Doctoral Student in Environmental Bioengineering

100%, Zürich, befristet

Projekt Hintergrund

Bakterielle Konjugation, der kontaktabhängige Transfer von Plasmiden zwischen Zellen, beschleunigt die bakterielle Evolution und ist ein wichtiger Weg für die Verbreitung von Antibiotikaresistenzen in der Umwelt, was wiederum eine globale Gesundheitsbedrohung darstellt. Aquatische Umgebungen sind voller mikroskaliger chemischer Hotspots, wie der nährstoffreichen 'Phycosphäre' um Phytoplankton und sinkende marine Partikel, und chemotaktische Bakterien sind bekannt dafür, dass sie diese Orte schnell finden und sich dort ansammeln. Dieses Projekt wird die Hypothese testen, dass diese Ansammlung die Plasmidverbreitung in der Umwelt verstärkt und zu einem modernen Verständnis der Rolle von Antibiotikaresistenzen in der Natur beiträgt.

Das Projekt zielt darauf ab zu untersuchen, wann, wo und wie stark diese Verstärkung über verschiedene chemische Hotspots, Strömungen und Bakterienstämme wirkt und was dies für die Verbreitung von Antibiotikaresistenzen unter aquatischen Bakterien bedeutet.

Stellenbeschreibung

• Entwurf, Bau und Charakterisierung neuer Instrumente zur Kopplung bestehender Chemotaxis-Assays an kontrollierte Schersysteme. Dies umfasst mechanisches Design, 3D-Druck, Steuerungssysteme und Integration mit einem Fluoreszenzmikroskop.
• Durchführung von Chemotaxis- und Konjugationsexperimenten mit bakteriellen Spendern und Empfängern von Plasmiden sowie einer Reihe von Chemoattractanten, mit der Möglichkeit, fortgeschrittene Techniken wie Durchflusszytometrie und plattengestützte Plasmidtransferquantifizierung zu erlernen und anzuwenden.
• Bildgebung und Verfolgung von fluoreszenzmarkierten Bakterien und chemischen Wolken im Scherfluss sowie Analyse der Daten mit quantitativen Bild- und Datenanalyse-Pipelines.
• Test klinisch relevanter Bakterien und Süßwasserbakterien (z.B. aus Seen), um das Potenzial für chemotaxisgetriebene Verbreitung von Resistenzen in der Umwelt zu bewerten.
• Beitrag von Daten zu mathematischen Modellen der Plasmidverbreitung.

Profil

• Praktische Erfahrung im Prototyping und in der Fertigung, z.B. CAD, 3D-Druck, Maschinenbau (stark bevorzugt).
• Erfahrung mit Steuerungssystemen und Instrumentierung, z.B. Motorsteuerung, Sensoren, Mikrocontroller und Automatisierungs- oder Datenerfassungssoftware (Python, MATLAB, LabVIEW oder ähnlich) (bevorzugt).
• Offenheit, Erfahrung im Mikrobiologielabor zu sammeln: bakterielle Kulturen, sterile Techniken, Plattenleser und Durchflusszytometrie.
• Vertrautheit mit Mikroskopie, Bildanalyse, Fluidmechanik oder Mikrofluidik (von Vorteil, aber nicht notwendig).
• Fließend in Englisch (mündlich und schriftlich), Begeisterung für die Arbeit in einem interdisziplinären und internationalen Team sowie der Antrieb, wissenschaftliche Exzellenz zu verfolgen (erforderlich).

Sie werden von Prof. Roman Stocker und Mitgliedern seines Labors mit umfangreicher Erfahrung in Mikrobiologie, experimentellen Techniken und Umweltprozessen angeleitet. Sie haben die Möglichkeit, in einer modernen, dynamischen Forschungsumgebung zu arbeiten, mit Forschern aus vielen verschiedenen Disziplinen (Ingenieure, Physiker, Mikrobiologen, Ozeanographen, Chemiker, Mathematiker) zu interagieren, technische Erfahrungen in verschiedenen Forschungsansätzen zu sammeln und mit erstklassigen Partnern zusammenzuarbeiten.

Wir bieten

Die ETH Zürich ist ein familienfreundlicher Arbeitgeber mit hervorragenden Arbeitsbedingungen. Sie können sich auf ein spannendes Arbeitsumfeld, kulturelle Vielfalt sowie attraktive Angebote und Vorteile freuen.

Wir schätzen Vielfalt und Nachhaltigkeit

Im Einklang mit unseren Werten fördert die ETH Zürich eine inklusive Kultur. Wir setzen uns für Chancengleichheit ein, schätzen Vielfalt und pflegen ein Arbeits- und Lernumfeld, in dem die Rechte und Würde aller Mitarbeiter und Studierenden respektiert werden. Besuchen Sie unsere Website zu Chancengleichheit und Vielfalt, um zu erfahren, wie wir ein faires und offenes Umfeld gewährleisten, das es jedem ermöglicht, zu wachsen und zu gedeihen. Nachhaltigkeit ist ein Kernwert für uns – wir arbeiten konsequent auf eine klimaneutrale Zukunft hin.

Neugierig? So sind wir auch.

Über die ETH Zürich

Die ETH Zürich ist eine der weltweit führenden Universitäten, die sich auf Wissenschaft und Technologie spezialisiert hat. Wir sind bekannt für unsere hervorragende Ausbildung, bahnbrechende Grundlagenforschung und den direkten Transfer neuen Wissens in die Gesellschaft. Über 30.000 Menschen aus mehr als 120 Ländern empfinden unsere Universität als einen Ort, der unabhängiges Denken fördert und ein Umfeld schafft, das Exzellenz inspiriert. Im Herzen Europas gelegen, aber mit Verbindungen in die ganze Welt, arbeiten wir gemeinsam daran, Lösungen für die globalen Herausforderungen von heute und morgen zu entwickeln.