Auf einen Blick
- Aufgaben: Développer des méthodes innovantes en génomique et IA pour améliorer les cultures.
- Unternehmen: Institut SIB de Bioinformatique, un environnement de recherche collaboratif en Suisse.
- Vorteile: Accès à des données génomiques, collaborations internationales et flexibilité dans le projet.
- Weitere Informationen: Engagement pour la diversité et l'égalité des chances sur le lieu de travail.
- Warum dieser Job: Contribuez à des projets de pointe et faites une réelle différence dans l'agriculture.
- Qualifikationen: Doctorat en biologie computationnelle ou domaine connexe, compétences en programmation requises.
Das prognostizierte Gehalt liegt zwischen 45000 - 65000 € pro Jahr.
L'Institut SIB de Bioinformatique en Suisse recrute un chercheur. Chercheur scientifique en génomique comparative, structure des protéines et IA pour l'amélioration des cultures.
Responsabilités
- Développer des méthodes pour améliorer la reconstruction d'orthologie et l'inférence des HOG chez les plantes.
- Intégrer l'information sur la structure des protéines dans le flux de travail d'inférence d'orthologie OMA, afin d'améliorer la détection d'homologie profonde et de raffiner les HOG.
- Réaliser des inférences d'orthologie à grande échelle et des évaluations sur des jeux de données végétaux, y compris la collecte de génomes, le contrôle qualité, l'inférence d'arbres d'espèces et la reconstruction des HOG basée sur FastOMA.
- Construire ou assembler des jeux de données de référence de familles de gènes végétaux annotées, incluant des cas avec duplications et un large échantillonnage taxonomique.
- Évaluer les améliorations méthodologiques en utilisant des jeux de données de familles de gènes annotées et des métriques de référence à grande échelle sans référence, telles que la complétude des HOG, la taille du répertoire génétique ancestral, les schémas de duplication et la cohérence entre niveaux taxonomiques.
- Explorer l'utilisation de l'apprentissage automatique pour combiner séquence, structure, synténie et information phylogénétique afin d'améliorer l'inférence d'homologie et d'orthologie.
- Développer des logiciels et des flux de travail réutilisables et open source, mis à disposition via les dépôts GitHub du groupe.
- Préparer les résultats pour publication dans des revues scientifiques à comité de lecture.
- Contribuer au consortium Comparative QTLomics, visant à améliorer la priorisation des gènes candidats.
Profil requis
- Doctorat en biologie computationnelle, bioinformatique, génomique évolutive, bioinformatique structurale, informatique ou domaine connexe.
- Solides compétences en programmation, de préférence en Python.
- Expérience de travail sous Linux et dans des environnements HPC.
- Expérience avec des flux de travail computationnels reproductibles et des jeux de données biologiques à grande échelle.
- Fort intérêt pour le développement de méthodes en génomique comparative, biologie évolutive ou intégration de données biologiques.
- Expertise dans un ou plusieurs des domaines suivants : génomique comparative ou évolutive, inférence d'orthologie ou reconstruction de familles de gènes, bioinformatique structurale ou analyse de la structure des protéines, analyse de synténie ou évolution du génome, phylogénétique ou phylogénomique, apprentissage automatique ou IA appliquée aux données biologiques.
- Expérience préalable en biologie végétale souhaitée mais pas obligatoire.
Ce que nous offrons
- Environnement de recherche interdisciplinaire et collaboratif au SIB et à l'UNIL.
- Possibilité de développer de nouvelles méthodes en génomique comparative, inférence d'orthologie et intégration de données biologiques assistée par IA.
- Accès à des jeux de données génomiques, phylogénomiques et de structures protéiques à grande échelle.
- Opportunités de collaboration avec UniProt et des groupes internationaux de génomique végétale.
- Possibilités de collaborations internationales et d'échanges de recherche.
- Projet flexible avec marge pour développement méthodologique indépendant.
Le SIB s'engage à assurer et promouvoir la diversité et l'égalité des chances sur le lieu de travail ainsi que dans l'écosystème scientifique.
Research Scientist in computational comparative genomics, protein structure, and AI for crop im[...] Arbeitgeber: jobup
L'Institut SIB de Bioinformatique en Suisse est un employeur exceptionnel, offrant un environnement de recherche interdisciplinaire et collaboratif qui favorise l'innovation dans le domaine de la génomique comparative et de l'intelligence artificielle. Les chercheurs bénéficient d'opportunités uniques de développement professionnel, d'accès à des jeux de données à grande échelle et de collaborations internationales enrichissantes, tout en travaillant dans un cadre qui valorise la diversité et l'égalité des chances.
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✨Nutz die Wissenschafts-Community!
In der Biologie gibt es tolle Labor- und Forschungsnetzwerke. Schau dir Plattformen wie ResearchGate oder LinkedIn-Gruppen für Biologen an, um mit Gleichgesinnten zu vernetzen und über aktuelle Stellenangebote in der Branche informiert zu bleiben.
✨Finde relevante Konferenzen und Events
Besuche branchenspezifische Konferenzen oder Workshops, um Kontakte zu knüpfen und potenzielle Arbeitgeber direkt zu treffen. Das ist eine super Möglichkeit, um in die Branche reinzuschnuppern und dein Netzwerk zu erweitern!
✨Nutze Praktika und Forschungsprojekte
Viele Unternehmen im biologischen Bereich bieten Vollzeitstellen für Leute, die schon Erfahrung durch Praktika oder projektbasierte Arbeiten gesammelt haben. Schau dir deine Uni oder lokale Institute an – die haben oft Kontakte.
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Einige Tipps für deine Bewerbung 🫡
Zeig deine Leidenschaft für Biologie:In deinem Anschreiben solltest du deutlich machen, warum du dich für Biologie begeisterst und welche Aspekte dir besonders am Herzen liegen. Erzähl uns von Projekten oder Studienrichtungen, die dich geprägt haben – das gibt deiner Bewerbung eine persönliche Note!
Füge relevante Forschung oder Praktika hinzu:Für eine Vollzeitstelle in der Biologie ist es wichtig, dass du relevante Erfahrungen in Forschung oder Praktika auflistest. Vergiss nicht, spezifische Techniken oder Methoden zu erwähnen, die du beherrschst. Das zeigt uns, dass du die praktische Seite der Biologie wirklich verstehst!
Tabellarischer Lebenslauf – klar und prägnant:Achte darauf, dass dein Lebenslauf übersichtlich und gut strukturiert ist. Listen punktuell deine Erfahrungen, Ausbildungen und relevanten Fähigkeiten auf. Verwende dabei klassische Kategorien, die für die Biologie relevant sind, wie z.B. Laborkenntnisse oder spezifische Software, die du genutzt hast.
Überzeuge mit relevanten Zertifikaten:Falls du zusätzliche Zertifikate oder Kurse im Bereich Biologie oder verwandten Fächern hast, erwähne diese unbedingt! Das kann deinen Lebenslauf aufwerten und zeigt uns, dass du bereit bist, ständig zu lernen und dich weiterzuentwickeln. Bewerb dich direkt über unsere Website – wir freuen uns auf deine Einsendung!
Wie man sich auf ein Vorstellungsgespräch bei jobup vorbereitet
✨Forschungsprojekte im Gepäck
Bereite dich darauf vor, deine Erfahrungen aus bisherigen Forschungsprojekten oder Praktika zu teilen. Zeige konkret, wie du Methoden in Biologie angewendet hast, und sei bereit, über die Ergebnisse zu diskutieren. Das gibt dem Interviewer einen guten Einblick in dein praktisches Wissen.
✨Vertraut mit Labortechniken
In der Biologie sind technische Fähigkeiten entscheidend. Sei bereit, Fragen zu spezifischen Labortechniken wie PCR, Mikroskopie oder Zellkultur zu beantworten. Vielleicht wirst du sogar gebeten, eine praktische Demonstration deiner Fähigkeiten zu machen!
✨Warum möchten wir hier arbeiten?
Da es sich um eine Vollzeitstelle handelt, ist es wichtig, dein langfristiges Interesse an dem spezifischen Bereich der Biologie zu zeigen. Überlege dir genau, warum dich die Forschung oder die Projekte von jobup reizen. Überlege auch, wie du dich da sehen kannst, etwa in einem Jahr oder zwei.
✨Erstelle dein biologisches Portfolio
Falls du schon an relevanten Arbeiten oder Veröffentlichungen beteiligt warst, bringe ein Portfolio mit oder präsentiere deine digitalen Arbeiten. Das kann ein echter Pluspunkt sein, um deine Leidenschaft für Biologie und deine wissenschaftlichen Fähigkeiten zu unterstreichen.
