PhD student position (f/m/d) in Structural and Molecular Biology

Die Position ist im Sonderforschungsbereich (SFB) 1690 „Krankheitsmechanismen und funktionale Wiederherstellung von sensorischen und motorischen Systemen“ eingebettet. Der erfolgreiche Kandidat wird zum Projekt „Untersuchung der Mechanismen der otoferlin-gesteuerten synaptischen Vesikelfusion an den Ribbon-Synapsen der inneren Haarzellen“ beitragen.

Wir suchen einen motivierten Forscher, der an einem innovativen Projekt mitarbeitet, das untersucht, wie Otoferlin, ein Schlüsselprotein im Hörprozess, eine schnelle und präzise Freisetzung von Neurotransmittern in inneren Haarzellen steuert. Sie werden fortschrittliche Techniken der strukturellen Biologie – wie Kryo-EM und KI-gesteuertes Modellieren – verwenden, um die dynamischen Wechselwirkungen von Otoferlin mit Membranen, SNARE-Proteinen und anderen Fusionsmaschinerien zu studieren. Ihre Arbeit umfasst die Rekonstitution von Protein-Komplexen, die Analyse ihrer Struktur und Funktion sowie das Testen neuer Ideen, wie Otoferlin möglicherweise direkt die Vesikelfusion auslösen könnte. Dies ist eine einzigartige Gelegenheit, eine grundlegende Frage in der Neurowissenschaft anzugehen, die reale Auswirkungen auf das Verständnis von Taubheit und die Entwicklung zukünftiger Therapien hat.

Göttingen ist bekannt für seine neurowissenschaftliche Forschung und bietet ein stimulierendes, kollaboratives wissenschaftliches Umfeld mit Institutionen wie der Universität, dem Universitätsklinikum, den Max-Planck-Instituten, dem Europäischen Institut für Neurowissenschaften und dem Deutschen Primatenzentrum. Das InnerEarLab, einschließlich mehrerer Gruppen des Instituts für auditive Neurowissenschaften und der Abteilung für Hals-Nasen-Ohrenheilkunde, ist in den Campus integriert und engagiert sich in Kooperationen innerhalb des SFB 1690 und anderer Exzellenzcluster. Die meisten Doktoranden sind im Programm für sensorische und motorische Neurowissenschaften der Göttinger Graduiertenschule für Neurowissenschaften, Biophysik und Molekulare Biowissenschaften eingeschrieben, die interdisziplinäre Schulungen und Networking-Möglichkeiten für Doktoranden bietet.

Verantwortlichkeiten

• Multimerische Protein-Komplexe für strukturelle Studien exprimieren, reinigen und zusammenbauen (z.B. unter Verwendung der MultiBac- und MultiMam-Systeme)
• Biochemische Charakterisierung von Protein-Komplexen, Vorbereitung und Bildgebung von Kryo-EM-Proben
• Einrichtung von Kryo-EM-Bildanalyse-Pipelines für rekonstituierte Komplexe sowie Aufbau, Verfeinerung und Validierung struktureller Modelle
• Einrichtung von otoferlin-basierten Vesikelfusionsassays (gekoppelte Lipid- und Kontextmischung)
• Validierung struktureller Modelle mittels gerichteter Mutagenese und funktioneller Assays
• Präsentation des Fortschritts in regelmäßigen Sitzungen des Promotionsberatungs-Ausschusses, Labortreffen, wissenschaftlichen Tagungen und Forschungs-Konferenzen
• Beitrag zu gemeinsamen wissenschaftlichen Publikationen
• Teilnahme an einem Promotionsqualifikationsprogramm, das mit dem Forschungsschwerpunkt des SFB übereinstimmt

Qualifikationen

• Master-Abschluss oder gleichwertig in Biochemie, Molekularbiologie, Chemie oder einem verwandten Fachgebiet, idealerweise mit Erfahrung in struktureller Biologie oder Biochemie (Kryo-EM/Kryo-ET, Röntgenkristallographie oder NMR) oder in der Proteinengineering und -reinigung für funktionelle Studien
• Umfangreiche Erfahrung mit empfindlichen multimerischen Protein-Komplexen und/oder großen Membranproteinen ist sehr wünschenswert
• Vertrautheit mit der Verarbeitung von Kryo-EM/Kryo-ET- oder Röntgenkristallographie-Daten, Modellbildung und -verfeinerung (unter Verwendung von RELION, cryoSPARC, Warp, Phenix, Coot) ist sehr wünschenswert
• Erfahrung mit biochemischen Methoden (Bulk-Vesikelfusionsassays, Liposomen- oder Nanodisk-Rekonstitution, FRET-basierte Assays), KI-basierter Bildanalyse, Kenntnisse der sensorischen Neurowissenschaften und computergestützte Fähigkeiten (Linux, Python, R, bash) sind von Vorteil
• Fähigkeit, in einem interdisziplinären, englischsprachigen Team von Forschern zu arbeiten, ist erforderlich

Vorteile

• Attraktive Vergütung und Sozialleistungen gemäß den Standards des deutschen öffentlichen Dienstes
• Ein Forschungs- und Qualifikationsprogramm, das mit der wissenschaftlichen Mission des SFB übereinstimmt
• Klinisch relevante Forschung mit starken Verbindungen zur Patientenversorgung
• Arbeiten mit einem hochengagierten und interdisziplinären Team von Wissenschaftlern am Institut für auditive Neurowissenschaften
• Hochgradig kollaboratives Forschungsumfeld mit hervorragenden Möglichkeiten zum wissenschaftlichen Networking
• Modernste Forschungsinfrastruktur
• Strukturierte und mehrschichtige Betreuung durch einen Promotionsberatungs-Ausschuss
• Ein umfassendes Programm zur Unterstützung der Karriereentwicklung