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Für Unternehmen Auf einen Blick
- Aufgaben: Leite die Entwicklung einer innovativen Plattform zur Einzelzell-Bildanalyse in der Infektionsbiologie.
- Arbeitgeber: Führende Forschungsabteilung an der Universität Basel mit interdisziplinärem Team.
- Mitarbeitervorteile: Zugang zu umfangreichen Daten, internationale Forschung, wettbewerbsfähiges Gehalt und Lebensqualität in der Schweiz.
- Warum dieser Job: Gestalte die Zukunft der Antibiotika-Forschung und entwickle neue Therapien für Patienten.
- Gewünschte Qualifikationen: Doktorat in Computer Vision oder verwandten Disziplinen, Erfahrung in Bildanalyse und Deep Learning.
- Andere Informationen: Möglichkeiten zur Co-Betreuung von Doktoranden und aktive Unterstützung bei Forschungsanträgen.
Das voraussichtliche Gehalt liegt zwischen 60000 - 80000 € pro Jahr.
Die Abteilung für Biomedizin ist eine gemeinsame Initiative der Universität Basel und der Universitätskliniken Basel. Sie vereint Grundlagen- und klinische Wissenschaftler, um unser Verständnis von Gesundheit und Krankheit zu verbessern und bahnbrechende Therapien zu entwickeln, die das Leben von Patienten in Bereichen mit ungedecktem Bedarf verbessern. Mit mehr als 70 Forschungsgruppen und 800 Mitarbeitern ist die Abteilung für Biomedizin die größte Abteilung an der Universität. Wir befinden uns im Herzen von Basel an 6 verschiedenen Standorten. Seien Sie Teil unserer Zukunft!
Antibiotika-Tests werden nach wie vor durch Messungen der Hemmung des Zellwachstums definiert. Wir zielen darauf ab, dieses Paradigma zu ersetzen, indem wir die Wirkung von Antibiotika auf Einzelzellebene quantifizieren.
Das wissenschaftliche Ziel: Unser Labor hat eine großangelegte Live-Cell-Imaging-Plattform etabliert, die Hunderte von Millionen einzelner Bakterien während der Antibiotika-Exposition verfolgt (Nature Microbiology, 2026). Diese Plattform ermöglicht systematische Bewertungen von Zehntausenden experimenteller Bedingungen über bakterielle Arten, klinische Stämme und verschiedene Arzneimittelbehandlungen hinweg. Diese Experimente erfassen die Antibiotika-Aktivität in Echtzeit auf der Ebene einzelner Zellen. Dennoch bleibt ein Großteil der biologischen Informationen, die in diesen Daten eingebettet sind, unerforscht. Der nächste Schritt besteht darin, diese Zeitraumbilder in genaue Einzelzelltrajektorien umzuwandeln und anschließend in Modelle der Antibiotika-Reaktionen, die direkte Relevanz für die Arzneimittelentwicklung und die Patientenbehandlung haben.
Wir (boecklab.com) suchen einen Wissenschaftler, der das rechnerische Rückgrat dieses Programms definieren wird.
Ihre Position: Der erfolgreiche Kandidat wird die rechnerische Einzelzell-Imaging-Plattform leiten. Dies umfasst das Entwerfen robuster Segmentierungs- und Verfolgungspipelines, die Entwicklung von Klassifikatoren für Wachstum und Lebensfähigkeit sowie die Etablierung skalierbarer Rahmenbedingungen über verschiedene bakterielle Arten hinweg. Die Rolle beinhaltet auch die Identifizierung dynamischer Phänotypen, die Definition von Beschreibungen der Antibiotika-Reaktion und die Integration dieser Messungen in Modelle. Der Kandidat wird Doktoranden co-betreuen, zu Förderanträgen beitragen und technische Führungsarbeit im rechnerischen Teil innerhalb eines hochgradig interdisziplinären Forschungsumfelds leisten.
Ihr Profil: PhD in Computer Vision, Computational Biology, Physik oder einem verwandten Fachgebiet. Nachgewiesene Expertise in der Bildanalyse und der Arbeit mit großangelegten Bilddatensätzen. Starke Expertise im Deep Learning (Segmentierung und Architektur von Grundmodellen). Nachgewiesene Fähigkeit, technische Projekte zu entwerfen und durchzuführen. Wissenschaftliche Unabhängigkeit mit klarem Interesse an biologischen Mechanismen und klinischer Übersetzung. Kooperativer Geist mit Begeisterung für Mentoring und Lehre von Nachwuchswissenschaftlern. Fließend in Englisch.
Wir bieten Ihnen: Zugang zu mehreren hundert Terabyte an Bilddaten und starker rechnerischer Infrastruktur. Intellektuelles Eigentum an der rechnerischen Pipeline mit der Möglichkeit, ihre wissenschaftliche Richtung zu gestalten. Co-Betreuung von Doktoranden und Co-Autorenschaft, wo dies angemessen ist. Direkte translationale Integration durch Arzneimittelentwicklung und klinische Forschungskooperationen. Aktive Unterstützung für das Projekt, Förderanträge und Entwicklung eines unabhängigen wissenschaftlichen Profils. Ein internationales, englischsprachiges, hochmodernes Forschungsumfeld. Wettbewerbsfähiges Gehalt und hohe Lebensqualität in der Schweiz.
Bewerbung / Kontakt: Bitte nutzen Sie den untenstehenden Link, um sich zu bewerben und die folgenden Dokumente einzureichen: CV (mit Publikationsliste), Anschreiben, das vergangene Erfolge und Forschungsinteressen zusammenfasst (max. 1 Seite), Kontaktdaten von mindestens zwei Referenzen. Für informelle Anfragen wenden Sie sich bitte an Dr. Lucas Boeck.
Postdoctoral fellow (project leader) Computational image science in infection biology Arbeitgeber: University of Basel
Kontaktperson:
University of Basel HR Team
StudySmarter Bewerbungstipps 🤫
So bekommst du den Job: Postdoctoral fellow (project leader) Computational image science in infection biology
✨Tipp Nummer 1
Sei proaktiv! Nutze Networking-Events oder Konferenzen, um direkt mit Leuten aus der Branche ins Gespräch zu kommen. Oft sind persönliche Kontakte der Schlüssel, um einen Fuß in die Tür zu bekommen.
✨Tipp Nummer 2
Bereite dich gut auf Vorstellungsgespräche vor! Informiere dich über die neuesten Entwicklungen in der Bildwissenschaft und den spezifischen Projekten des Instituts. Zeige, dass du nicht nur die Anforderungen erfüllst, sondern auch leidenschaftlich an der Forschung interessiert bist.
✨Tipp Nummer 3
Nutze unsere Website für deine Bewerbung! Dort findest du nicht nur die aktuellen Stellenangebote, sondern auch wertvolle Informationen über unser Team und unsere Projekte. Das zeigt dein Interesse und Engagement.
✨Tipp Nummer 4
Sei bereit, Fragen zu stellen! Im Gespräch kannst du zeigen, dass du wirklich an der Position interessiert bist. Frag nach den Herausforderungen, die das Team aktuell hat, oder wie deine Rolle zur Weiterentwicklung der Projekte beitragen kann.
Diese Fähigkeiten machen dich zur top Bewerber*in für die Stelle: Postdoctoral fellow (project leader) Computational image science in infection biology
Tipps für deine Bewerbung 🫡
Mach deinen Lebenslauf einzigartig!: Dein Lebenslauf sollte nicht nur deine Erfahrungen auflisten, sondern auch zeigen, was dich besonders macht. Hebe relevante Projekte und Erfolge hervor, die zu der Position passen, für die du dich bewirbst. Lass uns sehen, was du drauf hast!
Das Anschreiben ist dein Auftritt!: Nutze das Anschreiben, um deine Leidenschaft für die Forschung und deine Motivation für die Stelle zu zeigen. Erzähl uns von deinen bisherigen Erfahrungen und wie sie dich auf diese Rolle vorbereitet haben. Sei authentisch und zeig, warum du perfekt ins Team passt!
Referenzen sind Gold wert!: Vergiss nicht, Kontaktinformationen für mindestens zwei Referenzen anzugeben. Wähle Personen aus, die deine Fähigkeiten und deinen Arbeitsstil gut kennen. Das gibt uns einen zusätzlichen Einblick in deine Qualifikationen und deinen Charakter.
Bewirb dich über unsere Website!: Um sicherzustellen, dass deine Bewerbung direkt bei uns landet, nutze bitte den Link auf unserer Website. So können wir deine Unterlagen schnell und effizient bearbeiten. Wir freuen uns darauf, von dir zu hören!
Wie du dich auf ein Vorstellungsgespräch bei University of Basel vorbereitest
✨Verstehe die Forschungsziele
Mach dich mit den spezifischen Zielen des Projekts vertraut, insbesondere mit der quantitativen Analyse von Antibiotika auf Einzelzellebene. Zeige im Interview, dass du die wissenschaftlichen Herausforderungen und Möglichkeiten verstehst und wie deine Fähigkeiten dazu beitragen können.
✨Bereite technische Beispiele vor
Sei bereit, konkrete Beispiele deiner bisherigen Arbeiten in der Bildanalyse und im Umgang mit großen Datensätzen zu präsentieren. Erkläre, wie du Deep Learning-Modelle entwickelt hast und welche Ergebnisse du erzielt hast, um deine Expertise zu untermauern.
✨Zeige deine Teamfähigkeit
Da die Rolle auch das Co-Management von Doktoranden umfasst, ist es wichtig, deine Fähigkeit zur Zusammenarbeit und zum Mentoring zu betonen. Bereite einige Beispiele vor, in denen du erfolgreich im Team gearbeitet oder andere unterstützt hast.
✨Frage nach der Zukunft des Projekts
Stelle Fragen zur langfristigen Vision des Projekts und wie deine Rolle dazu beitragen kann. Dies zeigt dein Interesse an der Position und deine Bereitschaft, aktiv zur Weiterentwicklung des Projekts beizutragen.