte mit erweiterten Öffnungszeiten.
• Betriebssportprogramm.
• Flexible Arbeitszeiten.
• JobBike.
• Corporate Benefits.

Werden Sie Teil des Teams: Bewerben Sie sich jetzt!

Dr. Claudia Davenport
Wissenschaftliche Koordinatorin
Tel: +49151 40355882

Im Falle eines Hochschulabschlusses aus einem Nicht-EU-Land ist eine lange Version der Zeugnisbewertung von der Zentralstelle für ausländisches Bildungswesen erforderlich. Die Vergütung erfolgt gemäß den relevanten Tarifverträgen. Schwerbehinderte Bewerber werden bei gleicher Qualifikation bevorzugt.