Bioinformatics Software Engineer

Vollzeit | Mainz

Vollzeit 70-85.000 Euro

Sind Sie leidenschaftlich daran interessiert, innovative Softwarelösungen im Bereich der computergestützten Medizin zu entwickeln? Wir suchen einen erfahrenen Bioinformatik-Softwareingenieur, der unserem dynamischen Team beitritt. Diese Rolle bietet die Möglichkeit, mit multidisziplinären Experten zusammenzuarbeiten und zur innovativen Immuntherapieforschung beizutragen, die darauf abzielt, Krebs und andere Krankheiten zu bekämpfen.

Ihre Rolle:

• Entwicklung und Wartung von Softwaretools und reproduzierbaren End-to-End-Workflows zur Analyse komplexer biologischer Datensätze, einschließlich Hochdurchsatz-Sequenzierungsdaten.
• Enge Zusammenarbeit mit Wissenschaftlern, Ingenieuren und Technikern zur Gestaltung und Implementierung von rechnergestützten Analysepipelines für Forschungsdaten.
• Benchmarking und systematische Tests sowohl interner als auch öffentlicher Erkennungspipelines unter Verwendung experimenteller Validierungsdaten.
• Bereitstellung von Anleitung und Unterstützung für Doktoranden, Ingenieure und Forscher in bewährten Verfahren für reproduzierbare Datenwissenschaft und Workflows für Hochleistungsrechnen.
• Beitrag zur Entwicklung fortschrittlicher KI-gesteuerter prädiktiver Modelle für Immunogenomik in Zusammenarbeit mit computergestützten Wissenschaftlern.

Was Sie mitbringen:

• Ein Master-Abschluss in Bioinformatik, Informatik oder einem verwandten Bereich.
• Mindestens zwei Jahre Erfahrung in der Softwareentwicklung, wissenschaftlichem Rechnen oder einem ähnlichen Bereich.
• Starke Programmierkenntnisse in Python; Erfahrung mit zusätzlichen Sprachen wie R, Java oder Rust ist von Vorteil.
• Erfahrung mit Workflow-Managern wie Snakemake und Nextflow.
• Kenntnisse in Big-Data-Verarbeitungstools (Dask, Spark, Arrow) und Bibliotheken für maschinelles Lernen (Scikit-learn, TensorFlow, PyTorch).
• Vertrautheit mit strukturierten Prinzipien der Softwareentwicklung, einschließlich Versionskontrolle, Testen und kontinuierlicher Integration.
• Praktische Erfahrung mit Linux-basierten Rechenumgebungen, Job-Schedulern und Workflow-Management-Tools.
• Frühere Erfahrungen mit Daten der nächsten Generation Sequenzierung (NGS) sind von Vorteil.
• Eine proaktive, teamorientierte Denkweise und Begeisterung für innovative Forschung.

Was wir bieten:

• Ein dynamisches und innovatives Forschungsumfeld.
• Eine kollaborative und unterstützende Arbeitsplatzkultur.
• Ein diverses und inklusives Team mit flachen Hierarchien.
• Wettbewerbsfähiges Gehalt und Leistungspaket.
• Berufliche Entwicklungsmöglichkeiten, die auf Ihr Karrierewachstum zugeschnitten sind.
• Exzellente öffentliche Verkehrsanbindungen, Parkplätze und sichere Fahrradabstellmöglichkeiten.
• Flexible hybride Arbeitsoptionen.

Werden Sie Teil unseres Teams und stehen Sie an der Spitze der translationale Forschung! Wenn Sie bereit sind, einen Unterschied zu machen, würden wir uns freuen, von Ihnen zu hören.