Postdoc in Bioinformatics / Computational Biology (all gender) - The Department of Nephrology a[...]

Die Abteilung für Nephrologie und das Else Kroener-Fresenius Zentrum bieten hervorragende Einrichtungen für interdisziplinäre Forschung im Bereich der Nephrologie und der kardiovaskulären Biologie. Wir bieten eine attraktive Umgebung für moderne Wissenschaft in der molekularen Medizin, Systembiologie und Datenwissenschaft. Es ist eingebettet in den Exzellenzcluster Cardio-Pulmonary Institute (CPI), das Deutsche Zentrum für Herz-Kreislauf-Forschung (DZHK) und den CRC TRR 219 und bietet Zugang zu modernsten Omics-Plattformen, Hochleistungsrecheninfrastruktur und umfassenden Schulungsmöglichkeiten.

Wenn Sie Ihre Promotion abgeschlossen haben und hochmotiviert sind, zum Verständnis der Mechanismen beizutragen, die zu kardiovaskulären Erkrankungen bei Patienten mit Nierenverletzungen führen, bewerben Sie sich jetzt an der Abteilung für Nephrologie und dem Else Kroener-Fresenius Zentrum für nephrologische Forschung!

Ihre Rolle:

• Studie der Rolle des hämatopoetischen Systems als Verbindung zwischen kardiovaskulären und Nierenerkrankungen durch Nutzung von großangelegten Multi-Omics- und klinischen Daten.
• Arbeiten an der Schnittstelle von Einzelzell-Omics, räumlicher Transkriptomik, KI-basiertem Modellieren und bevölkerungsweiten Datensätzen zur Identifizierung von Mechanismen, die kardiovaskuläre Komplikationen bei Nierenerkrankungen antreiben.
• Analyse und Integration von Einzelzell-RNA-seq (scRNA-seq), Einzelzell-ATAC-seq (scATAC-seq) und räumlichen Transkriptomik-Datensätzen.
• Entwicklung und Anwendung von KI-/maschinellen Lernmodellen (z.B. Deep Learning, Repräsentationslernen), um Zellzustände, -verläufe und regulatorische Netzwerke zu untersuchen.
• Integration von großangelegten Bevölkerungs- und Biobankdatensätzen (z.B. UK Biobank) mit Multi-Omics-Daten zur Identifizierung von Risikoprofilen, molekularen Signaturen und kausalen Wegen.
• Enge Zusammenarbeit mit experimentellen und klinischen Forschern zur Generierung und Prüfung mechanistischer Hypothesen.
• Vorbereitung wissenschaftlicher Manuskripte und Präsentation der Ergebnisse auf nationalen und internationalen Konferenzen.
• Beitrag zur Betreuung und Mentoring von Studierenden (Master/PhD) im Bereich Bioinformatik und computergestützte Biologie.

Ihre Fähigkeiten:

• Promotion (oder gleichwertig) in Bioinformatik, computergestützter Biologie, Informatik, Statistik, Systembiologie, medizinischer Datenwissenschaft oder einem verwandten quantitativen Bereich.
• Starkes Interesse an kardiovaskulären und Nierenerkrankungen, translationaler Forschung und präziser Medizin.
• Nachweisbare Erfolge in Bioinformatik/Datenwissenschaft (z.B. Publikationen, Preprints, Software oder Analysepipelines).
• Solide Erfahrung mit der Analyse von NGS-Daten, idealerweise einschließlich einer oder mehrerer der folgenden: scRNA-seq, scATAC-seq, räumliche Transkriptomik.
• Starke Programmierkenntnisse in R und/oder Python sowie Erfahrung mit gängigen Bioinformatik- und ML-Frameworks (z.B. Bioconductor, Scanpy, PyTorch, TensorFlow).
• Sehr gute Kenntnisse in Statistik und maschinellem Lernen; Erfahrung mit Deep Learning oder probabilistischem Modellieren ist von Vorteil.
• Erfahrung mit der Handhabung großangelegter Daten (HPC-Umgebungen, Cloud-Computing, Container, Workflow-Manager).
• Sehr gute Englischkenntnisse (schriftlich und mündlich); Deutsch ist von Vorteil, aber nicht zwingend erforderlich.
• Sie sind organisiert, teamorientiert, proaktiv, aufgeschlossen und verfügen über gute Kommunikationsfähigkeiten.
• Aufgrund gesetzlicher Vorschriften ist ein gültiger Nachweis über Masernimmunität / Masernimpfung erforderlich.

Was Ihnen geboten wird:

• Ein attraktives Gehalt basierend auf einem Tarifvertrag (TV-G-U) mit einer jährlichen Sonderzahlung.
• Langfristige Sicherheit durch betriebliche Altersvorsorge.
• Vollzeitbeschäftigung 40 h/Woche, befristet auf 2 Jahre, möglicher Beginn am 01.02.2026.
• Interne und externe Schulungen für Ihre berufliche Entwicklung.
• Attraktive Gesundheitsangebote, regelmäßige Online- und Präsenzkurse zu Ernährung, Entspannung, Sport und Bewegung.
• Teilzeitarbeit ist möglich, wir bieten Kinderbetreuung in unserem Kindergarten an.
• Freie öffentliche Verkehrsmittel in ganz Hessen (Freistaat Ticket Hessen).

Kontakt:

Prof. Dr. Dr. Thimoteus Speer (Abteilung Innere Medizin 4)
Email: sekretariat.nephrologie@unimedizin-ffm.de
Bewerbungsfrist: 21.12.2025

Bitte senden Sie Ihre Bewerbung mit den üblichen Unterlagen, bestehend aus Lebenslauf, Motivationsschreiben und zwei Referenzen (ein PDF-Dokument bitte!). Bitte reichen Sie keine Originale ein, da die Bewerbungsunterlagen nicht zurückgegeben werden können. Reise- und Bewerbungskosten können nicht erstattet werden. Wir begrüßen Bewerbungen von Kandidaten aller Geschlechter. Frauen sind in diesen Positionen an der Universitätsmedizin Frankfurt derzeit unterrepräsentiert. Daher werden Bewerbungen von Frauen besonders ermutigt. Bewerber mit schweren Behinderungen werden bei gleicher persönlicher und fachlicher Qualifikation bevorzugt berücksichtigt.