Senior Scientist position (m/f/d) computational biology / bioinformatics

Schließen Sie sich dem Institut für Humangenetik am Universitätsklinikum Schleswig-Holstein (UKSH) in der Arbeitsgruppe „Regulatory Genomics“ von Prof. Martin Kircher an. Die Bioinformatikgruppe führt Forschungen in den Bereichen Sequenzanalyse, Datenanalyse, maschinelles Lernen und funktionelle Genomik durch. Wir entwickeln rechnergestützte Ansätze zur Identifizierung funktionell relevanter genetischer Veränderungen bei Krankheiten, Entwicklung und Anpassung und modellieren genregulatorische Effekte aus Massively Parallel Reporter Assay (MPRA) und anderen funktionellen Genomikdaten.

Was wir bieten

• Das Gehalt richtet sich nach der deutschen E 13 TV-L Skala, sofern die Bedingungen des Tarifrechts erfüllt sind.
• Vollzeitbeschäftigung (derzeit 38,5 Stunden/Woche); Teilzeit kann innerhalb bestimmter Arbeitszeitmodelle möglich sein.
• Ein kollaboratives Forschungsumfeld mit umfangreicher Zusammenarbeit mit internen und externen Partnern.
• Flexible Arbeitszeiten und ein familienfreundliches Umfeld.
• Zugang zu Informationen über Vorteile auf der UKSH-Website.

Ihre Aufgaben

• Unabhängige Arbeit an innovativen Projekten unter Verwendung modernster Technologie und aktive Mitwirkung im Labor, Institut und internationalen Kooperationen.
• Unterstützung laufender Projekte und Weiterentwicklung relevanter Forschungsbereiche sowie Vorbereitung und Umsetzung von Drittmittelprojekten.
• Verbesserung und Entwicklung von Methoden zur Ableitung von Krankheits- und Regulierungsmechanismen und Gewinnung von Erkenntnissen über die Sequenzkodierung molekularer Funktionen und deren Beziehung zu Krankheiten (z.B. durch Modellierung und Modellinterpretation).
• Entwicklung von Datenstandards und Vorbereitung von Daten für Analysen oder rechnergestützte Modellierungen sowie Analyse von Hochdurchsatz-Sequenzierungsdaten und Entwicklung maßgeschneiderter rechnergestützter Werkzeuge.
• Unterstützung bei der Betreuung und Ausbildung von Bachelor- und Masterstudierenden sowie aktive Mitwirkung an Schulungen und Lehre, z.B. durch Vorlesungen und Seminare.

Voraussetzungen

• MSc, PhD oder gleichwertig in Bioinformatik, computergestützter Biologie oder ähnlichem oder in Informatik mit umfangreicher Erfahrung in Molekularbiologie und großangelegter Datenanalyse (Hochdurchsatz-Sequenzierung) mit mindestens zwei Jahren Berufserfahrung (einschließlich PhD-Ausbildung). Bewerber mit einem Bachelor-Abschluss werden berücksichtigt, wenn sie mindestens 6 Jahre relevante Berufserfahrung haben.
• Sehr gute Kenntnisse in einer Programmiersprache wie Python, R, C++ oder Java und fortgeschrittene Fähigkeiten in einer Analyseumgebung wie Python oder R (scipy/scikit-learn).
• Erfahrung mit Unix (einschließlich bash/GNU-Tools) und HPC (insbesondere SLURM) Umgebungen sowie tiefes Verständnis von Sequenzanalysen, statistischen Konzepten und maschinellem Lernen.
• Fortgeschrittene Kenntnisse in Molekularbiologie, Genregulation und Epigenetik sowie fortgeschrittene Wissenschafts- und Projektmanagementfähigkeiten.
• Fleißige, zielorientierte, unabhängige Arbeitsweise und Teamarbeit mit starken interdisziplinären Kommunikationsfähigkeiten.
• Sehr gute Englischkenntnisse.

Bewerbungsfrist

Bitte reichen Sie Ihre Bewerbung bis ein und geben Sie die Stellenreferenznummer 27406 an.

Kontakt

Bei Fragen zur Position wenden Sie sich bitte an Prof. Martin Kircher:

Chancengleichheit

Wir leben Vielfalt und ermutigen qualifizierte Wissenschaftlerinnen ausdrücklich zur Bewerbung. UKSH und die Universität zu Lübeck streben an, den Anteil von Frauen in der Fakultät und im Personal zu erhöhen. Bewerbungen von Personen mit Migrationshintergrund, die die Einstellungsvoraussetzungen erfüllen, sind erwünscht. Behinderten Bewerbern, die gleich qualifiziert sind, wird der Vorzug gegeben.