PhD Student (m/f/d) Multi-Omics Biomarker Discovery and Transcriptomics

Das Institut für Klinische Molekularbiologie konzentriert sich auf das Verständnis der Pathophysiologie chronischer entzündlicher Erkrankungen, insbesondere der entzündlichen Darmerkrankung (IBD), und hat kürzlich zur molekularen Aufklärung beigetragen, wie IBD-Risikogene in chronische intestinale Entzündungen beim Menschen umgewandelt werden. Das Institut ist eines der Kernforschungszentren in verschiedenen nationalen und internationalen Forschungsallianzen (z.B. DFG ExC, IMI2 3TR und ImmUniverse).

Wir suchen professionelle und kompetente Unterstützung so früh wie möglich. Der anfängliche Vertrag ist auf drei Jahre befristet mit der Absicht zur Verlängerung.

Was wir bieten:

• Das Gehalt basiert auf dem deutschen E13 TV-L Tarif (65%), sofern die Bedingungen des Tarifrechts erfüllt sind.
• Die Möglichkeit, eine Promotion in einem hochgradig interdisziplinären und internationalen Umfeld zu verfolgen.
• Zugang zu einzigartigen, großangelegten klinischen und multi-omischen Datensätzen aus IBD-Kohorten.
• Schulungsmöglichkeiten in fortgeschrittener Bioinformatik, Systemimmunologie und Mikrobiomforschung.
• Ein anregendes und unterstützendes wissenschaftliches Umfeld mit enger Betreuung und Mentoring.

Ihre Aufgaben:

• Biomarker-Entdeckung unter Verwendung von Bulk-Transkriptomdaten aus Blut- und Gewebeproben.
• Analyse von großangelegten longitudinalen Genexpressionsdatensätzen.
• Identifizierung dynamischer molekularer und epigenetischer Signaturen, die mit Krankheitsverlauf und Therapieansprechen verbunden sind.
• Unterstützung der Patientenstratifizierung und datengestützten klinischen Entscheidungsfindung.
• Identifizierung neuartiger therapeutischer Ziele, einschließlich PROTAC-basierter Ansätze.

Ihr Profil:

• Ein abgeschlossenes Hochschulstudium (Master oder gleichwertig) in Bioinformatik, computergestützter Biologie, Systembiologie, Biostatistik, Ingenieurwesen, Mathematik oder verwandten Bereichen.
• Erfahrung in Bioinformatik und der Analyse verschiedener Omics-Datenebenen ist willkommen; spezifisches Wissen über Transkriptomanalyse, einschließlich differentieller und Koexpressionsanalyse, ist von Vorteil.
• Programmierungs- und Datenanalysefähigkeiten sind vorteilhaft (R und/oder Python; Erfahrung mit HPC-Umgebungen).
• Begeisterung für die Integration von Multi-Omics-Daten und systemmedizinischen Ansätzen.
• Ausgezeichnete Englischkenntnisse in Kommunikation und Schrift.

Bitte reichen Sie Ihre Bewerbung bis zum angegebenen Datum ein, unter Angabe der Referenznummer 28362.