Machine Learning Engineer – Medical Imaging AI – Medizinische KI-Entwicklung – Arbeitsgruppe Machine Learning

Sie wollen, dass Ihre Modelle nicht in einer Publikation enden, sondern in der Klinik ankommen? Dann sind Sie bei uns richtig. Wir suchen Machine Learning Engineers für die Arbeitsgruppe Machine Learning an der Universitätsmedizin Frankfurt – Menschen, die medizinische KI nicht nur spannend finden, sondern mit Überzeugung vorantreiben.

Im Mittelpunkt steht das BMBF-geförderte Projekt OMI (Open Medical Inference), das im Rahmen der Medizininformatik-Initiative eine offene Plattform entwickelt, um KI-Modelle standortübergreifend und interoperabel in der klinischen Radiologie nutzbar zu machen – über offene Protokolle und Standards (FHIR, DICOMweb), ohne dass jede Klinik Modelle selbst betreiben muss. Sie entwickeln produktionsreife KI-Modelle für die medizinische Bildgebung, die genau dort ankommen, wo sie gebraucht werden.

Ergänzend arbeiten wir im RACOON-Netzwerk mit 38 Universitätskliniken. Sie übernehmen Verantwortung für End-to-End-ML-Pipelines und haben die Freiheit, Lösungen zu entwickeln, die sich zu wettbewerbsfähigen KI-Anwendungen weiterentwickeln können. Wichtiger als die Zahl Ihrer Berufsjahre sind uns Vielseitigkeit, Eigenantrieb und die Bereitschaft, Probleme direkt anzugehen.

Ob Sie gerade Ihren Abschluss gemacht haben und Ihre ersten produktiven Pipelines bauen wollen oder bereits End-to-End-Verantwortung getragen haben: Wer eigenständig arbeitet, zuverlässig liefert und sich in neue Themen einarbeitet, findet bei uns den Raum, schnell zu wachsen. Erfahrene Teammitglieder und ein kurzer Draht zur klinischen Forschung sorgen dafür, dass Sie dabei nicht allein stehen. Die Stelle ist zunächst auf 12 Monate befristet. Eine Promotion ist nach individueller Absprache möglich.

Ihre Aufgaben:

• End-to-End-ML-Entwicklung
• Entwicklung, Training, Validierung und Deployment von Deep-Learning-Modellen für die medizinische Bildanalyse (primär CT und MRT)
• Arbeit mit dem aktuellen Methodenspektrum – von 2D-/3D-CNNs und der U-Net-Familie über Transformer-Architekturen bis zu Foundation Models und Vision-Language-Ansätzen; Sie wählen das passende Werkzeug für die jeweilige klinische Fragestellung
• Adaption und Fine-Tuning vortrainierter Foundation Models für Segmentierung und Klassifikation
• Verantwortung für die gesamte Pipeline: von der DICOM-Datenaufnahme bis zum containerisierten Deployment
• Rapid Prototyping: der schnelle Weg vom klinischen Problem zum funktionierenden Prototyp
• Performance-Optimierung für Genauigkeit, Inferenzgeschwindigkeit und Recheneffizienz
• Einrichtung und Betrieb von Trainingsumgebungen: Konfiguration von GPU-Servern und Management von Compute-Ressourcen
• Aufbau wiederverwendbarer ML-Infrastruktur: modulare Pipelines, Data Loader, Training-Frameworks
• Reproduzierbare Workflows mit modernem MLOps-Tooling
• Deployment-Systeme: Inference Services, APIs und PACS-Integration, containerisiert über Docker/Kubernetes
• Monitoring von Modellen im Betrieb, einschließlich Erkennung von Daten- und Modell-Drift
• DICOM/FHIR-Datenverarbeitung: robuste Parser, Konverter und Qualitätskontrollsysteme
• Data Versioning und Lineage für reproduzierbare Experimente
• Privacy-Preserving Workflows konform mit DSGVO, deutschem Gesundheitsdatenschutzrecht und den Anforderungen des EU AI Act
• Nachvollziehbarkeit, Audit-Trails und Human-in-the-Loop-Prinzipien für klinisch eingesetzte Modelle
• Multi-institutionelle Datenintegration über die 38 RACOON-Partnerinstitutionen
• Publikation in Top-Venues für medizinische KI
• Mitarbeit in kollaborativen Forschungsprojekten

Ausbildung & technischer Hintergrund:

• Abgeschlossenes Studium (Bachelor oder Master) in (Medizin-)Informatik, Physik, Mathematik, Data Science oder vergleichbar
• Solide Machine-Learning-Kenntnisse und Erfahrung im Training neuronaler Netze
• Sichere Python-Programmierung: PyTorch oder TensorFlow, NumPy, scikit-learn, pandas
• Hands-on-Fähigkeiten
• Erfahrung im Training von CNNs, Vision Transformern oder vergleichbaren Architekturen
• Linux-Grundkenntnisse (oder klare Lernbereitschaft)
• Vertrautheit mit Git-Workflows; Code-Review-Praktiken und CI/CD-Grundlagen sind ein Plus

Was Sie ausmacht:

• Eigenantrieb: Sie erkennen Probleme selbst, entwickeln Lösungen und setzen sie um
• Vielseitigkeit und Hands-on-Mentalität: Sie arbeiten sich in unbekannte Themen ein und packen an
• Zuverlässigkeit: Auf Ihre Zusagen ist Verlass
• Pragmatismus: Sie verbinden Forschungsqualität mit dem Anspruch, funktionierende Systeme zu liefern
• Echtes Interesse an KI im Gesundheitswesen als Antrieb für Ihre Arbeit
• Sehr gute Deutsch- und gute Englischkenntnisse

Für erfahrene Kandidatinnen und Kandidaten: Wenn Sie bereits End-to-End-Pipelines verantwortet, ML-Infrastruktur aufgebaut, Foundation Models adaptiert oder in Top-Venues publiziert haben, bietet die Position Raum für eine Senior-Rolle mit entsprechendem Gestaltungsspielraum und Mentoring-Aufgaben.

Aufgrund gesetzlicher Bestimmungen ist ein gültiger Nachweis der Masernimmunität / Masernschutzimpfung notwendig.

Wir bewerten Bewerbungen nach Potenzial und Antrieb, nicht nach einer Checkliste. Auch wenn Sie nicht jeden Punkt erfüllen, aber Freude daran haben, sich einzuarbeiten: Bewerben Sie sich.

Kontakt: Dr. Andreas Bucher
Mail: bucher@med.uni-frankfurt.de
Bewerbungsfrist: 25.09.2026

Geforderte Unterlagen: Lebenslauf, Anschreiben inklusive Motivation, Arbeitszeugnisse und Zertifikate von Abschlüssen und ggf. Zusatzqualifikationen.

Wir richten uns mit dieser Ausschreibung an Bewerbende jeden Geschlechts. Frauen sind in diesen Positionen am Universitätsklinikum Frankfurt unterrepräsentiert. Daher sind Bewerbungen von Frauen besonders willkommen. Schwerbehinderte Bewerbende werden bei gleicher persönlicher und fachlicher Eignung bevorzugt berücksichtigt.